Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479800
• Subject: XM_024453052.1
• Aligned Length: 2037
• Identities: 1398
• Gaps: 639

Alignment

Query    1  ATGGCAACGCTGATTACCAGTACTACAGCTGCTACCGCCGCTTCTGGTCCTTTGGTGGACTACCTATGGATGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATCCTGGGCTTCATTATTGCATTTGTCTTGGCATTCTCCGTGGGAGCCAATGATGTAGCAAATTCTTTTGGTA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGCTGTGGGCTCAGGTGTAGTGACCCTGAAGCAAGCCTGCATCCTAGCTAGCATCTTTGAAACAGTGGGCTCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTCTTACTGGGGGCCAAAGTGAGCGAAACCATCCGGAAGGGCTTGATTGACGTGGAGATGTACAACTCGACTCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGGGCTACTGATGGCCGGCTCAGTCAGTGCTATGTTTGGTTCTGCTGTGTGGCAACTCGTGGCTTCGTTTTTGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGCTCCCTATTTCTGGAACCCATTGTATTGTTGGTGCAACTATTGGTTTCTCCCTCGTGGCAAAGGGGCAGGAG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GGTGTCAAGTGGTCTGAACTGATAAAAATTGTGATGTCTTGGTTCGTGTCCCCACTGCTTTCTGGAATTATGTC  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  TGGAATTTTATTCTTCCTGGTTCGTGCATTCATCCTCCATAAGGCAGATCCAGTTCCTAATGGTTTGCGAGCTT  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  TGCCAGTTTTCTATGCCTGCACAGTTGGAATAAACCTCTTTTCCATCATGTATACTGGAGCACCGTTGCTGGGC  666
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------ATGTATACTGGAGCACCGTTGCTGGGC  27

Query  667  TTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTTTCTGTGCCCTTATCGTCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   28  TTTGACAAACTTCCTCTGTGGGGTACCATCCTCATCTCGGTGGGATGTGCAGTTTTCTGTGCCCTTATCGTCTG  101

Query  741  GTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAATAAAGTGTAGTCCTTCTGAAAGCCCCTTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  102  GTTCTTTGTATGTCCCAGGATGAAGAGAAAAATTGAACGAGAAATAAAGTGTAGTCCTTCTGAAAGCCCCTTAA  175

Query  815  TGGAAAAAAAGAATAGCTTGAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGTTGTCTGTTGGTGATATTGAAAACAAGCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  176  TGGAAAAAAAGAATAGCTTGAAAGAAGACCATGAAGAAACAAAGTTGTCTGTTGGTGATATTGAAAACAAGCAT  249

Query  889  CCTGTTTCTGAGGTAGGGCCTGCCACTGTGCCCCTCCAGGCTGTGGTGGAGGAGAGAACAGTCTCATTCAAACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  250  CCTGTTTCTGAGGTAGGGCCTGCCACTGTGCCCCTCCAGGCTGTGGTGGAGGAGAGAACAGTCTCATTCAAACT  323

Query  963  TGGAGATTTGGAGGAAGCTCCAGAGAGAGAGAGGCTTCCCAGCGTGGACTTGAAAGAGGAAACCAGCATAGATA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  TGGAGATTTGGAGGAAGCTCCAGAGAGAGAGAGGCTTCCCAGCGTGGACTTGAAAGAGGAAACCAGCATAGATA  397

Query 1037  GCACCGTGAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTCCAGTTCAGTCAAGCCGTCAGCAACCAAATA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  398  GCACCGTGAATGGTGCAGTGCAGTTGCCTAATGGGAACCTTGTCCAGTTCAGTCAAGCCGTCAGCAACCAAATA  471

Query 1111  AACTCCAGTGGCCACTACCAGTATCACACCGTGCATAAGGATTCCGGCCTGTACAAAGAGCTACTCCATAAATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  472  AACTCCAGTGGCCACTACCAGTATCACACCGTGCATAAGGATTCCGGCCTGTACAAAGAGCTACTCCATAAATT  545

