Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479692
• Subject: NM_001363534.1
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1352
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  ATGGCCAACATGCAGGGACTGGTGGAAAGACTGGAACGAGCTGTCAGCCGCCTGGAGTCGCTGTCTGCAGAGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAACATGCAGGGACTGGTGGAAAGACTGGAACGAGCTGTCAGCCGCCTGGAGTCGCTGTCTGCAGAGTC  74

Query   75  CCACAGGCCCCCTGGGAACTGCGGGGAAGTCAATGGTGTCATTGCAGGTGTGGCACCCTCCGTGGAAGCCTTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCACAGGCCCCCTGGGAACTGCGGGGAAGTCAATGGTGTCATTGCAGGTGTGGCACCCTCCGTGGAAGCCTTTG  148

Query  149  ACAAGCTGATGGACAGTATGGTGGCCGAGTTTTTAAAGAACAGTAGGATCCTTGCTGGGGACGTGGAGACCCAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAAGCTGATGGACAGTATGGTGGCCGAGTTTTTAAAGAACAGTAGGATCCTTGCTGGGGACGTGGAGACCCAT  222

Query  223  GCAGAAATGGTGCACAGTGCTTTCCAGGCCCAGCGGGCTTTCCTTCTGATGGCCTCTCAGTACCAACAACCCCA  296
                                                                                      
Sbjct  223  --------------------------------------------------------------------------  222

Query  297  CGAGAATGACGTGGCCGCACTTCTGAAACCCATATCGGAAAAGATTCAGGAAATCCAAACTTTCAGAGAGAGAA  370
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ----AATGACGTGGCCGCACTTCTGAAACCCATATCGGAAAAGATTCAGGAAATCCAAACTTTCAGAGAGAGAA  292

Query  371  ACCGGGGGAGTAACATGTTTAATCATCTTTCGGCCGTCAGCGAAAGCATCCCTGCCCTTGGATGGATAGCTGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  ACCGGGGGAGTAACATGTTTAATCATCTTTCGGCCGTCAGCGAAAGCATCCCTGCCCTTGGATGGATAGCTGTG  366

Query  445  TCTCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAATGACGCTGCCACCTTTTACACTAACAGGGTCTTAAAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  TCTCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAATGACGCTGCCACCTTTTACACTAACAGGGTCTTAAAGGA  440

Query  519  CTACAAACACAGTGATTTGCGTCATGTGGATTGGGTGAAGTCATATTTGAACATTTGGAGTGAACTTCAAGCAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  CTACAAACACAGTGATTTGCGTCATGTGGATTGGGTGAAGTCATATTTGAACATTTGGAGTGAACTTCAAGCAT  514

Query  593  ACATCAAGGAACACCACACCACGGGCCTCACATGGAGCAAAACAGGTCCTGTAGCATCCACAGTATCAGCGTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  ACATCAAGGAACACCACACCACGGGCCTCACATGGAGCAAAACAGGTCCTGTAGCATCCACAGTATCAGCGTTT  588

Query  667  TCTGTCCTCTCCTCTGGGCCTGGCCTTCCTCCACCCCCTCCTCCTCTGCCTCCTCCAGGGCCACCTCCACTTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  TCTGTCCTCTCCTCTGGGCCTGGCCTTCCTCCACCCCCTCCTCCTCTGCCTCCTCCAGGGCCACCTCCACTTTT  662

Query  741  CGAGAATGAAGGCAAAAAAGAGGAATCTTCTCCTTCACGCTCAGCTTTATTTGCCCAACTTAACCAGGGAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  CGAGAATGAAGGCAAAAAAGAGGAATCTTCTCCTTCACGCTCAGCTTTATTTGCCCAACTTAACCAGGGAGAAG  736

Query  815  CAATTACAAAAGGGCTCCGCCATGTCACAGATGACCAGAAGACATACAAAAATCCCAGCCTGCGGGCTCAAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  CAATTACAAAAGGGCTCCGCCATGTCACAGATGACCAGAAGACATACAAAAATCCCAGCCTGCGGGCTCAAGGA  810

Query  889  GGGCAAACTCAATCTCCCACCAAAAGTCACACTCCAAGTCCCACATCTCCTAAATCTTATCCTTCTCAAAAACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  GGGCAAACTCAATCTCCCACCAAAAGTCACACTCCAAGTCCCACATCTCCTAAATCTTATCCTTCTCAAAAACA  884

Query  963  TGCCCCAGTGTTGGAGTTGGAAGGAAAGAAATGGAGAGTGGAGTACCAAGAGGACAGGAATGACCTTGTGATTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  TGCCCCAGTGTTGGAGTTGGAAGGAAAGAAATGGAGAGTGGAGTACCAAGAGGACAGGAATGACCTTGTGATTT  958

Query 1037  CAGAGACTGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGCGAAAAATCAACTATTCAGATAAAAGGGAAAGTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  CAGAGACTGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGCGAAAAATCAACTATTCAGATAAAAGGGAAAGTA  1032

Query 1111  AACTCCATTATAATTGACAACTGTAAGAAACTCGGCCTGGTGTTTGACAATGTGGTGGGCATTGTGGAAGTGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  AACTCCATTATAATTGACAACTGTAAAAAACTCGGCCTGGTGTTTGACAATGTGGTGGGCATTGTGGAAGTGAT  1106

Query 1185  CAACTCCCAGGACATTCAAATCCAGGTAATGGGGAGAGTGCCAACAATTTCCATTAATAAGACAGAAGGTTGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  CAACTCCCAGGACATTCAAATCCAGGTAATGGGGAGAGTGCCAACAATTTCCATTAATAAGACAGAAGGTTGCC  1180

Query 1259  ACATATACCTCAGTGAAGATGCATTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCCAAGTCATCTGAAATGAACATACTTATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  ACATATACCTCAGTGAAGATGCATTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCCAAGTCATCTGAAATGAACATACTTATC  1254

Query 1333  CCTCAGGATGGTGATTATAGAGAATTTCCCATTCCTGAACAGTTCAAGACAGCATGGGATGGATCCAAGTTAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  CCTCAGGATGGTGATTATAGAGAATTTCCCATTCCTGAACAGTTCAAGACAGCATGGGATGGATCCAAGTTAAT  1328

Query 1407  CACTGAACCTGCAGAAATTATGGCC  1431
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  CACTGAACCTGCAGAAATTATGGCC  1353