Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479670
- Subject:
- XM_017321998.1
- Aligned Length:
- 1661
- Identities:
- 1316
- Gaps:
- 142
Alignment
Query 1 ATGGACTTCCTCATCGTCCTGGTCTGCCTCATCTTCAGCGTGCTGTCCACCATCGAGCAGTATGCCGCCCTGGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACGGGGACTCTCTTCTGGATGGAGATCGTGCTGGTGGTGTTCTTCGGGACGGAGTACGTGGTCCGCCTCTGGT 148
||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------ATGGAGATTGTCCTTGTGGTGTTCTTTGGGACAGAATATGTGGTCCGCCTCTGGT 55
Query 149 CCGCCGGCTGCCGCAGCAAGTACGTGGGCCTCTGGGGGCGGCTGCGCTTTGCCCGGAAGCCCATTTCCATCATC 222
|.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 56 CTGCAGGCTGCCGCAGCAAGTACGTGGGCATCTGGGGCCGGCTACGTTTTGCCCGGAAGCCCATTTCCATCATT 129
Query 223 GACCTCATCGTGGTCGTGGCCTCCATGGTGGTCCTCTGCGTGGGCTCCAAGGGGCAGGTGTTTGCCACGTCGGC 296
||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 130 GACCTCATCGTGGTTGTAGCCTCTATGGTTGTCCTCTGCGTGGGTTCCAAAGGACAAGTGTTCGCCACATCAGC 203
Query 297 CATCAGGGGCATCCGCTTCCTGCAGATCCTGAGGATGCTACACGTCGACCGCCAGGGAGGCACCTGGAGGCTCC 370
.||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 204 TATCAGGGGTATCCGCTTCCTTCAGATCCTGCGGATGCTGCATGTCGATCGCCAGGGGGGTACCTGGAGGCTCC 277
Query 371 TGGGCTCCGTGGTCTTCATCCACCGCCAGGAGCTGATAACCACCCTGTACATCGGCTTCCTGGGCCTCATCTTC 444
|||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 278 TGGGCTCTGTAGTCTTCATTCACCGCCAGGAGCTGATCACCACCCTGTACATTGGCTTTCTGGGCCTTATCTTC 351
Query 445 TCCTCGTACTTTGTGTACCTGGCTGAGAAGGACGCGGTGAACGAGTCAGGCCGCGTGGAGTTCGGCAGCTACGC 518
|||||.||||||||.|||.||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||
Sbjct 352 TCCTCCTACTTTGTCTACTTGGCTGAGAAAGATGCGGTGAACGAGTCCGGCCGCATCGAGTTTGGCAGCTACGC 425
Query 519 AGATGCGCTGTGGTGGGGGGTGGTCACAGTCACCACCATCGGCTATGGGGACAAGGTGCCCCAGACGTGGGTCG 592
||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 426 AGATGCTCTGTGGTGGGGGGTGGTCACAGTCACTACCATTGGCTACGGGGATAAGGTACCTCAGACGTGGGTTG 499
Query 593 GGAAGACCATCGCCTCCTGCTTCTCTGTCTTTGCCATCTCCTTCTTTGCGCTCCCAGCGGGGATTCTTGGCTCG 666
|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 500 GGAAGACCATCGCCTCCTGTTTCTCTGTCTTCGCCATATCCTTCTTTGCACTCCCAGCGGGGATACTTGGCTCT 573
Query 667 GGGTTTGCCCTGAAGGTGCAGCAGAAGCAGAGGCAGAAGCACTTCAACCGGCAGATCCCGGCGGCAGCCTCACT 740
|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 574 GGGTTCGCGCTGAAGGTCCAGCAGAAGCAGAGGCAGAAGCACTTCAACCGGCAGATCCCAGCTGCAGCCTCACT 647
Query 741 CATTCAGACCGCATGGAGGTGCTATGCTGCCGAGAACCCCGACTCCTCCACCTGGAAGATCTACATCCGGAAGG 814
|||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||..||||.|||||||||||..||||||||.
