Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479791
• Subject: XM_017321946.1
• Aligned Length: 2126
• Identities: 1922
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGTCTGTTCCATCATCACTGAGCCAGTCGGCCATTAATGCCAACAGCCACGGAGGCCCCGCACTGAGCCTACC  74
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.||
Sbjct    1  ATGTCTGTTCCATCATCCCTGAGCCAGTCGGCCATTAACGCTAACAGCCACGGAGGCCCTGCACTCAGCTTCCC  74

Query   75  CCTGCCTCTGCACGCTGCCCACAACCAGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAGGCCACAGCTGTGGGACCCAAGGACC  148
            |.|.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct   75  CTTACCCCTGCACGCTGCCCATAACCAGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAAGCCACAGCTGTGGTACCCAAGGACC  148

Query  149  TGCGCAGCGCCATGGGGGAGGGTGGTGGGCCTGAGCCAGGCCCTGCCAATGCCAAGTGGCTAAAAGAGGGCCAG  222
            |.||.||.||.|||||.||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||
Sbjct  149  TTCGAAGTGCTATGGGAGAGGGTAGTGTGCCTGAACCAGGCCCTGCCAATGCCAAGTGGTTAAAGGAAGGCCAG  222

Query  223  AACCAGCTCCGGCGGGCCGCCACGGCCCACCGTGACCAGAATCGCAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGC  296
            ||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACCAGCTTCGGAGGGCTGCCACAGCCCACCGAGACCAGAACCGAAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGC  296

Query  297  CAGCCAGGAGCCTGAGATGGCACCCTTGGGCCCCAAAGGCCTGATACACCTGTACTCTGAGCTGGAGCTCTCAG  370
            ||||||||||.||||||.||||||.|||||.|||||||||.|.||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CAGCCAGGAGGCTGAGACGGCACCTTTGGGTCCCAAAGGCTTAATGCATCTATACTCTGAGCTGGAGCTCTCGG  370

Query  371  CTCACAACGCAGCCAACCGAGGCCTACGAGGACCTGGCCTGATCATCAGCACTCAAGAGCAGGGGCCAGATGAG  444
            |.|||||.||||||||||||||.||.|..|||.|.|.|.|||||||||.|||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  371  CCCACAATGCAGCCAACCGAGGGCTTCATGGATCCGCCTTGATCATCAACACCCAGGAACAGGGACCAGATGAA  444

Query  445  GGAGAGGAGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGAAGAGGAGGAGGAGGACTT  518
            ||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAGAGGAGAAGGCAGCAGGAGAGGCTGAGGAGGATGATGAAGACGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACTT  518

Query  519  ATCTTCTCCCCCAGGGCTGCCTGAGCCCCTGGAGAGTGTGG-AGGCCCCTCCCAGGCCCCAAGCCCTTACAGAT  591
            .||||||||.||||||||.||||||||.|||||||.||||| ||.||||| |..|||||||.|||||.|||||.
Sbjct  519  GTCTTCTCCTCCAGGGCTACCTGAGCCTCTGGAGAATGTGGAAGTCCCCT-CTGGGCCCCAGGCCCTCACAGAC  591

Query  592  GGCCCCCGGGAACACAGCAAGAGTGCCAGCCTCCTGTTTGGCATGCGGAACAGTGCAGCCAGTGATGAGGACTC  665
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GGCCCCCGGGAACACAGCAAGAGTGCTAGCCTCCTATTTGGCATGCGAAACAGTGCAGCCAGTGATGAGGACTC  665

Query  666  AAGCTGGGCTACCTTATCCCAGGGCAGCCCCTCCTATGGCTCCCCAGAGGACACAGATTCCTTCTGGAACCCCA  739
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  AAGCTGGGCCACCTTATCACAGGGCAGCCCCTCCTATGGCTCCCCGGAGGACACAGATTCCTTCTGGAACCCCA  739

Query  740  ACGCCTTCGAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGACACCTCAGGGACCTATTACTGG  813
            ||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  740  ACGCTTTCGAGACGGATTCCGATCTACCGGCTGGATGGATGAGGGTACAGGACACCTCAGGGACCTACTACTGG  813

Query  814  CACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAGCCCCCAAGA  887
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCAGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAGCCCCCAAGA  887

Query  888  GGAGTCCCAGCTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTTTGAGGATGGAGAATTTTGGAAGGATGAAC  961
            .||||||||||||||||||||.||.||||||||...|||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  888  AGAGTCCCAGCTCACCTGGACTGGCTTTGCTCACCAAGAAGGCTTTGAGGAAGGAGAGTTTTGGAAGGATGAAC  961

Query  962  CCAGTGATGAGGCCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTCCCAGCTCAGAGC  1035
            |||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||.|||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct  962  CCAGTGAGGAGGCCCCAATGGAGTTGGGACTGAAGGACCCCGAGGAGGCGACATTGTCCTTCCCAGCTCAGAGC  1035

Query 1036  CTCAGCCCAGAGCC-GTTGCCCCAAGAGGAGGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGGATCAAGTGTT  1108
            |||||||||||.|| ||| |||||.|||||.||||||||..|||.|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CTCAGCCCAGAACCAGTT-CCCCAGGAGGAAGAGAAGCTGTCCCAACGGAATGCCAACCCAGGGATCAAGTGTT  1108

Query 1109  TCGCCGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCTGGACGCAGCAGTGTGGCAGTC  1182
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  TCGCTGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCAGGACGCAGCAGTGTGGCAGTC  1182

Query 1183  AACAATTGCATCCGTCAGCTCTCTTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCTGGGGGGAAGG  1256
            ||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||.|||||||||||||.||.||
Sbjct 1183  AACAATTGTATCCGCCAGCTCTCCTACCACAAAAACAATCTACATGATCCGATGGCTGGGGGCTGGGGAGAGGG  1256

Query 1257  AAAGGATCTGCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAGCTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCACTGCTGCACG  1330
            ||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||.||||.|.||||||||.|
Sbjct 1257  AAAGGATCTGCTGCTCCAGCTGGAGGACGAGACTCTAAAGTTGGTGGAGCCACAGAACCAGACGCTGCTGCATG  1330

Query 1331  CCCAACCCATCATCAGCATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGAAGGGACTTTGCCTACGTAGCTCGT  1404
            |.||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1331  CACAGCCCATCGTCAGCATTCGTGTGTGGGGCGTTGGGCGGGACAGTGGAAGGGACTTTGCCTACGTAGCTCGA  1404

Query 1405  GATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAACATCGCCACCAGCCT  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  GATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAACATCGCCACCAGCCT  1478

Query 1479  GCATGAGATCTGCTCTAAGATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCTTGGTAAATGGACTCTCCCTGGACC  1552
            |||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1479  GCATGAGATCTGCTCCAAGATCATGTCTGAACGGCGCAATGCTCGCTGCTTGGTCAATGGACTCTCCCTAGACC  1552

Query 1553  ACTCTAAACTTGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTTGGTCCAGAAGTTCCAA  1626
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1553  ACTCTAAACTCGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCACCAAAGAATGAGCTGGTGCAGAAGTTCCAA  1626

Query 1627  GTCTATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGATGTGATTAATGGGGCCCTCGAGTCAGT  1700
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1627  GTCTATTACCTGGGAAATGTGCCAGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGACGTGATTAATGGGGCCCTGGAGTCAGT  1700

Query 1701  CCTGTCCTCCAGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCTACCCTCACCATCTTGC  1774
            ||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1701  CCTGTCTTCCAGTAGCCGTGAGCAGTGGACTCCAAGTCACGTCAGCGTGGCCCCTGCCACCCTCACCATCTTGC  1774

Query 1775  ACCAGCAGACAGAGGCAGTGCTGGGAGAGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGCCGTGGGCAGAGATGTC  1848
            |||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1775  ACCAGCAGACAGAAGCGGTGCTGGGGGAGTGCCGGGTGCGGTTTCTCTCCTTCCTGGCTGTGGGCAGAGATGTG  1848

Query 1849  CACACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACATGTTCTGGTGCGAGCCCAATGC  1922
            |||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1849  CACACATTCGCGTTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGTCACATGTTTTGGTGTGAGCCCAATGC  1922

Query 1923  TGCCAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCGTGCATGCTTCGCTACCAGAAGTGTCTGGATGCCCGTTCCCAGG  1996
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||.
Sbjct 1923  TGCCAGTCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCATGCATGCTCCGCTACCAGAAGTGTCTGGATGCTCGCTCCCAGA  1996

Query 1997  CCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCTGAGTCTGTGGCACGGCGTGTAGGGTGGACTGTCCGCAGGGGT  2070
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1997  CCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCGGAGTCAGTTGCAAGACGTGTAGGGTGGACAGTCCGCAGGGGT  2070

Query 2071  GTTCAGTCGCTGTGGGGCTCCCTGAAGCCCAAACGGCTGGGGGCCCATACCCCA  2124
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.||||||
Sbjct 2071  GTTCAGTCGCTGTGGGGTTCCCTCAAGCCCAAACGTCTGGGATCCCAGACCCCA  2124