Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479791
- Subject:
- XM_017321947.1
- Aligned Length:
- 2141
- Identities:
- 1319
- Gaps:
- 697
Alignment
Query 1 ATGTCTGTTCCATCATCACTGAGCCAGTCGGCCATTAATGCCAACAGCCACGGAGGCCCCGCACTGAGCCTACC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCTGCCTCTGCACGCTGCCCACAACCAGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAGGCCACAGCTGTGGGACCCAAGGACC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGCGCAGCGCCATGGGGGAGGGTGGTGGGCCTGAGCCAGGCCCTGCCAATGCCAAGTGGCTAAAAGAGGGCCAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AACCAGCTCCGGCGGGCCGCCACGGCCCACCGTGACCAGAATCGCAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CAGCCAGGAGCCTGAGATGGCACCCTTGGGCCCCAAAGGCCTGATACACCTGTACTCTGAGCTGGAGCTCTCAG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTCACAACGCAGCCAACCGAGGCCTACGAGGACCTGGCCTGATCATCAGCACTCAAGAGCAGGGGCCAGATGAG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GGAGAGGAGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGAAGAGGAGGAGGAGGACTT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 ATCTTCTCCCCCAGGGCTGCCTGAGCCCCTGGAGAGTGTGGAGGCCCCTCCCAGGCCCCAAGCCCTTACAGATG 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 GCCCCCGGGAACACAGCAAGAGTGCCAGCCTCCTGTTTGGCATGCGGAACAGTGCAGCCAGTGATGAGGACTCA 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 AGCTGGGCTACCTTATCCCAGGGCAGCCCCTCCTATGGCT----CCCCAGAGGACA------CAGATTCCTTCT 730
|..||.||||||| |...|.||| ||||| .||...|||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ---------ATGTTCTCCCAGG--ACTTCTTCC--TGGCTATCATCCTGCAGGACAACAGTCCAGATTCCTTCT 61
Query 731 GGAACCCCAACGCCTTCGAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGACACCTCAGGGACC 804
|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 62 GGAACCCCAACGCTTTCGAGACGGATTCCGATCTACCGGCTGGATGGATGAGGGTACAGGACACCTCAGGGACC 135
Query 805 TATTACTGGCACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAG 878
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136 TACTACTGGCACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCAGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAG 209
Query 879 CCCCCAAGAGGAGTCCCAGCTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTTTGAGGATGGAGAATTTTGGA 952
|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||...|||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 210 CCCCCAAGAAGAGTCCCAGCTCACCTGGACTGGCTTTGCTCACCAAGAAGGCTTTGAGGAAGGAGAGTTTTGGA 283
Query 953 AGGATGAACCCAGTGATGAGGCCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTCCCA 1026
||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||.|||.|||.||||||||
Sbjct 284 AGGATGAACCCAGTGAGGAGGCCCCAATGGAGTTGGGACTGAAGGACCCCGAGGAGGCGACATTGTCCTTCCCA 357
Query 1027 GCTCAGAGCCTCAGCCCAGAGCC-GTTGCCCCAAGAGGAGGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGGA 1099
||||||||||||||||||||.|| ||| |||||.|||||.||||||||..|||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 358 GCTCAGAGCCTCAGCCCAGAACCAGTT-CCCCAGGAGGAAGAGAAGCTGTCCCAACGGAATGCCAACCCAGGGA 430
Query 1100 TCAAGTGTTTCGCCGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCTGGACGCAGCAGT 1173
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 431 TCAAGTGTTTCGCTGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCAGGACGCAGCAGT 504
Query 1174 GTGGCAGTCAACAATTGCATCCGTCAGCTCTCTTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCTG 1247
|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||.||||||||||
Sbjct 505 GTGGCAGTCAACAATTGTATCCGCCAGCTCTCCTACCACAAAAACAATCTACATGATCCGATGGCTGGGGGCTG 578
Query 1248 GGGGGAAGGAAAGGATCTGCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAGCTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCAC 1321
|||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||.||||.|.|
Sbjct 579 GGGAGAGGGAAAGGATCTGCTGCTCCAGCTGGAGGACGAGACTCTAAAGTTGGTGGAGCCACAGAACCAGACGC 652
Query 1322 TGCTGCACGCCCAACCCATCATCAGCATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGA------AGGGACTTT 1389
|||||||.||.||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 653 TGCTGCATGCACAGCCCATCGTCAGCATTCGTGTGTGGGGCGTTGGGCGGGACAGTGGAAGAGAGAGGGACTTT 726
Query 1390 GCCTACGTAGCTCGTGATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAA 1463
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 727 GCCTACGTAGCTCGAGATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAA 800
Query 1464 CATCGCCACCAGCCTGCATGAGATCTGCTCTAAGATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCTTGGTAAATG 1537
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 801 CATCGCCACCAGCCTGCATGAGATCTGCTCCAAGATCATGTCTGAACGGCGCAATGCTCGCTGCTTGGTCAATG 874
Query 1538 GACTCTCCCTGGACCACTCTAAACTTGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTTG 1611
||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||
Sbjct 875 GACTCTCCCTAGACCACTCTAAACTCGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCACCAAAGAATGAGCTG 948
Query 1612 GTCCAGAAGTTCCAAGTCTATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGATGTGATTAATGG 1685
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 949 GTGCAGAAGTTCCAAGTCTATTACCTGGGAAATGTGCCAGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGACGTGATTAATGG 1022
Query 1686 GGCCCTCGAGTCAGTCCTGTCCTCCAGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCTA 1759
||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1023 GGCCCTGGAGTCAGTCCTGTCTTCCAGTAGCCGTGAGCAGTGGACTCCAAGTCACGTCAGCGTGGCCCCTGCCA 1096
Query 1760 CCCTCACCATCTTGCACCAGCAGACAGAGGCAGTGCTGGGAGAGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGCC 1833
||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1097 CCCTCACCATCTTGCACCAGCAGACAGAAGCGGTGCTGGGGGAGTGCCGGGTGCGGTTTCTCTCCTTCCTGGCT 1170
Query 1834 GTGGGCAGAGATGTCCACACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACATGTTCTG 1907
||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1171 GTGGGCAGAGATGTGCACACATTCGCGTTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGTCACATGTTTTG 1244
Query 1908 GTGCGAGCCCAATGCTGCCAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCGTGCATGCTTCGCTACCAGAAGTGTCTGG 1981
|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1245 GTGTGAGCCCAATGCTGCCAGTCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCATGCATGCTCCGCTACCAGAAGTGTCTGG 1318
Query 1982 ATGCCCGTTCCCAGGCCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCTGAGTCTGTGGCACGGCGTGTAGGGTGG 2055
||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|.||||||||||||
Sbjct 1319 ATGCTCGCTCCCAGACCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCGGAGTCAGTTGCAAGACGTGTAGGGTGG 1392
Query 2056 ACTGTCCGCAGGGGTGTTCAGTCGCTGTGGGGCTCCCTGAAGCCCAAACGGCTGGGGGCCCATACCCCA 2124
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.||||||
Sbjct 1393 ACAGTCCGCAGGGGTGTTCAGTCGCTGTGGGGTTCCCTCAAGCCCAAACGTCTGGGATCCCAGACCCCA 1461