Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479683
• Subject: NM_009190.2
• Aligned Length: 1334
• Identities: 1180
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGTCATCCACTTCGCCCAACCTCCAGAAAGCGATAGATCTGGCTAGCAAAGCAGCGCAAGAAGACAAGGCTGG  74
            |||.|.|||||.....|||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCACGAACACCAACCTGCAGAAAGCAATAGATCTTGCAAGCAAAGCAGCCCAGGAAGACAAAGCTGG  74

Query   75  GAACTACGAAGAAGCCCTTCAGCTCTATCAGCATGCTGTGCAGTATTTTCTTCATGTCGTTAAATATGAAGCAC  148
            ||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GAACTATGAGGAAGCTCTTCAACTCTACCAACATGCTGTGCAGTATTTTCTCCATGTTGTTAAATATGAAGCAC  148

Query  149  AGGGTGATAAAGCCAAGCAAAGTATCAGGGCAAAGTGTACAGAATATCTTGATAGAGCAGAAAAACTAAAGGAG  222
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  AAGGTGATAAAGCCAAGCAAAGTATCAGGGCCAAGTGTACAGAATATCTCGATAGAGCAGAAAAACTAAAGGAA  222

Query  223  TACCTGAAAAATAAAGAGAAAAAAGCACAGAAGCCAGTGAAAGAAGGACAGCCGAGTCCAGCAGATGAGAAGGG  296
            ||.|||||.||.||.|||||.|||.||||||||||.||||||||.|.||||.|..|.||||..|||||||||||
Sbjct  223  TATCTGAAGAAAAAGGAGAAGAAACCACAGAAGCCTGTGAAAGAGGAACAGTCAGGCCCAGTTGATGAGAAGGG  296

Query  297  GAATGACAGTGATGGGGAAGGAGAATCTGATGATCCTGAAAAAAAGAAACTACAGAATCAACTTCAAGGTGCCA  370
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAATGACAGTGATGGGGAAGCAGAATCTGATGATCCTGAAAAAAAGAAACTGCAGAATCAACTTCAAGGTGCCA  370

Query  371  TTGTTATAGAACGACCAAATGTGAAATGGAGTGACGTTGCTGGACTTGAAGGAGCCAAAGAAGCACTGAAAGAG  444
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  371  TTGTTATAGAGCGACCAAATGTGAAGTGGAGTGATGTTGCTGGTCTCGAAGGAGCCAAAGAAGCTCTTAAAGAG  444

Query  445  GCTGTGATACTGCCTATTAAATTTCCTCATCTTTTTACAGGCAAGAGAACACCTTGGAGGGGAATCCTATTATT  518
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGTGATTCTGCCTATTAAGTTTCCTCATCTGTTTACAGGAAAGCGGACACCTTGGAGAGGAATCCTATTATT  518

Query  519  TGGGCCGCCTGGAACAGGAAAGTCCTACTTAGCCAAAGCTGTAGCAACAGAAGCCAACAACTCAACATTTTTTT  592
            |||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TGGACCACCAGGAACAGGAAAATCTTATTTGGCTAAAGCTGTTGCAACGGAAGCAAACAACTCAACATTTTTCT  592

Query  593  CAATATCTTCCTCTGATCTTGTTTCTAAGTGGCTAGGTGAAAGTGAAAAACTGGTTAAGAATTTATTCCAACTT  666
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  593  CAATATCTTCCTCTGACCTTGTGTCTAAGTGGCTGGGGGAAAGCGAAAAACTGGTTAAGAACTTATTCCAGCTT  666

Query  667  GCCAGAGAGAACAAGCCCTCCATTATCTTCATTGATGAAATTGATTCTCTCTGTGGTTCAAGAAGTGAAAATGA  740
            |||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  GCCAGAGAGAACAAGCCTTCTATCATCTTCATCGATGAGATTGATTCTCTGTGTGGTTCCAGAAGTGAGAATGA  740

Query  741  AAGTGAAGCCGCACGTAGAATTAAGACGGAGTTCCTAGTGCAAATGCAAGGGGTTGGTGTAGACAATGATGGAA  814
            .||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  741  GAGCGAGGCTGCACGGAGAATTAAGACGGAGTTCCTGGTTCAAATGCAAGGAGTTGGTGTGGACAATGATGGCA  814

Query  815  TTTTGGTTCTGGGAGCTACAAATATACCCTGGGTTCTGGATTCTGCCATTAGGCGAAGATTTGAGAAACGAATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  TTTTGGTTCTGGGAGCTACAAATATACCCTGGGTTCTGGATTCTGCAATTAGGCGAAGATTTGAGAAACGTATT  888

Query  889  TATATTCCCTTGCCGGAACCCCATGCCCGAGCAGCAATGTTTAAACTGCACCTAGGGACCACTCAGAACAGTCT  962
            ||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.|||||||.|||||||.|.||.|.||||||||||||.||
Sbjct  889  TATATTCCTTTGCCCGAAGCCCATGCCCGAGCAGCCATGTTTAGACTGCACTTGGGCAGCACTCAGAACAGCCT  962

Query  963  CACGGAAGCAGACTTTCGGGAACTTGGGAGGAAAACAGATGGTTATTCAGGGGCAGATATAAGTATCATTGTAC  1036
            |||.|||||||||||.|..||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACAGAAGCAGACTTCCAAGAACTTGGGAGGAAGACGGATGGCTATTCAGGAGCAGATATAAGTATCATTGTAC  1036

Query 1037  GTGATGCCCTTATGCAGCCTGTTAGGAAAGTACAGTCAGCTACTCATTTTAAAAAGGTTCGCGGACCTTCCCGA  1110
            |.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||..||
Sbjct 1037  GGGATGCACTTATGCAGCCTGTGAGAAAAGTTCAGTCAGCTACTCACTTCAAAAAGGTTCGAGGACCCTCAAGA  1110

Query 1111  GCTGATCCTAAC--CATCTTGTAGATGATCTGCTAACACCTTGCTCTCCAGGTGACCCTGGTGCCATTGAAATG  1182
            ||||||||||||  ||  |||||.||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1111  GCTGATCCTAACTGCA--TTGTAAATGACCTGCTGACACCCTGCTCTCCGGGAGACCCTGGGGCTATTGAAATG  1182

Query 1183  ACATGGATGGATGTCCCTGGAGATAAACTTTTGGAGCCAGTTGTTTCCATGTCGGATATGTTGCGGTCACTATC  1256
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.||.||
Sbjct 1183  ACATGGATGGATGTTCCTGGAGATAAACTCTTGGAGCCAGTTGTTTCCATGTGGGATATGCTGCGGTCCCTGTC  1256

Query 1257  TAACACAAAACCTACAGTCAATGAACATGACTTGTTGAAATTAAAGAAGTTTACAGAAGATTTTGGTCAAGAAG  1330
            .|.||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1257  CAGCACAAAGCCAACAGTCAATGAGCAGGACTTGTTGAAGCTGAAGAAGTTTACAGAAGATTTTGGCCAGGAAG  1330

Query 1331  GC  1332
            ||
Sbjct 1331  GC  1332