Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479543
• Subject: NM_009601.4
• Aligned Length: 1511
• Identities: 1294
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGACCCCAGGGGCTCTGCTGATGCTGCTGGGGGCGCTGGGGGCGCCGCTCGCCCCAGGCGTCCGCGGCTCGGA  74
            |||.||..||||||.|||||..||||.||.||||..||.|||.||||.|||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCCTTAGGGGCGCTGCTTCTGCTTCTAGGGGTACTCGGGACGCCCCTCGCCCCAGGCGCCCGCGGGTCGGA  74

Query   75  GGCGGAGGGTCGACTCCGGG----AGAAACTTTTCTCTGGCTATGATAGCTCCGTGCGGCCAGCGCGGGAGGTG  144
            .||.||.||.|.|||    |    |||||||||||||...||||||||||||.|||.||||.||||||||||||
Sbjct   75  AGCCGAAGGCCAACT----GATTAAGAAACTTTTCTCCAACTATGATAGCTCGGTGAGGCCGGCGCGGGAGGTG  144

Query  145  GGAGACCGTGTCAGGGTCAGCGTTGGTCTCATCCTGGCGCAACTCATCAGCCTGAACGAGAAGGATGAAGAGAT  218
            ||||||||.|||.||||||||.|.||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  145  GGAGACCGCGTCGGGGTCAGCATCGGCCTCACCCTGGCGCAACTCATCAGCCTGAACGAGAAGGATGAAGAAAT  218

Query  219  GAGCACAAAGGTGTACTTAGACCTGGAGTGGACTGACTACAGGCTGAGCTGGGACCCTGCGGAGCACGACGGCA  292
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.||.||.||.||.||||
Sbjct  219  GAGCACAAAGGTGTACTTAGACCTGGAGTGGACCGACTACAGGTTAAGCTGGGACCCCGCAGAACATGATGGCA  292

Query  293  TCGATTCGCTCCGCATCACGGCGGAATCCGTGTGGCTCCCTGACGTGGTGCTACTGAACAACAATGATGGGAAT  366
            |||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct  293  TCGATTCTCTCCGCATCACTGCTGAATCCGTTTGGCTCCCTGATGTGGTGCTGCTGAACAACAATGACGGAAAT  366

Query  367  TTTGACGTGGCTCTGGACATTAGCGTCGTGGTGTCCTCCGACGGCTCCGTGCGTTGGCAACCCCCGGGCATCTA  440
            ||.|||||.||.||||||||.|..||.|||||.||.|.|||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|.||
Sbjct  367  TTCGACGTTGCCCTGGACATCAATGTTGTGGTATCTTTCGAGGGCTCTGTGCGCTGGCAACCCCCTGGCCTGTA  440

Query  441  TCGCAGCAGCTGCAGCATCCAGGTCACCTACTTCCCCTTCGACTGGCAGAATTGCACTATGGTGTTCAGCTCCT  514
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct  441  CCGCAGCAGCTGCAGCATCCAGGTCACCTACTTCCCCTTTGACTGGCAGAACTGCACCATGGTGTTTAGTTCCT  514

Query  515  ACAGCTACGACAGCTCGGAGGTCAGCCTGCAGACAGGCCTGGGTCCTGACG----GGCAAGGGCATCAGGAAAT  584
            |||||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||||.||||||.|    ||..|||    ||||||.|
Sbjct  515  ACAGCTATGACAGCTCTGAGGTCAGCCTGAAGACGGGCCTGGATCCTGAAGGAGAGGAGAGG----CAGGAAGT  584

Query  585  CCACATTCATGAAGGGACTTTCATTGAGAATGGCCAGTGGGAGATTATCCACAAGCCCTCTCGGCTAATCCAGC  658
            |.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.||.|||||||.|
Sbjct  585  CTACATTCATGAAGGGACCTTCATTGAGAATGGCCAATGGGAGATTATCCACAAACCTTCTAGGTTAATCCAAC  658

Query  659  CTCCAGGCGATCCTAGGGGAGGGAGGGAAGGACAGCGCCAGGAAGTCATCTTCTACCTCATCATCCGCCGCAAG  732
            .||||||.||||..||.||.||||.||||||.||.|...|||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct  659  TTCCAGGGGATCAGAGAGGTGGGAAGGAAGGGCATCATGAGGAAGTTATCTTCTATCTCATTATTCGGCGGAAG  732

