Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479648
- Subject:
- NM_027289.1
- Aligned Length:
- 1384
- Identities:
- 1054
- Gaps:
- 215
Alignment
Query 1 ATGCGGAGACTGGTGCACGACCTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGTCTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAACGAGATCAGCCTGCGTGACGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTACGACTACACCCTGGACCAGTATGCAGACG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CACTGCACCCCGAGATCTTCAGTACCGCCCGTGACATCCTGATCGAGCACTACAAGAGCCTTCTGATGAAGATT 222
|||||.|||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------------ATGAAAATT 9
Query 223 GACGCCTTCCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGA 296
|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 10 GACGCTTTTCACTATGTACAACTGGGAACGGCCTACAGGGGCCTCAAGCCTGTGCCGGACGATGAAGTGATCGA 83
Query 297 GCTGTATGGGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGC 370
.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||
Sbjct 84 CCTGTACGGCGGCACCCAGCACATCCCACTCTACCAGATGAGCGGCTTCTATGGCAAGGGCCCATCTATCAAGC 157
Query 371 AGTTCATGGACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGC 444
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 158 AGTTCATGGACATCTTCTCGCTCCCAGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACGGC 231
Query 445 CTGGAGTTTGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCAT 518
||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 232 CTGGAGTTTGACCAAGTACATCTCTACAAGGATGTGACGGATGCTATCCGCGATGTGCATGTAAAGGGCCTCAT 305
Query 519 GTACCAGTGGATCGAGCAGGACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCC 592
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 306 GTACCAGTGGATCGAGCAAGACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGAGATGAGACATTTGCGGTGCTGAGCCGCC 379
Query 593 TGGTGGCCCATGGGAAGCAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCAC 666
||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 380 TGGTGGCCCATGGGAAACAGCTGTTCCTCATTACCAACAGTCCCTTCAGCTTTGTGGACAAAGGTATGCGGCAC 453
Query 667 ATGGTGGGTCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGA 740
|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||.||
Sbjct 454 ATGGTAGGTCCCGATTGGCGCCAACTCTTCGACGTCGTCATCGTCCAGGCAGACAAGCCCAACTTTTTCACCGA 527
Query 741 CCGGCGCAAGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGG 814
|.|||||||||||||..|.||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||.|.||.||||
Sbjct 528 CAGGCGCAAGCCTTTTCGCAAGCTTGACGAGAAGGGCTCCCTCCACTGGGACCGTATCACTCGCCTAGAGAAGG 601
Query 815 GCAAGATCTATCGGCAGGGAAACCTGTTTGA-CTTCTTGCGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTA 887
||||||||||||||||||||||||||||||| .||||| ||..|||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 602 GCAAGATCTATCGGCAGGGAAACCTGTTTGATTTTCTT-CGTCTGACGGAATGGCGAGGGCCGCGTGTGCTCTA 674
Query 888 CTTCGGGGACCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCC 961
||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 675 CTTCGGTGACCACCTTTACAGTGACCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACGGGAGCCATCATCC 748
Query 962 CCGAGCTGGAGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAACAGGCGCTC 1035
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 749 CTGAGCTGGAGCGCGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACCTGGCAGCAGGCTCTC 822
Query 1036 ACGGGGCTGCTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGA 1109
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||||||.||||||||||.||
Sbjct 823 ACTGGGCTGCTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGATGCAGAGTCACGGCAGGTGCTGGCTACCTGGATGAAGGA 896
Query 1110 GCGGCAGGAGCTGAGGTGCATCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCAGTTCGGCAGCATCTTCCGCACCTTCCACA 1183
||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 GCGGCAAGAACTGAGATGCATCACAAAGGCCCTATTCAACGCCCAGTTCGGGAGCATCTTCCGCACCTTCCACA 970
Query 1184 ACCCCACCTACTTCTCAAGGCGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCTACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTGCTCAAC 1257
||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 971 ACCCTACCTACTTCTCCCGGCGCCTCGTGCGCTTCTCCGACCTCTACATGGCCTCACTCAGCTGCCTGCTCAAC 1044
Query 1258 TACCGCGTGGACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCT 1331
||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045 TACCGCGTAGACTTCACCTTCTACCCGCGCCGCACACCCCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCT 1118
Query 1332 CTGCACCGGCTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC 1383
.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119 GTGCACTGGCTGCATGAAGACACCCTTTCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC 1170