Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479791
• Subject: NR_047512.2
• Aligned Length: 2336
• Identities: 2042
• Gaps: 271

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TCGGGGCGCGGCCCCGCGGCCCGCGCGCTCCTGGGCGGGGGATGTTGTGATGGAGAAGCCGCGGCGGAGCCCGA  74

Query    1  -------------------------------------------------------------------ATGTCTG  7
                                                                               |||||||
Sbjct   75  ACCCCGCAGCCTGAGCCACCTCCGTCATCTGGGCCCGGGGCCTCACCGCGCAGGAGCTGCCAAGGCCATGTCTG  148

Query    8  TTCCATCATCACTGAGCCAGTCGGCCATTAATGCCAACAGCCACGGAGGCCCCGCACTGAGCCTACCCCTGCCT  81
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCCATCATCACTGAGCCAGTCGGCCATTAATGCCAACAGCCACGGAGGCCCCGCACTGAGCCTACCCCTGCCT  222

Query   82  CTGCACGCTGCCCACAACCAGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAGGCCACAGCTGTGGGACCCAAGGACCTGCGCAG  155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCACGCTGCCCACAACCAGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAGGCCACAGCTGTGGGACCCAAGGACCTGCGCAG  296

Query  156  CGCCATGGGGGAGGGTGGTGGGCCTGAGCCAGGCCCTGCCAATGCCAAGTGGCTAAAAGAGGGCCAGAACCAGC  229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCCATGGGGGAGGGTGGTGGGCCTGAGCCAGGCCCTGCCAATGCCAAGTGGCTAAAAGAGGGCCAGAACCAGC  370

Query  230  TCCGGCGGGCCGCCACGGCCCACCGTGACCAGAATCGCAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGCCAGCCAG  303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCGGCGGGCCGCCACGGCCCACCGTGACCAGAATCGCAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGCCAGCCAG  444

Query  304  GAGCCTGAGATGGCACCCTTGGGCCCCAAAGGCCTGATACACCTGTACTCTGAGCTGGAGCTCTCAGCTCACAA  377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCCTGAGATGGCACCCTTGGGCCCCAAAGGCCTGATACACCTGTACTCTGAGCTGGAGCTCTCAGCTCACAA  518

Query  378  CGCAGCCAACCGAGGCCTACGAGGACCTGGCCTGATCATCAGCACTCAAGAGCAGGGGCCAGATGAGGGAGAGG  451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGCAGCCAACCGAGGCCTACGAGGACCTGGCCTGATCATCAGCACTCAAGAGCAGGGGCCAGATGAGGGAGAGG  592

Query  452  AGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGAAGAGGAGGAGGAGGACTTATCTTCT  525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGAAGAGGAGGAGGAGGACTTATCTTCT  666

Query  526  CCCCCAGGGCTGCCTGAGCCCCTGGAGAGTGTGGAGGCCCCTCCCAGGCCCCAAGCCCTTACAGATGGCCCCCG  599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCCCAGGGCTGCCTGAGCCCCTGGAGAGTGTGGAGGCCCCTCCCAGGCCCCAAGCCCTTACAGATGGCCCCCG  740

Query  600  GGAACACAGCAAGAGTGCCAGCCTCCTGTTTGGCATGCGGAACAGTGCAGCCAGTGATGAGGACTCAAGCTGGG  673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAACACAGCAAGAGTGCCAGCCTCCTGTTTGGCATGCGGAACAGTGCAGCCAGTGATGAGGACTCAAGCTGGG  814

Query  674  CTACCTTATCCCAGGGCAGCCCCTCCTATGGCTCCCCAGAGGACACAGATTCCTTCTGGAACCCCAACGCCTTC  747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTACCTTATCCCAGGGCAGCCCCTCCTATGGCTCCCCAGAGGACACAGATTCCTTCTGGAACCCCAACGCCTTC  888

Query  748  GAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGACACCTCAGGGACCTATTACTGGCACATCCC  821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGACACCTCAGGGACCTATTACTGGCACATCCC  962

Query  822  AACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAGCCCCCAAGAGGAGTCCC  895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAGCCCCCAAGAGGAGTCCC  1036

