Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479597
• Subject: NM_011952.2
• Aligned Length: 1142
• Identities: 1024
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  AT---GGCGGCGGCGGCGGCTCAGGGGGGCGGGGGCGGGGAGCCCCGTAGAACCGAGGGGGTCGGCCCGGGGGT  71
            ||   |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|..||||.|..|||||||.|||||.|||
Sbjct    1  ATGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCGGGGGGCGGGGGCGGGGAGCCCAGGGGAACTGCTGGGGTCGTCCCGGTGGT  74

Query   72  CCCGGGGGAGGTGGAGATGGTGAAGGGGCAGCCGTTCGACGTGGGCCCGCGCTACACGCAGTTGCAGTACATCG  145
            |||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct   75  CCCCGGGGAGGTGGAGGTGGTGAAGGGGCAGCCATTCGATGTGGGCCCACGCTACACGCAGCTGCAGTACATCG  148

Query  146  GCGAGGGCGCGTACGGCATGGTCAGCTCGGCCTATGACCACGTGCGCAAGACTCGCGTGGCCATCAAGAAGATC  219
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGAGGGCGCGTACGGCATGGTCAGCTCAGCTTATGACCACGTGCGCAAGACCAGAGTGGCCATCAAGAAGATC  222

Query  220  AGCCCCTTCGAACATCAGACCTACTGCCAGCGCACGCTCCGGGAGATCCAGATCCTGCTGCGCTTCCGCCATGA  293
            ||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  223  AGCCCCTTTGAGCATCAAACCTACTGTCAGCGCACGCTGAGGGAGATCCAGATCTTGCTGCGATTCCGCCATGA  296

Query  294  GAATGTCATCGGCATCCGAGACATTCTGCGGGCGTCCACCCTGGAAGCCATGAGAGATGTCTACATTGTGCAGG  367
            ||||||.||.||||||||||||||.||..|.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  297  GAATGTTATAGGCATCCGAGACATCCTCAGAGCGCCCACCCTGGAAGCCATGAGAGATGTTTACATTGTTCAGG  370

Query  368  ACCTGATGGAGACTGACCTGTACAAGTTGCTGAAAAGGCCAGCAGCTGAGCAATGACCATAATCTGCTACTTCC  441
            ||||.||||||||.||||||||||||.||||.|||| |||||||||||||||||||||| .|||||||||||||
Sbjct  371  ACCTCATGGAGACAGACCTGTACAAGCTGCTTAAAA-GCCAGCAGCTGAGCAATGACCA-CATCTGCTACTTCC  442

Query  442  TCTACCAGATCCTGCGGGGCCTCAAGTACATCCACTCCGCCAACGTGCTCCACCGAGATCTAAAGCCCTCCAAC  515
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct  443  TCTACCAGATCCTCCGGGGCCTCAAGTATATACACTCAGCCAATGTGCTGCACCGGGACCTGAAGCCTTCCAAT  516

Query  516  CTGCTCATCAACACCACNTGCGACNTTAAGATTTGTGATTTCGGCCTGGCCCGGATTGCCGATCCTGAGCATGA  589
            |||||.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  517  CTGCTTATCAACACCACCTGCGACCTTAAGATCTGTGATTTTGGCCTGGCCCGGATTGCTGACCCTGAGCACGA  590

Query  590  CCACACCGGCTTCCTGACGGAGTATGTGGCTACGCGCTGGTACCGGGCCCCAGAGATCATGCTGAACTCCAAGG  663
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  591  CCACACTGGCTTTCTGACGGAGTATGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCCCCAGAGATCATGCTTAATTCCAAGG  664

Query  664  GCTATACCAAGTCCATCGACATCTGGTCTGTGGGCTGCATTCTGGCTGAGATGCTCTCTAACCGGCCCATCTTC  737
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  665  GCTACACCAAATCCATCGACATCTGGTCTGTGGGCTGCATTCTGGCTGAGATGCTCTCCAACCGGCCCATCTTC  738

Query  738  CCTGGCAAGCACTACCTGGATCAGCTCAACCACATTCTGGGCATCCTGGGCTCCCCATCCCAGGAGGACCTGAA  811
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  739  CCCGGCAAGCACTACCTGGACCAGCTCAACCACATTCTAGGTATCTTGGGTTCCCCATCCCAGGAGGACCTTAA  812

Query  812  TTGTATCATCAACATGAAGGCCCGAAACTACCTACAGTCTCTGCCCTCCAAGACCAAGGTGGCTTGGGCCAAGC  885
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  TTGCATCATTAACATGAAGGCCCGAAACTACCTGCAGTCTCTGCCCTCGAAAACCAAGGTGGCTTGGGCCAAGC  886

Query  886  TTTTCCCCAAGTCAGACTCCAAAGCCCTTGACCTGCTGGACCGGATGTTAACCTTTAACCCCAATAAACGGATC  959
            |.||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct  887  TCTTTCCTAAATCTGACTCCAAAGCTCTTGACCTGCTGGACCGGATGTTAACCTTCAACCCAAACAAGCGCATC  960

Query  960  ACAGTGGAGGAAGCGCTGGCTCACCCCTACCTGGAGCAGTACTATGACCCGACGGATGAGCCAGTGGCCGAGGA  1033
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  961  ACAGTAGAGGAAGCGCTGGCTCACCCTTACCTGGAACAGTACTACGATCCGACAGATGAGCCAGTGGCCGAGGA  1034

Query 1034  GCCCTTCACCTTCGCCATGGAGCTGGATGACCTACCTAAGGAGCGGCTGAAGGAGCTCATCTTCCAGGAGACAG  1107
            |||.||||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1035  GCCATTCACCTTCGACATGGAGCTGGATGACCTCCCCAAGGAGCGGCTGAAGGAGTTGATCTTCCAGGAGACAG  1108

Query 1108  CACGCTTCCAGCCCGGAGTGCTGGAGGCCCCC  1139
            |.|||||||||||.||.|.||..||||.||||
Sbjct 1109  CCCGCTTCCAGCCAGGGGCGCCAGAGGGCCCC  1140