Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479692
• Subject: XM_006516946.2
• Aligned Length: 1532
• Identities: 1216
• Gaps: 115

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCCGCCATGCACATGAGACTATTTATTCTCATCAACACCACAGAGGCTGTGCATTAAGTCATGTCGGAAT  74

Query    1  ----------------ATGGCCAACATGCAGGGACTGGTGGAAAGACTGGAACGAGCTGTCAGCCGCCTGGAGT  58
                            |||.|..|||||..|||||||.||||.||.||||||||.||.||||.|||.||||||.
Sbjct   75  CCAGGCGTTCTTTATAATGACAGACATGGCGGGACTGATGGAGAGGCTGGAACGTGCAGTCATCCGGCTGGAGC  148

Query   59  CGCTGTCTGCAGAG-----------TCCCACAGGCCCCCTGGGAACTGCGGGGAAGTCAATGGTGTCATTGCAG  121
            .|||||||||||.|           |||||.|||           ||||||||||||.||||||||||.||.||
Sbjct  149  AGCTGTCTGCAGGGTTAGACGGACCTCCCAGAGG-----------CTGCGGGGAAGTGAATGGTGTCAATGGAG  211

Query  122  GTGTGGCACCCTCCGTGGAAGCCTTTGACAAGCTGATGGACAGTATGGTGGCCGAGTTTTTAAAGAACAGTAGG  195
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||..|.
Sbjct  212  GTGTGGCACCGTCCGTGGAAGCTTTTGACAAACTGATAAACAGTATGGTGGCCGAGTTCTTAAAGAACAGCCGA  285

Query  196  ATCCTTGCTGGGGACGTGGAGACCCATGCAGAAATGGTGCACAGTGCTTTCCAGGCCCAGCGGGCTTTCCTTCT  269
            .||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  286  GTCCTTGCTGGTGACGTAGAGACTCACGCAGAAATGGTGCACGGTGCTTTCCAAGCCCAGCGTGCTTTTCTTCT  359

Query  270  GATGGCCTCTCAGTACCAACAACCCCACGAGAATGACGTGGCCGCACTTCTGAAACCCATATCGGAAAAGATTC  343
            .||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|..||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  360  CATGGTCTCGCAGTACCAACAACCCCAAGAGAATGAAGTTGCTGTCCTTCTGAAGCCCATATCGGAGAAGATTC  433

Query  344  AGGAAATCCAAACTTTCAGAGAGAGAAACCGGGGGAGTAACATGTTTAATCATCTTTCGGCCGTCAGCGAAAGC  417
            |.|||||.||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct  434  AAGAAATACAGACTTTCCGAGAGAGAAACCGGGGAAGCAACATGTTCAACCACCTCTCGGCAGTCAGTGAAAGC  507

Query  418  ATCCCTGCCCTTGGATGGATAGCTGTGTCTCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAATGACGCTGCCAC  491
            |||.|.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  508  ATCGCCGCCCTGGGCTGGATAGCCGTGTCCCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAACGACGCTGCCAC  581

Query  492  CTTTTACACTAACAGGGTCTTAAAGGACTACAAACACAGTGATTTGCGTCATGTGGATTGGGTGAAGTCATATT  565
            |||||||||.|||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.|||||||||||||.|||.||..
Sbjct  582  CTTTTACACAAACAGGGTCCTGAAAGACTACAAGCACAGCGATCTGCGCCACGTGGATTGGGTGAGGTCCTACC  655

Query  566  TGAACATTTGGAGTGAACTTCAAGCATACATCAAGGAACACCACACCACGGGCCTCACATGGAGCAAAACAGGT  639
            |.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  656  TCAACATCTGGAGCGAGCTGCAAGCCTACATCAGGGAACACCACACCACAGGCCTCACTTGGAGCAAAACAGGT  729

Query  640  CCTGTAGCATCCACAGTATCAGCGTTTTCTGTCCTCTCCTCTGGGCCTGGCCTTCCTCCACCCCCTCCTCCTCT  713
            |||||.||||||||||..|||||||||||..|||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.|.
Sbjct  730  CCTGTGGCATCCACAGCGTCAGCGTTTTCCATCCTCTCCTCTGGGCCTGGTCTCCCGCCACCACCTCCACCACC  803

