Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479543
• Subject: XM_006532003.2
• Aligned Length: 1511
• Identities: 1250
• Gaps: 61

Alignment

Query    1  ATGACCCCAGGGGCTCTGCTGATGCTGCTGGGGGCGCTGGGGGCGCCGCTCGCCCCAGGCGTCCGCGGCTCGGA  74
            |||.||..||||||.|||||..||||.||.||||..||.|||.||||.|||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCCTTAGGGGCGCTGCTTCTGCTTCTAGGGGTACTCGGGACGCCCCTCGCCCCAGGCGCCCGCGGGTCGGA  74

Query   75  GGCGGAGGGTCGACTCCGGG----AGAAACTTTTCTCTGGCTATGATAGCTCCGTGCGGCCAGCGCGGGAGGTG  144
            .||.||.||.|.|||    |    |||||||||||||...||||||||||||.|||.||||.||||||||||||
Sbjct   75  AGCCGAAGGCCAACT----GATTAAGAAACTTTTCTCCAACTATGATAGCTCGGTGAGGCCGGCGCGGGAGGTG  144

Query  145  GGAGACCGTGTCAGGGTCAGCGTTGGTCTCATCCTGGCGCAACTCATCAGCCTGAACGAGAAGGATGAAGAGAT  218
            ||||||||.|||.||||||||.|.||.||||.||||||||||||||||||                        
Sbjct  145  GGAGACCGCGTCGGGGTCAGCATCGGCCTCACCCTGGCGCAACTCATCAG------------------------  194

Query  219  GAGCACAAAGGTGTACTTAGACCTGGAGTGGACTGACTACAGGCTGAGCTGGGACCCTGCGGAGCACGACGGCA  292
                                 ||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.||.||.||.||.||||
Sbjct  195  ---------------------CCTGGAGTGGACCGACTACAGGTTAAGCTGGGACCCCGCAGAACATGATGGCA  247

Query  293  TCGATTCGCTCCGCATCACGGCGGAATCCGTGTGGCTCCCTGACGTGGTGCTACTGAACAACAATGATGGGAAT  366
            |||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct  248  TCGATTCTCTCCGCATCACTGCTGAATCCGTTTGGCTCCCTGATGTGGTGCTGCTGAACAACAATGACGGAAAT  321

Query  367  TTTGACGTGGCTCTGGACATTAGCGTCGTGGTGTCCTCCGACGGCTCCGTGCGTTGGCAACCCCCGGGCATCTA  440
            ||.|||||.||.||||||||.|..||.|||||.||.|.|||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|.||
Sbjct  322  TTCGACGTTGCCCTGGACATCAATGTTGTGGTATCTTTCGAGGGCTCTGTGCGCTGGCAACCCCCTGGCCTGTA  395

Query  441  TCGCAGCAGCTGCAGCATCCAGGTCACCTACTTCCCCTTCGACTGGCAGAATTGCACTATGGTGTTCAGCTCCT  514
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct  396  CCGCAGCAGCTGCAGCATCCAGGTCACCTACTTCCCCTTTGACTGGCAGAACTGCACCATGGTGTTTAGTTCCT  469

Query  515  ACAGCTACGACAGCTCGGAGGTCAGCCTGCAGACAGGCCTGGGTCCTGACG----GGCAAGGGCATCAGGAAAT  584
            |||||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||||.||||||.|    ||..|||    ||||||.|
Sbjct  470  ACAGCTATGACAGCTCTGAGGTCAGCCTGAAGACGGGCCTGGATCCTGAAGGAGAGGAGAGG----CAGGAAGT  539

Query  585  CCACATTCATGAAGGGACTTTCATTGAGAATGGCCAGTGGGAGATTATCCACAAGCCCTCTCGGCTAATCCAGC  658
            |.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.||.|||||||.|
Sbjct  540  CTACATTCATGAAGGGACCTTCATTGAGAATGGCCAATGGGAGATTATCCACAAACCTTCTAGGTTAATCCAAC  613

Query  659  CTCCAGGCGATCCTAGGGGAGGGAGGGAAGGACAGCGCCAGGAAGTCATCTTCTACCTCATCATCCGCCGCAAG  732
            .||||||.||||..||.||.||||.||||||.||.|...|||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct  614  TTCCAGGGGATCAGAGAGGTGGGAAGGAAGGGCATCATGAGGAAGTTATCTTCTATCTCATTATTCGGCGGAAG  687

