Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479746
- Subject:
- XM_011241076.2
- Aligned Length:
- 1710
- Identities:
- 1076
- Gaps:
- 540
Alignment
Query 1 ATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGCTCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTACATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACACCGAAGTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTATTTTCGCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAACAACTCTTCCAACAACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CAGAATGCAAAGTATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GGACGAGAGCCTCTTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTC 518
|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ---------------------------ATGAACCTCTCTGCCCAGGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGATTC 47
Query 519 GGACCATCTGCGTCCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTG 592
.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 48 AGATCATCTTCGCCCTGCAGATGCAATAATGCAAAAAGCTTGGAGAGAAAGGAACCCTCAAGCCAGGATTTCTG 121
Query 593 CAGCTCATGAAGCCTTGGAGATAAATG----------------------------------------------- 619
|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 122 CAGCTCATGAAGCCTTGGAGATAAACGAAATTAGGTCCAGAGTTGAAGTTCCCCTAATTGCTTCCTCTACCATC 195
Query 620 ----------------------AGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGC 671
|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 196 TGGGAGATAAAATTGTTACCAAAGTGTGCAACTGCGTACATTCTCTTGGCGGAAGAAGAAGCGACAACTATTGC 269
Query 672 TGAAGCAGAAAAATTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAAC 745
|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 270 TGAAGCAGAAAAACTCTTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGTTGTTACCGGCGCTCTCAGCAGCTACAAC 343
Query 746 ATCATGGATCCCAGTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCA 819
|||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.
Sbjct 344 ATCATGGGTCCCAGTATGAAGCTCAACACAGACGAGACACCAATGTCTTAGTCTATATCAAAAGAAGGCTGGCG 417
Query 820 ATGTGTGCCAGAAGACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCT 893
|||||||||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 418 ATGTGTGCCCGGAGACTTGGAAGGACCAGAGAAGCAGTGAAGATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTTCCCCT 491
Query 894 TCTGAGTATGTTCAATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGG 967
.||.||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 492 CCTAAGCATGTTCAATATCCATGAGAACCTTCTAGAAGCTCTTCTGGAACTCCAAGCTTATGCTGATGTTCAGG 565
Query 968 CAGTCTTAGCAAAGTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAA 1041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||..||||||||
Sbjct 566 CAGTCTTAGCAAAGTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCGGCGACAATATGCTACACAGCCGCCCTGCTCAAA 639
Query 1042 GCAAGAGCTGTCTCTGACAAATTCTCTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGC 1115
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 GCAAGAGCTGTCTCTGACAAATTCTCTCCAGAGGCTGCGTCTCGGAGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGC 713
Query 1116 AGTAGAGGCCATTCATAGAGCTGTGGAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAA 1189
||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 AGTAGAAGCCATCCACAGAGCTGTGGAATTTAATCCACACGTGCCAAAATATCTACTAGAAATGAAAAGCTTAA 787
Query 1190 TCCTACCCCCAGAACATATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACAC 1263
||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 788 TCCTCCCACCAGAACACATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCGATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACAC 861
Query 1264 TGGAAGAGAGTGGAAGGGGCTTTGAATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCC 1337
||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 862 TGGAAGAGGGTGGAAGGGGCTTTGAATCTCTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTCCGGATGATCCCGTATCC 935
Query 1338 CTTGGAAAAGGGGCACCTATTTTATCCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTT 1411
|.||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 936 CCTGGAGAAGGGACACCTATTTTATCCATACCCAATCTGTACAGAAACAGCTGACCGGGAGCTGCTTCCCTCTT 1009
Query 1412 TCCATGAAGTCTCAGTTTACCCAAAGAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTC 1485
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||.||||||
Sbjct 1010 TCCATGAAGTCTCAGTTTACCCAAAGAAGGAACTTCCCTTCTTCATCCTCTTCACTGCTGGACTGTGCTCCTTC 1083
Query 1486 ACAGCCATGCTGGCCCTCCTGACACATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCAC 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084 ACAGCCATGCTGGCCCTCCTGACACATCAGTTTCCGGAACTTATGGGAGTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCAC 1157
Query 1560 TTTGTTTGCCCCCTTAAACTTTGTCATGGAGAAAGTGGAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAA 1633
|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||.|||||.|
Sbjct 1158 TTTGTTTGCCCCCTTGAACTTTGTTATGGAGAAAGTGGAAAGCATCCTCCCCTCCAGTTTGTGGCATCAGCTGA 1231
Query 1634 CACGGATC 1641
||||||||
Sbjct 1232 CACGGATC 1239
