Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479564
• Subject: XM_006502472.3
• Aligned Length: 1248
• Identities: 1170
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAGTGGGCATCGATCAACAAGGAAAAGATGTGGAGATTCTCACCCGGAGTCCCCAGTGGGCTTCGGGCATAT  74
            ||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGGGCATCGGTCAACAAGGAAACGATGTGGAGATTCTCACCCAGAGTCCCCTGTGGGCTTTGGGCATAT  74

Query   75  GAGTACTACAGGATGTGTATTAAATAAATTGTTTCAGTTACCAACACCACCATTGTCAAGACACCAACTAAAGC  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||..||||.|
Sbjct   75  GAGTACTACAGGGTGTGTATTAAATAAATTGTTTCAGTTACCGACACCACCACTGTCAAGACACCAGTTAAAAC  148

Query  149  GGCTAGAAGAACACAGATATCAAAGTGCTGGACGGTCCCTGCTTGAGCCCTTAATGCAAGGGTATTGGGAATGG  222
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  149  GGCTAGAAGAACACAGGTATCAGAGTGCTGGACGGTCCCTTCTCGAGCCCTTAATGCAAGGATACTGGGAATGG  222

Query  223  CTCGTTAGAAGAGTTCCCTCCTGGATTGCCCCAAATCTCATCACCATCATTGGACTGTCAATAAACATCTGTAC  296
            ||.|||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  223  CTAGTTGGAAGAGTACCCTCATGGATTGCCCCAAATCTCATCACCATCATTGGACTATCAATAAATATCTGTAC  296

Query  297  AACTATTTTATTAGTCTTCTACTGCCCTACAGCTACAGAGCAGGCACCTCTGTGGGCATATATTGCTTGTGCCT  370
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  AACTATTTTGTTAGTCTTCTACTGCCCTACAGCTACAGAGCAGGCACCTCTGTGGGCTTATATTGCCTGTGCTT  370

Query  371  GTGGCCTTTTCATTTACCAGTCTTTGGATGCTATTGATGGGAAACAGGCAAGAAGAACCAATAGTAGTTCTCCT  444
            |||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  GTGGCCTTTTCATTTACCAGTCTCTGGATGCCATAGATGGGAAACAGGCCAGAAGAACTAACAGTAGCTCTCCT  444

Query  445  CTGGGAGAACTTTTTGATCATGGCTGTGATTCACTATCAACAGTTTTTGTGGTTCTCGGAACTTGTATTGCAGT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGGAGAACTTTTTGATCATGGCTGTGACTCACTATCGACAGTTTTTGTGGTTCTTGGAACTTGTATTGCAGT  518

Query  519  GCAGCTGGGGACAAACCCTGATTGGATGTTTTTTTGTTGTTTTGCGGGGACATTTATGTTCTATTGTGCGCACT  592
            .||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  ACAACTTGGGACAAATCCTGACTGGATGTTTTTTTGTTGTTTTGCTGGGACATTCATGTTCTATTGTGCACACT  592

Query  593  GGCAAACGTATGTTTCTGGAACATTGCGATTTGGAATAATTGATGTGACTGAAGTGCAAATCTTCATAATAATC  666
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCAAACATATGTTTCTGGAACATTGCGATTTGGAATAATTGATGTGACTGAAGTGCAAATCTTCATAATAATC  666

Query  667  ATGCATTTGCTGGCAGTGATTGGAGGACCACCTTTTTGGCAATCTATGATTCCAGTGCTGAATATTCAAATGAA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGCATTTGCTGGCAGTGATTGGAGGACCACCTTTTTGGCAATCTATGATTCCTGTGTTGAATATTCAAATGAA  740

Query  741  AATTTTTCCTGCACTTTGTACTGTAGCAGGGACCATATTTTCCTGTACAAATTACTTCCGTGTAATCTTCACAG  814
            |.||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTTCTTCCTGCACTTTGTACTGTGGCAGGGACCATATTTTCCTGTACAAATTACTTCCGTGTAATCTTCACAG  814

Query  815  GTGGTGTTGGCAAAAATGGATCAACAATAGCAGGAACAAGTGTCCTTTCTCCTTTTCTCCATATTGGATCAGTG  888
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  GTGGTGTTGGCAAAAATGGGTCAACCATAGCAGGAACAAGTGTCCTTTCTCCTTTTCTGCATATTGGATCAGTG  888

Query  889  ATTACATTAGCTGCAATGATCTACAAGAAATCTGCAGTTCAGCTTTTTGAAAAGCATCCCTGTCTTTATATACT  962
            ||.||.|||||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  ATCACGTTAGCTGTTATGATCTACAAGAAATCAGCAGTTCAGCTTTTTGAAAAGCATCCATGTCTTTATATACT  962

Query  963  GACATTTGGTTTTGTGTCTGCTAAAATCACTAATAAGCTTGTGGTTGCACACATGACGAAAAGTGAAATGCATT  1036
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACATTTGGTTTTGTGTCGGCTAAAATCACTAATAAGCTTGTGGTTGCTCACATGACGAAAAGTGAAATGCATT  1036

Query 1037  TGCATGACACAGCATTCATAGGTCCGGCACTTTTGTTTCTGGACCAGTATTTTAACAGCTTTATTGATGAATAT  1110
            |||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  TGCATGACACAGCATTCATAGGTCCAGCACTTCTGTTTCTGGACCAGTATTTTAACAGCTTCATTGATGAATAT  1110

Query 1111  ATTGTACTTTGGATTGCCCTGGTTTTCTCTTTCTTTGATTTGATCCGCTACTGTGTCAGTGTTTGCAATCAGAT  1184
            ||.|||||||||||||||.||.|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATAGTACTTTGGATTGCCTTGATCTTCTCTTTCTTTGATTTGATTCGTTACTGTGTCAGTGTTTGCAATCAGAT  1184

Query 1185  TGCGTCTCACCTGCACATACATGTCTTCAGAATCAAGGTCTCTACAGCTCATTCTAATCATCAT  1248
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|.||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1185  TGCATCTCACCTGCATATACATGTCTTCAGAATTAAAGCCTCTACAGCTCACTCTAATCATCAC  1248