Query  733  CCTCTCTTCTACCTGGTCAACGTCATTGCCCCATGCATCCTCATCACTCTTCTGGCCATCTTCGTCTTCTACCT  806
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  688  CCTCTCTTCTACCTGGTCAACGTCATTGCCCCATGCATCCTCATCACGCTCCTGGCCATCTTTGTCTTCTACCT  761

Query  807  GCCACCAGATGCAGGAGAGAAGATGGGGCTCTCAATCTTTGCCCTGCTGACCCTTACTGTGTTCCTGCTGCTGC  880
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||.
Sbjct  762  CCCACCAGATGCAGGAGAGAAGATGGGGCTCTCCATCTTTGCCCTGCTGACGCTCACTGTGTTCTTGCTGCTGT  835

Query  881  TGGCTGACAAAGTACCTGAGACCTCACTATCAGTACCCATTATTATCAAGTACCTCATGTTTACCATGGTCCTC  954
            ||||.||||||||.|||||||||||.||..|.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  836  TGGCCGACAAAGTGCCTGAGACCTCCCTGGCGGTGCCCATCATTATCAAGTACCTCATGTTTACCATGGTCCTT  909

Query  955  GTCACCTTCTCAGTCATCCTTAGTGTCGTGGTTCTCAACCTGCACCACCGCTCACCCCACACCCACCAAATGCC  1028
            |||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910  GTCACCTTCTCCGTTATCCTTAGTGTTGTGGTCCTCAACCTGCATCATCGCTCACCCCACACCCACCAAATGCC  983

Query 1029  CCTTTGGGTCCGTCAGATCTTCATTCACAAACTTCCGCTGTACCTGCGTCTAAAAAGGCCCAAACCCGAGAGAG  1102
            |.||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|..||||||.||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  984  CTTTTGGGTCCGCCAGATCTTCATTCACAAGCTCCCTCCATACCTGGGTCTGAAGAGGCCCAAACCCGAGAGAG  1057

Query 1103  ACCTGATGCCGGAGCCCCCTCACTGTTCTTCTCCAGGAAGTGGCTGGGGTCGGGGAACAGATGAATATTTCATC  1176
            |||...|.||.||.||.|.|||||.|..|||||||.|||||||||||||..|.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1058  ACCAACTCCCTGAACCACATCACTCTCTTTCTCCAAGAAGTGGCTGGGGCAGAGGAACTGATGAATATTTCATC  1131

Query 1177  CGGAAGCCGCCAAGTGATTTTCTCTTCCCCAAACCCAATAGGTTCCAGCCTGAACTGTCTGCCCCTGATCTGCG  1250
            ||||||||.||||||||||||||.|||||.||||..||.|||||.|||||||||...||||||||.||.|||||
Sbjct 1132  CGGAAGCCTCCAAGTGATTTTCTTTTCCCTAAACTTAACAGGTTTCAGCCTGAATCATCTGCCCCGGACCTGCG  1205

Query 1251  GCGATTTATCGATGGTCCAAACCGGGCTGTGGCCCTGCTTCCGGAGCTACGGGAGGTCGTCTCCTCTATCAGCT  1324
            .|||||||||||||||||||.|||||||||.|..||||.||.|||||||||.||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 1206  ACGATTTATCGATGGTCCAACCCGGGCTGTAGGTCTGCCTCAGGAGCTACGAGAGGTCATTTCCTCAATCAGCT  1279

Query 1325  ACATCGCTCGACAGCTGCAGGAACAGGAGGACCACGATGCGCTGAAGGAGGACTGGCAGTTTGTGGCCATGGTA  1398
            ||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1280  ACATGGCCCGACAGCTTCAGGAACAGGAGGACCACGACGCACTGAAGGAGGACTGGCAGTTTGTGGCCATGGTT  1353

Query 1399  GTGGACCGCCTCTTCCTGTGGACTTTCATCATCTTCACCAGCGTTGGGACCCTAGTCATCTTCCTGGACGCCAC  1472
            ||||||||.||.||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1354  GTGGACCGTCTTTTTCTGTGGACATTCATCGTTTTCACAAGCGTCGGGACCCTAGTCATTTTCCTAGATGCCAC  1427

Query 1473  GTACCACTTGCCCCCTCCAGACCCCTTTCCT  1503
            ||||||.|||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 1428  GTACCATTTGCCCCCTCCTGAACCTTTCCCT  1458