Query 1185  ACATCTTGCCAAGGTGGGAGATTGCATGGGAGACTCCGGTGACAAACCCTTAAGGCGCAATAATAGCTATACTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  546  ACATCTTGCCAAGGTGGGAGATTGCATGGGAGACTCCGGTGACAAACCCTTAAGGCGCAATAATAGCTATACTT  619

Query 1259  CCTATACCATGGCAATATGTGGCATGCCTCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGGTGAACAGAAGGGCGAAGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  CCTATACCATGGCAATATGTGGCATGCCTCTGGATTCATTCCGTGCCAAAGAAGGTGAACAGAAGGGCGAAGAA  693

Query 1333  ATGGAGAAGCTGACATGGCCTAATGCAGACTCCAAGAAGCGAATTCGAATGGACAGTTACACCAGTTACTGCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  694  ATGGAGAAGCTGACATGGCCTAATGCAGACTCCAAGAAGCGAATTCGAATGGACAGTTACACCAGTTACTGCAA  767

Query 1407  TGCTGTGTCTGACCTTCACTCAGCATCTGAGATAGACATGAGTGTCAAGGCAGAGATGGGTCTAGGTGACAGAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  768  TGCTGTGTCTGACCTTCACTCAGCATCTGAGATAGACATGAGTGTCAAGGCAGAGATGGGTCTAGGTGACAGAA  841

Query 1481  AAGGAAGTAATGGCTCTCTAGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTCTCTCTCCTCTTCCAGTTCCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  AAGGAAGTAATGGCTCTCTAGAAGAATGGTATGACCAGGATAAGCCTGAAGTCTCTCTCCTCTTCCAGTTCCTG  915

Query 1555  CAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTCGCCCATGGTGGCAATGACGTAAGCAATGCCATTGGGCCTCTGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  916  CAGATCCTTACAGCCTGCTTTGGGTCATTCGCCCATGGTGGCAATGACGTAAGCAATGCCATTGGGCCTCTGGT  989

Query 1629  TGCTTTATATTTGGTTTATGACACAGGAGATGTTTCTTCAAAAGTGGCAACACCAATATGGCTTCTACTCTATG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  990  TGCTTTATATTTGGTTTATGACACAGGAGATGTTTCTTCAAAAGTGGCAACACCAATATGGCTTCTACTCTATG  1063

Query 1703  GTGGTGTTGGTATCTGTGTTGGTCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGACCATGGGGAAGGATCTGACA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064  GTGGTGTTGGTATCTGTGTTGGTCTGTGGGTTTGGGGAAGAAGAGTTATCCAGACCATGGGGAAGGATCTGACA  1137

Query 1777  CCGATCACACCCTCTAGTGGCTTCAGTATTGAACTGGCATCTGCCCTCACTGTGGTGATTGCATCAAATATTGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138  CCGATCACACCCTCTAGTGGCTTCAGTATTGAACTGGCATCTGCCCTCACTGTGGTGATTGCATCAAATATTGG  1211

Query 1851  CCTTCCCATCAGTACAACACATTGTAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGGCTCCGGTCCAAGAAGGCTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212  CCTTCCCATCAGTACAACACATTGTAAAGTGGGCTCTGTTGTGTCTGTTGGCTGGCTCCGGTCCAAGAAGGCTG  1285

Query 1925  TTGACTGGCGTCTCTTTCGTAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACAGTCCCCATTTCTGGAGTTATCAGTGCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286  TTGACTGGCGTCTCTTTCGTAACATTTTTATGGCCTGGTTTGTCACAGTCCCCATTTCTGGAGTTATCAGTGCT  1359

Query 1999  GCCATCATGGCAATCTTCAGATATGTCATCCTCAGAATG  2037
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1360  GCCATCATGGCAATCTTCAGATATGTCATCCTCAGAATG  1398