Query  733  CCTCTCTTCTACCTGGTCAACGTCATTGCCCCATGCATCCTCATCACTCTTCTGGCCATCTTCGTCTTCTACCT  806
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  733  CCTCTCTTCTACCTGGTCAACGTCATTGCCCCATGCATCCTCATCACGCTCCTGGCCATCTTTGTCTTCTACCT  806

Query  807  GCCACCAGATGCAGGAGAGAAGATGGGGCTCTCAATCTTTGCCCTGCTGACCCTTACTGTGTTCCTGCTGCTGC  880
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||.
Sbjct  807  CCCACCAGATGCAGGAGAGAAGATGGGGCTCTCCATCTTTGCCCTGCTGACGCTCACTGTGTTCTTGCTGCTGT  880

Query  881  TGGCTGACAAAGTACCTGAGACCTCACTATCAGTACCCATTATTATCAAGTACCTCATGTTTACCATGGTCCTC  954
            ||||.||||||||.|||||||||||.||..|.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  881  TGGCCGACAAAGTGCCTGAGACCTCCCTGGCGGTGCCCATCATTATCAAGTACCTCATGTTTACCATGGTCCTT  954

Query  955  GTCACCTTCTCAGTCATCCTTAGTGTCGTGGTTCTCAACCTGCACCACCGCTCACCCCACACCCACCAAATGCC  1028
            |||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  GTCACCTTCTCCGTTATCCTTAGTGTTGTGGTCCTCAACCTGCATCATCGCTCACCCCACACCCACCAAATGCC  1028

Query 1029  CCTTTGGGTCCGTCAGATCTTCATTCACAAACTTCCGCTGTACCTGCGTCTAAAAAGGCCCAAACCCGAGAGAG  1102
            |.||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|..||||||.||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1029  CTTTTGGGTCCGCCAGATCTTCATTCACAAGCTCCCTCCATACCTGGGTCTGAAGAGGCCCAAACCCGAGAGAG  1102

Query 1103  ACCTGATGCCGGAGCCCCCTCACTGTTCTTCTCCAGGAAGTGGCTGGGGTCGGGGAACAGATGAATATTTCATC  1176
            |||...|.||.||.||.|.|||||.|..|||||||.|||||||||||||..|.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1103  ACCAACTCCCTGAACCACATCACTCTCTTTCTCCAAGAAGTGGCTGGGGCAGAGGAACTGATGAATATTTCATC  1176

Query 1177  CGGAAGCCGCCAAGTGATTTTCTCTTCCCCAAACCCAATAGGTTCCAGCCTGAACTGTCTGCCCCTGATCTGCG  1250
            ||||||||.||||||||||||||.|||||.||||..||.|||||.|||||||||...||||||||.||.|||||
Sbjct 1177  CGGAAGCCTCCAAGTGATTTTCTTTTCCCTAAACTTAACAGGTTTCAGCCTGAATCATCTGCCCCGGACCTGCG  1250

Query 1251  GCGATTTATCGATGGTCCAAACCGGGCTGTGGCCCTGCTTCCGGAGCTACGGGAGGTCGTCTCCTCTATCAGCT  1324
            .|||||||||||||||||||.|||||||||.|..||||.||.|||||||||.||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 1251  ACGATTTATCGATGGTCCAACCCGGGCTGTAGGTCTGCCTCAGGAGCTACGAGAGGTCATTTCCTCAATCAGCT  1324

Query 1325  ACATCGCTCGACAGCTGCAGGAACAGGAGGACCACGATGCGCTGAAGGAGGACTGGCAGTTTGTGGCCATGGTA  1398
            ||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1325  ACATGGCCCGACAGCTTCAGGAACAGGAGGACCACGACGCACTGAAGGAGGACTGGCAGTTTGTGGCCATGGTT  1398

Query 1399  GTGGACCGCCTCTTCCTGTGGACTTTCATCATCTTCACCAGCGTTGGGACCCTAGTCATCTTCCTGGACGCCAC  1472
            ||||||||.||.||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1399  GTGGACCGTCTTTTTCTGTGGACATTCATCGTTTTCACAAGCGTCGGGACCCTAGTCATTTTCCTAGATGCCAC  1472

Query 1473  GTACCACTTGCCCCCTCCAGACCCCTTTCCT  1503
            ||||||.|||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 1473  GTACCATTTGCCCCCTCCTGAACCTTTCCCT  1503