Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479811
- Subject:
- XM_011242709.1
- Aligned Length:
- 1290
- Identities:
- 864
- Gaps:
- 369
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGACCATTCTAATAGGGAAAAGGATGATAGACAACGGACAACTAAAACCATGGCACAAAGGAATACACACTG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTCGAGACCATCTGGCACTTCAACATCCTCTGGGGTTCTCATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TAGGGTGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTAAAAATCTCTACACCAATGAATATGTAGCCATTAAACTG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GAACCAATAAAATCACGTGCTCCACAACTTCATTTAGAGTACAGGTTTTATAAACAGCTTGGCAGTGCAGGTGA 296
Query 1 -------------------------------------------------ATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTA 25
|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 AGGCCTCCCACAGGTTTATTACTTTGGACCATGTGGGAAGTACAATGCCATGGTGCTGGAACTCCTTGGCCCTA 370
Query 26 GCTTGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGCTG 99
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 371 GCTTGGAAGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACGTTTACTTTGAAGACGGTGTTAATGATAGCCATCCAGTTG 444
Query 100 CTTTCTCGAATGGAATACGTGCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGATTGG 173
||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 445 CTTTCTCGAATGGAGTATGTACACTCAAAGAATCTTATTTACCGAGATGTCAAACCAGAGAACTTCTTGATTGG 518
Query 174 TCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTTGGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCG 247
.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.|
Sbjct 519 CCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTAATACACATTATAGATTTTGGACTGGCCAAGGAATATGTTGATCCTG 592
Query 248 AAACCAAAAAACACATACCTTATAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACACG 321
||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 AAACCAAAAAACACATACCTTACAGAGAGCACAAAAGTTTGACTGGAACTGCGAGATACATGTCTATCAACACA 666
Query 322 CATCTTGGCAAAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAAGCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGG 395
|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 667 CATCTAGGCAAAGAGCAAAGCCGGCGAGATGATTTGGAAGCCTTAGGCCATATGTTCATGTACTTCCTCCGAGG 740
Query 396 CAGCCTCCCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATTGGTGACACCAAAAGGA 469
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 741 CAGCCTACCCTGGCAAGGACTCAAGGCTGATACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAATCGGTGATACCAAAAGGA 814
Query 470 ATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACTG 543
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 815 ATACTCCCATCGAAGCTCTCTGTGAGAACTTTCCAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGATTA 888
Query 544 GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACAC 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||..|||||||||.||
Sbjct 889 GACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAGATCTGTTTGAACGGAAAGGCTATAC 962
Query 618 CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGGAGACCTATTCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGATTCTGGTG 691
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 CTTTGACTATGCCTATGATTGGGTTGGAAGGCCTATTCCTACTCCAGTAGGATCAGTTCATGTAGATTCTGGTG 1036
Query 692 CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGCCATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAATCAGGTG 765
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1037 CATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACACAGGGATCGGCCATCACAACAACAGCCTCTTAGAAATCAGGTG 1110
Query 766 GTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATCCCACGGGAGCCCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCA 839
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTTAGCTCAACCAATGGAGAGCTGAATGTCGATGACCCCACTGGAGCTCACTCCAATGCACCAATCACAGCTCA 1184
Query 840 TGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAA------------------------GTGCTGCTGTTTCTTTAAGA 889
||||||.||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGCCGAAGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAACTGCCTGAAAATGCTCAACCTGTGGTGCTGCTGTTTCTTTAAGA 1258
Query 890 GGAAAAGGAAGAAGACTGCTCAGCGCCACAAG 921
||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1259 GGAAAAGGAAGAAGACAGCCCAGCGACACAAG 1290