Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479556
• Subject: NM_001205231.1
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1290
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAACCGGCATCG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|
Sbjct    1  ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAATCGGCACAG  74

Query   75  GAAGCGCAGCCACAGCCGCTCTCGGAGCCGGGACCGCAAACGCCGGAGCCGGAGCCGCGACCGGCGCAACCGGG  148
            ||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCGTAGTCACAGTCGCTCTCGAAGCCGAGATCGAAAGCGCAGGAGCAGGAGCCGAGATCGGCGCAACCGGG  148

Query  149  ACCAGCGGAGCGCCTCCCGGGACAGGCGACGACGCAGCAAACCTTTGACCAGAGGCGCTAAAGAGGAGCACGGT  222
            |||||||.||.|||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCAGCGCAGTGCCTCTCGGGATAGGAGACGACGAAGCAAACCTTTGACCAGAGGCGCTAAAGAGGAGCACGGT  222

Query  223  GGACTGATTCGTTCCCCCCGCCACGAGAAGAAGAAGAAGGTCCGTAAATACTGGGACGTGCCACCCCCAGGCTT  296
            |||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  GGATTGATTCGTTCTCCCCGCCATGAGAAGAAGAAGAAGGTGCGTAAATACTGGGACGTGCCACCGCCTGGCTT  296

Query  297  TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCTCTTCTCCCCA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  297  TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCCCTTCTCCCGA  370

Query  371  CCATGACCCCTGACGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCGGTGCCCGTGGTCGGGAGCCAGATGACCAGACAAGCC  444
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CCATGACTCCTGATGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCAGTGCCTGTGGTTGGGAGCCAGATGACCAGACAGGCC  444

Query  445  CGGCGCCTCTACGTGGGCAACATCCCCTTTGGCATCACTGAGGAGGCCATGATGGATTTCTTCAACGCCCAGAT  518
            .|.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  AGACGTCTCTACGTGGGCAACATCCCTTTTGGCATTACTGAGGAGGCTATGATGGACTTCTTCAACGCCCAGAT  518

Query  519  GCGCCTGGGGGGGCTGACCCAGGCCCCTGGCAACCCAGTGTTGGCTGTGCAGATTAACCAGGACAAGAATTTTG  592
            ||||.||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  519  GCGCTTGGGAGGGTTGACTCAGGCCCCTGGCAACCCAGTCTTGGCTGTGCAGATAAATCAAGACAAGAATTTTG  592

Query  593  CCTTTTTGGAGTTCCGCTCAGTGGACGAGACTACCCAGGCTATGGCCTTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG  666
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTTTTTGGAGTTCCGGTCAGTGGATGAGACGACCCAGGCCATGGCATTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG  666

Query  667  TCACTAAAGATCCGCAGGCCTCACGACTACCAGCCGCTTCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCCGTCTATGTGCC  740
            |||.|.|||||.||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  667  TCATTGAAGATTCGAAGGCCTCATGACTATCAGCCATTGCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCTGTTTATGTGCC  740

Query  741  TGGGGTTGTGTCCACTGTGGTCCCCGACTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGCTTACCCAACTACCTGAACG  814
            |||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  741  TGGAGTTGTATCCACTGTAGTCCCAGATTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGTTTGCCCAATTACCTAAATG  814

Query  815  ATGACCAGGTCAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCCCTCAAGGCCTTCAACCTGGTCAAGGACAGTGCCACG  888
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.
Sbjct  815  ATGACCAGGTAAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCTCTCAAGGCCTTCAACTTGGTTAAGGATAGTGCCACA  888

Query  889  GGGCTCTCCAAGGGCTACGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACGGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGCTCTCCAAGGGCTATGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACAGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA  962

Query  963  CGGCATGCAGCTGGGGGATAAGAAGCTGCTGGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCT-----  1031
            .||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  963  TGGGATGCAGCTAGGGGACAAGAAGCTGCTTGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCTGGTGA  1036

Query 1032  -------GAGCACCATCAATCAGACGCCTGTGACCCTGCAAGTGCCGGGCTTGATGAGCTCCCAGGTGCAGATG  1098
                   ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  GCCTCCCGAGCACCATCAATCAGACACCTGTGACCCTTCAAGTGCCCGGCCTGATGAGCTCTCAGGTGCAGATG  1110

Query 1099  GGCGGCCACCCGACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGACGAGGAGTA  1172
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  GGCGGTCACCCAACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGATGAGGAGTA  1184

Query 1173  TGAGGAGATCGTGGAGGATGTGCGGGACGAGTGCAGCAAGTACGGGCTTGTCAAGTCCATCGAGATCCCCCGGC  1246
            |||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 1185  TGAGGAGATTGTAGAGGACGTACGAGACGAGTGCAGCAAGTATGGGTTGGTCAAATCCATTGAAATTCCCCGCC  1258

Query 1247  CTGTGGACGGCGTCGAGGTGCCCGGCTGCGGAAAGATCTTTGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA  1320
            |.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGTGGACGGCGTCGAGGTGCCTGGCTGTGGAAAGATCTTCGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA  1332

Query 1321  GCCATGCAGGGCCTGACGGGCCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTTGTCACAAAATACTGTGACCCCGACTCTTA  1394
            |||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1333  GCCATGCAGGGTCTAACCGGTCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTGGTCACAAAATACTGTGACCCTGATTCTTA  1406

Query 1395  TCACCGCCGGGACTTCTGG  1413
            .|||||.||||||||||||
Sbjct 1407  CCACCGTCGGGACTTCTGG  1425