Query  896  AGCTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTTTGAGGATGGAGAATTTTGGAAGGATGAACCCAGTGAT  969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTTTGAGGATGGAGAATTTTGGAAGGATGAACCCAGTGAT  1110

Query  970  GAGGCCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTCCCAGCTCAGAGCCTCAGCCC  1043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGGCCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTCCCAGCTCAGAGCCTCAGCCC  1184

Query 1044  AGAGCCGTTGCCCCAAGAGGAGGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGGATCAAGTGTTTCGCCGTGC  1117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAGCCGTTGCCCCAAGAGGAGGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGGATCAAGTGTTTCGCCGTGC  1258

Query 1118  GCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCTGGACGCAGCAGTGTGGCAGTCAACAATTGC  1191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCTGGACGCAGCAGTGTGGCAGTCAACAATTGC  1332

Query 1192  ATCCGTCAGCTCTCTTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCTGGGGGGAAGGAAAGGATCT  1265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCCGTCAGCTCTCTTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCTGGGGGGAAGGAAAGGATCT  1406

Query 1266  GCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAGCTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCACTGCTGCACGCCCAACCCA  1339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAGCTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCACTGCTGCACGCCCAACCCA  1480

Query 1340  TCATCAGCATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGA------AGGGACTTTGCCTACGTAGCTCGTGAT  1407
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCATCAGCATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGAAGAGAGAGGGACTTTGCCTACGTAGCTCGTGAT  1554

Query 1408  AAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAACATCGCCACCAGCCTGCA  1481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAACATCGCCACCAGCCTGCA  1628

Query 1482  TGAGATCTGCTCTAAGATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCTTGGTAAATGGACTCTCCCTGGACCACT  1555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAGATCTGCTCTAAGATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCTTGGTAAATGGACTCTCCCTGGACCACT  1702

Query 1556  CTAAACTTGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTTGGTCCAGAAGTTCCAAGTC  1629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTAAACTTGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTTGGTCCAGAAGTTCCAAGTC  1776

Query 1630  TATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGATGTGATTAATGGGGCCCTCGAGTCAGTCCT  1703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGATGTGATTAATGGGGCCCTCGAGTCAGTCCT  1850

Query 1704  GTCCTCCAGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCTACCCTCACCATCTTGCACC  1777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTCCTCCAGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCTACCCTCACCATCTTGCACC  1924

Query 1778  AGCAGACAGAGGCAGTGCTGGGAGAGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGCCGTGGGCAGAGATGTCCAC  1851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGCAGACAGAGGCAGTGCTGGGAGAGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGCCGTGGGCAGAGATGTCCAC  1998

Query 1852  ACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACATGTTCTGGTGCGAGCCCAATGCTGC  1925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACATGTTCTGGTGCGAGCCCAATGCTGC  2072

Query 1926  CAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCGTGCATGCTTCGCTACCAGAAGTGTCTGGATGCCCGTTC----CCAG  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|   ..|.|||.||...||||        ||    ||||
Sbjct 2073  CAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCGTGCATGGT---GGAACAGGAGGAACTGG--------TCCAGGCCAG  2135

Query 1996  GCCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCTGAGTCTGTGGC--ACGGCGTGTAGGGTGGACT-GTCC--GC  2064
            |||||..||||||| ..|||||||               |.|||  |.||.| |.||   ||||| ||||  ||
Sbjct 2136  GCCTCATCCTCCTG-GACCCAGCA---------------GGGGCAGAAGGAG-GAAG---GGACTGGTCCAGGC  2189

Query 2065  AGGGGT--GTTCAGTCGCTGTGGGGCTCCCTGAAGCCCAAACGGCTGGGGGCCCATACCCCA------------  2124
            |.||||  .|||  .|.||     |||||.||          |||           |||.|.            
Sbjct 2190  ATGGGTCCCTTC--CCCCT-----GCTCCATG----------GGC-----------ACCTCTGCTGTATTGATA  2235

Query 2125  ------------------------------------------  2124
                                                      
Sbjct 2236  TCACTAATAAAGTCTGTCTGCACTGCTAAAAAAAAAAAAAAA  2277