Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479791
- Subject:
- XM_006507232.3
- Aligned Length:
- 2142
- Identities:
- 1374
- Gaps:
- 630
Alignment
Query 1 ATGTCTGTTCCATCATCACTGAGCCAGTCGGCCATTAATGCCAACAGCCACGGAGGCCCCGCACTGAGCCTACC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCTGCCTCTGCACGCTGCCCACAACCAGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAGGCCACAGCTGTGGGACCCAAGGACC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGCGCAGCGCCATGGGGGAGGGTGGTGGGCCTGAGCCAGGCCCTGCCAATGCCAAGTGGCTAAAAGAGGGCCAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AACCAGCTCCGGCGGGCCGCCACGGCCCACCGTGACCAGAATCGCAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAGCCAGGAGCCTGAGATGGCACCCTTGGGCCCCAAAGGCCTGATACACCTGTACTCTGAGCTGGAGCTCTCAG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTCACAACGCAGCCAACCGAGGCCTACGAGGACCTGGCCTGATCATCAGCACTCAAGAGCAGGGGCCAGATGAG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GGAGAGGAGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGAAGAGGAGGAGGAGGACTT 518
|.||| ||.
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------------ATGAG--CTC 8
Query 519 ATCTT-CTCCCCCAGGGCTGCCTGAGCCCC--TGGAG-------AGTGTGGAGGCCCCTCCCAGGCCCCAAGCC 582
.|||| |||.|||| .||.| |.|||| .|||| |||.|||.|| .|..||||||
Sbjct 9 CTCTTCCTCACCCA--TCTCC---ATCCCCCAAGGAGGTTCCTTAGTATGGTGG-----TCTTGGCCCC----- 67
Query 583 CTTACAGATGGCCCCCGGGAACACAGCAAGAGTGCCAGCCTCCTGTTTGGCATGCGGAACAGTGCAGCCAGTGA 656
.|||.||.||||.| ||.||| ||
Sbjct 68 ----------TCCCTCGAGAACTC--------------------------CAGGCG----------------GA 89
Query 657 TGAGGA-CTCAAGCTGGGCTACCTTATCCCAGGGCAGCCCCTCCTATGGCTCCCCAGAGGACACAGATTCCTTC 729
.||||| || |.||| |||||.|.||| || |.|.|||||||||
Sbjct 90 GGAGGATCT----------TGCCT--------GGCAGACGCTC---TG-------------CCCTGATTCCTTC 129
Query 730 TGGAACCCCAACGCCTTCGAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGACACCTCAGGGAC 803
||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 130 TGGAACCCCAACGCTTTCGAGACGGATTCCGATCTACCGGCTGGATGGATGAGGGTACAGGACACCTCAGGGAC 203
Query 804 CTATTACTGGCACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCA 877
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 204 CTACTACTGGCACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCAGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCA 277
Query 878 GCCCCCAAGAGGAGTCCCAGCTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTTTGAGGATGGAGAATTTTGG 951
||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||...|||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 278 GCCCCCAAGAAGAGTCCCAGCTCACCTGGACTGGCTTTGCTCACCAAGAAGGCTTTGAGGAAGGAGAGTTTTGG 351
Query 952 AAGGATGAACCCAGTGATGAGGCCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTCCC 1025
|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||.|||.|||.|||||||
Sbjct 352 AAGGATGAACCCAGTGAGGAGGCCCCAATGGAGTTGGGACTGAAGGACCCCGAGGAGGCGACATTGTCCTTCCC 425
Query 1026 AGCTCAGAGCCTCAGCCCAGAGCC-GTTGCCCCAAGAGGAGGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGG 1098
|||||||||||||||||||||.|| ||| |||||.|||||.||||||||..|||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 426 AGCTCAGAGCCTCAGCCCAGAACCAGTT-CCCCAGGAGGAAGAGAAGCTGTCCCAACGGAATGCCAACCCAGGG 498
Query 1099 ATCAAGTGTTTCGCCGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCTGGACGCAGCAG 1172
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 499 ATCAAGTGTTTCGCTGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCAGGACGCAGCAG 572
Query 1173 TGTGGCAGTCAACAATTGCATCCGTCAGCTCTCTTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCT 1246
||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||.|||||||||
Sbjct 573 TGTGGCAGTCAACAATTGTATCCGCCAGCTCTCCTACCACAAAAACAATCTACATGATCCGATGGCTGGGGGCT 646
Query 1247 GGGGGGAAGGAAAGGATCTGCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAGCTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCA 1320
||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||.||||.|.