Query  714  GCCTCCTCCAGGGCCACCTCCACTTTTCGAGAATGAAGGCAAAAAAGAGGAATCTTCTCCTTCACGCTCAGCTT  787
            .||||||||.|||||||||||||..||.||||||||.|..|||||.|||||..|.||.|||||.||||||||||
Sbjct  804  ACCTCCTCCTGGGCCACCTCCACCCTTTGAGAATGAGGATAAAAAGGAGGAGCCCTCCCCTTCTCGCTCAGCTT  877

Query  788  TATTTGCCCAACTTAACCAGGGAGAAGCAATTACAAAAGGGCTCCGCCATGTCACAGATGACCAGAAGACATAC  861
            ||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  878  TATTTGCCCAGCTCAATCAAGGAGAAGCCATCACTAAAGGGCTCCGGCATGTCACAGATGACAAGAAGACATAC  951

Query  862  AAAAATCCCAGCCTGCGGGCTCAAGGAGGGCAAACTCAATCTCCCACCAAAAGTCACACTCCAAGTCCCACATC  935
            ||.||||||||||||.|||||||||||   ||.|.||..|||||.|||||||.||||||.||.||.||||||||
Sbjct  952  AAGAATCCCAGCCTGAGGGCTCAAGGA---CAGATTCGCTCTCCAACCAAAACTCACACGCCGAGCCCCACATC  1022

Query  936  TCCTAAATCTTATCCTTCTCAAAAACATGCCCCAGTGTTGGAGTTGGAAGGAAAGAAATGGAGAGTGGAGTACC  1009
            |||.|||||..||.||.||||.||||||.|.||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1023  TCCAAAATCGAATTCTCCTCAGAAACATACTCCAGTGTTGGAGCTGGAAGGGAAGAAGTGGAGAGTGGAATACC  1096

Query 1010  AAGAGGACAGGAATGACCTTGTGATTTCAGAGACTGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGCGAAAAA  1083
            ||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1097  AAGAGGACAGGAATGACCTTGTCATCTCCGAGACCGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGTGACAAA  1170

Query 1084  TCAACTATTCAGATAAAAGGGAAAGTAAACTCCATTATAATTGACAACTGTAAGAAACTCGGCCTGGTGTTTGA  1157
            ||.|||.||||||||||.||.|||||.||||||||.|...|.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1171  TCCACTCTTCAGATAAAGGGAAAAGTGAACTCCATCACTGTCGATAACTGCAAGAAGTTTGGCCTGGTGTTTGA  1244

Query 1158  CAATGTGGTGGGCATTGTGGAAGTGATCAACTCCCAGGACATTCAAATCCAGGTAATGGGGAGAGTGCCAACAA  1231
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1245  TCATGTGGTGGGCATTGTGGAAGTGATCAACTCCAAGGACATTCAGATCCAGGTAATGGGGAGAGTACCAACAA  1318

Query 1232  TTTCCATTAATAAGACAGAAGGTTGCCACATATACCTCAGTGAAGATGCATTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCC  1305
            |.||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1319  TCTCCATTAATAAGACAGAAGGATGCCACCTGTACCTCAGTGAAGATGCACTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCG  1392

Query 1306  AAGTCATCTGAAATGAACATACTTATCCCTCAGGATGGTGATTATAGAGAATTTCCCATTCCTGAACAGTTCAA  1379
            |||||.||.||.|||||..|.||..||||||||||||..||||||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1393  AAGTCGTCCGAGATGAATGTCCTGGTCCCTCAGGATGACGATTATAGAGAATTCCCCATTCCCGAGCAGTTCAA  1466

Query 1380  GACAGCATGGGATGGATCCAAGTTAATCACTGAACCTGCAGAAATTATGGCC  1431
            ||||..|||||||||.||||||.|..||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1467  GACAATATGGGATGGCTCCAAGCTGGTCACCGAACCTGCAGAGATCATGGCC  1518