Sbjct 648 CATCCAGACTGCATGGAGGTGCTATGCCGCTGAGAACCCTGACTCAGCCACTTGGAAGATCTATGTCCGGAAGC 721
Query 815 CCCCCCGGAGCCACACTCTGCTGTCACCCAGCCCCAAACCCAAGAAGTCTGTGGTGGTAAAGAAAAAAAAGTTC 888
|..|.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||..||||||||||.||.||||||
Sbjct 722 CTGCTCGGAGTCACACGCTTCTGTCCCCCAGCCCCAAACCTAAAAAGTCTGTCATGGTAAAGAAGAAGAAGTTC 795
Query 889 AAGCTGGACAAAGACAATGGGGTGACTCCTGGAGAGAAGATGCTCACAGTCCCCCATATCACGTGCGACCCCCC 962
||||||||.||.||.||||||.|||.||||||||||||||||.|||..||.||.||.|||||.|..||.|||||
Sbjct 796 AAGCTGGATAAGGATAATGGGATGAGTCCTGGAGAGAAGATGTTCAATGTTCCTCACATCACTTATGATCCCCC 869
Query 963 AGAAGAGCGGCGGCTGGACCACTTCTCTGTCGACGGCTATGACAGTTCTGTAAGGAAGAGCCCAACACTGCTGG 1036
|||.||..||.|||..|||||.|||||..|.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 870 AGAGGATAGGAGGCCAGACCATTTCTCCATTGATGGCTATGACAGCTCAGTAAGGAAGAGCCCTACACTGCTGG 943
Query 1037 AAGTGAGCATGCCCCATTTCATGAGAACCAACAGCTTCGCCGAGGACCTGGACCTGGAAGGGGAGACTCTGCTG 1110
||||.||||..|||||||||.|||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 944 AAGTAAGCACACCCCATTTCTTGAGAACAAACAGCTTTGCAGAGGACCTGGACCTGGAAGGGGAGACACTGCTG 1017
Query 1111 ACACCCATCACCCACATCTCACAGCTGCGGGAACACCATCGGGCCACCATTAAGGTCATTCGACGCATGCAGTA 1184
||.|||||||||||..|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||
Sbjct 1018 ACCCCCATCACCCATGTGTCACAGCTGCGGGATCACCATCGGGCCACCATCAAGGTCATCAGGCGCATGCAGTA 1091
Query 1185 CTTTGTGGCCAAGAAGAAATTCCAGCAAGCGCGGAAGCCTTACGATGTGCGGGACGTCATTGAGCAGTACTCGC 1258
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1092 CTTTGTAGCCAAGAAGAAATTCCAGCAAGCACGGAAGCCCTACGACGTGCGAGATGTCATCGAGCAGTACTCCC 1165
Query 1259 AGGGCCACCTCAACCTCATGGTGCGCATCAAGGAGCTGCAGAGGAGGCTGGACCAGTCCATTGGGAAGCCCTCA 1332
||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1166 AGGGCCACCTGAACCTTATGGTGCGCATTAAAGAACTACAGAGAAGGCTGGATCAGTCCATTGGGAAGCCATCT 1239
Query 1333 CTGTTCATCTCCGTCTCAGAAAAGAGCAAGGATCGCGGCAGCAACACGATCGGCGCCCGCCTGAACCGAGTAGA 1406
.||||||||.||.||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||.|.||.||
Sbjct 1240 TTGTTCATCCCCATCTCAGAAAAGAGCAAAGACCGTGGCAGTAACACCATCGGTGCCCGTCTGAACAGGGTGGA 1313
Query 1407 AGACAAGGTGACGCAGCTGGACCAGAGGCTGGCACTCATCACCGACATGCTTCACCAGCTGCTCTCCTTG---C 1477
||||||||||||.||.|||||||||||.||||...|||||||.||||||||.|||||||||||.|||.|| |
Sbjct 1314 AGACAAGGTGACACAACTGGACCAGAGACTGGTGATCATCACAGACATGCTCCACCAGCTGCTGTCCATGCAAC 1387
Query 1478 ACGGTGG--CAGCACCCCCGGCAGCGGCGGCCCCCCCAGAGAGGGCGGGGCCCACATCAC---------CCAGC 1540
|.||||| || |||..|..|||| ||| |||| |||||
Sbjct 1388 AAGGTGGTCCA--ACCTGCAACAGC----------------AGG------------TCACAAGTTGTAGCCAGC 1431
Query 1541 CCTGCGGCAGTGGCGGCTCCGTCGACCCTGAGCTCTTCCTGCCCAGCAACACCCTGCCCACCTACGAGCAGCTG 1614
..|| ..||.||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1432 AATG-----AAGGTGGCTCCATCAACCCTGAGCTCTTCCTACCCAGCAACAGCCTGCCCACCTACGAACAACTG 1500
Query 1615 ACCGTGCCCAGGAGGGGCCCCGATGAGGGGTCC 1647
||.||||||..||..|||||.||||||||.|||
Sbjct 1501 ACTGTGCCCCAGACAGGCCCTGATGAGGGTTCC 1533