Sbjct 647 GGGGAGAGGGAAAGGATCTGCTGCTCCAGCTGGAGGACGAGACTCTAAAGTTGGTGGAGCCACAGAACCAGACG 720
Query 1321 CTGCTGCACGCCCAACCCATCATCAGCATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGA------AGGGACTT 1388
||||||||.||.||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 721 CTGCTGCATGCACAGCCCATCGTCAGCATTCGTGTGTGGGGCGTTGGGCGGGACAGTGGAAGAGAGAGGGACTT 794
Query 1389 TGCCTACGTAGCTCGTGATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGA 1462
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 TGCCTACGTAGCTCGAGATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGA 868
Query 1463 ACATCGCCACCAGCCTGCATGAGATCTGCTCTAAGATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCTTGGTAAAT 1536
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 869 ACATCGCCACCAGCCTGCATGAGATCTGCTCCAAGATCATGTCTGAACGGCGCAATGCTCGCTGCTTGGTCAAT 942
Query 1537 GGACTCTCCCTGGACCACTCTAAACTTGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTT 1610
|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|
Sbjct 943 GGACTCTCCCTAGACCACTCTAAACTCGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCACCAAAGAATGAGCT 1016
Query 1611 GGTCCAGAAGTTCCAAGTCTATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGATGTGATTAATG 1684
|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1017 GGTGCAGAAGTTCCAAGTCTATTACCTGGGAAATGTGCCAGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGACGTGATTAATG 1090
Query 1685 GGGCCCTCGAGTCAGTCCTGTCCTCCAGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCT 1758
|||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1091 GGGCCCTGGAGTCAGTCCTGTCTTCCAGTAGCCGTGAGCAGTGGACTCCAAGTCACGTCAGCGTGGCCCCTGCC 1164
Query 1759 ACCCTCACCATCTTGCACCAGCAGACAGAGGCAGTGCTGGGAGAGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGC 1832
|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1165 ACCCTCACCATCTTGCACCAGCAGACAGAAGCGGTGCTGGGGGAGTGCCGGGTGCGGTTTCTCTCCTTCCTGGC 1238
Query 1833 CGTGGGCAGAGATGTCCACACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACATGTTCT 1906
.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1239 TGTGGGCAGAGATGTGCACACATTCGCGTTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGTCACATGTTTT 1312
Query 1907 GGTGCGAGCCCAATGCTGCCAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCGTGCATGCTTCGCTACCAGAAGTGTCTG 1980
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1313 GGTGTGAGCCCAATGCTGCCAGTCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCATGCATGCTCCGCTACCAGAAGTGTCTG 1386
Query 1981 GATGCCCGTTCCCAGGCCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCTGAGTCTGTGGCACGGCGTGTAGGGTG 2054
|||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|.|||||||||||
Sbjct 1387 GATGCTCGCTCCCAGACCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCGGAGTCAGTTGCAAGACGTGTAGGGTG 1460
Query 2055 GACTGTCCGCAGGGGTGTTCAGTCGCTGTGGGGCTCCCTGAAGCCCAAACGGCTGGGGGCCCATACCCCA 2124
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.||||||
Sbjct 1461 GACAGTCCGCAGGGGTGTTCAGTCGCTGTGGGGTTCCCTCAAGCCCAAACGTCTGGGATCCCAGACCCCA 1530
