Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479746
- Subject:
- NR_161419.1
- Aligned Length:
- 2387
- Identities:
- 1605
- Gaps:
- 752
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GTCTTACTGCTACAGCAGGGCTGGGGATTGCAGTATCCGCTGTTGCTGCTGCTCCCAGTCCTGCCCCTGCTGCT 74
Query 1 --------------------ATGGCTGAAGCGGCCACG--GGCTTTC----------TGG---------AGCAG 33
||..|.||||.|| |||| |||.||| ||| |||||
Sbjct 75 ACCTAGTCCAGCCTCACCGCATCCCAGAAGAGG-CACGTCGGCCTTCATTTGCCTAGTGGATTTTCAAAAGCAG 147
Query 34 CTC-------------------AAG---TCCTGCAT-------------------------AGTTTG------- 53
||| ||| .|.||||| ||.|.|
Sbjct 148 CTCTTCGGTTTTTGGTGCTGTTAAGAGACCTTGCATTTCAATCACACCGGGAGAAAACTGAAGCTCGTAACAGG 221
Query 54 ---GTCT------TGGACGTATCTGTGGAC-----CGTGTGGTTCTTCAT----CGTGCTAT---TCCTGGTC- 105
.||| |||||..|.|| ||||| .||.||| |||||| |.||||.| .||.|.||
Sbjct 222 AGAATCTGGCAGCTGGACACAGCT-TGGACTGCATTGTCTGG--CTTCATGACCCCTGCTGTGTAGCCGGCTCA 292
Query 106 ------------------TACA---TCCTGCGGGTGCC----------------------------------TT 124
|||| |||| ||..|..| ||
Sbjct 293 TCTCTTCACTCTCACATGTACACTCTCCT-CGCTTTTCTTTCTTTTTTTTTTCCCTTTTCTTTCTTCTAATTTT 365
Query 125 TGAAAATCAAC-------GACAAC-----TTGAGCA---------CAGTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACA 177
|.||||.||.| |.||.| ||| ||| ||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 TAAAAAGCAGCCTCTGGAGCCAGCCATGTTTG-GCACTGAATCTTCATTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACA 438
Query 178 CCGAAGTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCAGGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTA 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 CCGAAGTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCAGGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTA 512
Query 252 TTTTCGCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTG 325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 TTTTCGCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTG 586
Query 326 ACAACAACTCTTCCAACA---------------------ACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGC 378
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 587 ACAACAACTCTTCCAACAATTCTAATTCCAGTAACGGGGACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGC 660
Query 379 AAAGTATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGA 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AAAGTATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGA 734
Query 453 GCCTCTTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATC 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 GCCTCTTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATC 808
Query 527 TGCGTCCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 TGCGTCCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCAT 882
Query 601 GAAGCCTTGGAGATAAATGAGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGA 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 GAAGCCTTGGAGATAAATGAGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGA 956
Query 675 AGCAGAAAAATTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATC 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 AGCAGAAAAATTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATC 1030
Query 749 ATGGATCCCAGTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATG 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 ATGGATCCCAGTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATG 1104
Query 823 TGTGCCAGAAGACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCT 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 TGTGCCAGAAGACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCT 1178
Query 897 GAGTATGTTCAATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAG 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179 GAGTATGTTCAATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAG 1252
Query 971 TCTTAGCAAAGTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCA 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 TCTTAGCAAAGTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCA 1326
Query 1045 AGAGCTGTCTCTGACAA--------------------------------------------------------- 1061
|||||||||||||||||
Sbjct 1327 AGAGCTGTCTCTGACAAATCGCCAGTACCTACTGCAACATCTTTTCTCCCTACACAGCGACTCCAGCTTGGGAG 1400
Query 1062 -------------------------------------------------------------------------- 1061
Sbjct 1401 GGCAGGGCCAGGGTTGTCACAGCTTCCCCTGTGGTGTCTGCCTGCCAAGCACAGCTCTGGAGTTAGCCCTGGGT 1474
Query 1062 -----ATTCTCTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATTCA 1130
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475 GTGAGATTCTCTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATTCA 1548
Query 1131 TAGAGCTGTGGAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGAAC 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 TAGAGCTGTGGAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGAAC 1622
Query 1205 ATATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGGAA 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623 ATATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGGAA 1696
Query 1279 GGGGCTTTGAATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGGCA 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697 GGGGCTTTGAATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGGCA 1770
Query 1353 CCTATTTTATCCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTCAG 1426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771 CCTATTTTATCCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTCAG 1844
Query 1427 TTTACCCAAAGAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGGCC 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 TTTACCCAAAGAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGGCC 1918
Query 1501 CTCCTGACACATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCACTTTGTTTGCCCCCTT 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 CTCCTGACACATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCACTTTGTTTGCCCCCTT 1992
Query 1575 AAACTTTGTCATGGAGAAAGTGGAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACGGATC------- 1641
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993 AAACTTTGTCATGGAGAAAGTGGAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACGGATCTGAGAGA 2066
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 2067 AGCCCTGTCCTCCACTCACCTCACCCGCCGCTGCCACCATCTCCTCTGTGCCAACTCCTTGTGGACCGCAAGAA 2140
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 2141 AGCATGACTTTGAAAAAGGGAAGCCATTCCGAGATTTTAAAATGTTCATGGACTATTCCATATTAAAAGCTGTT 2214
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 2215 TTTGTTGTACAAAATTCACTGATGTTCAGTTCTATTTTATTTTGCCTTCAGAAAAGAAGAAAGTCAAAAATAAA 2288
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 2289 ACTTTTGTGTATTACAGCAATCATTTGTATCCTCCTGTGTCTTCCAACCCTAAAATTGTTGATGTCCCAAATAA 2362
Query 1642 ------------------- 1641
Sbjct 2363 ACCTTTGGATTTACCTTGA 2381