Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479837
• Subject: XM_011528123.1
• Aligned Length: 1344
• Identities: 1208
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGGCCTCTGCCCTGAGGCCACCCCGTGTCCCCAAGCCTAAGGGTGTCCTGCCTTCACACTACTATGAGAGCTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTCTGCCCTGAGGCCACCCCGTGTCCCCAAGCCTAAGGGTGTCCTGCCTTCACACTACTATGAGAGCTT  74

Query   75  TCTAGAGAAGAAGGGGCCCTGTGACCGGGATTACAAGAAGTTCTGGGCAGGCCTGCAGGGTCTCACCATTTATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTAGAGAAGAAGGGGCCCTGTGACCGGGATTACAAGAAGTTCTGGGCAGGCCTGCAGGGTCTCACCATTTATT  148

Query  149  TCTACAATAGCAATCGGGACTTCCAGCACGTGGAGAAGCTCAACTTGGGAGCATTTGAGAAACTCACAGATGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTACAATAGCAATCGGGACTTCCAGCACGTGGAGAAGCTCAACTTGGGAGCATTTGAGAAACTCACAGATGAG  222

Query  223  ATTCCCTGGGGAAGCTCACGTGACCCTGGCACCCACTTCAGCCTGATTCTCCGGAATCAGGAGATCAAGTTCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTCCCTGGGGAAGCTCACGTGACCCTGGCACCCACTTCAGCCTGATTCTCCGGGATCAGGAGATCAAGTTCAA  296

Query  297  GGTAGAGACCTTGGAGTGTCGGGAAATGTGGAAAGGCTTCATCTTAACGGTGGTGGAGCTCCGTGTCCCGACCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTAGAGACCTTGGAGTGTCGGGAAATGTGGAAAGGCTTCATCTTAACGGTGGTGGAGCTCCGTGTCCCGACCG  370

Query  371  ACTTGACCCTGCTTCCTGGGCACCTATACATGATGTCTGAAGTCTTGGCCAAAGAGGAGGCGCGCCGTGCACTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTTGACCCTGCTTCCTGGGCACCTATACATGATGTCTGAAGTCTTGGCCAAAGAGGAGGCGCGCCGTGCACTG  444

Query  445  GAGACACCCTCGTGCTTCCTGAAGGTGAGCCGGCTGGAGGCACAACTGCTCCTGGAGCGCTACCCCGAGTGCGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGACACCCTCGTGCTTCCTGAAGGTGAGCCGGCTGGAGGCACAACTGCTCCTGGAGCGCTACCCCGAGTGCGG  518

Query  519  GAACCTGCTGCTGCGGCCCAGCGGGGACGGCGCCGACGGCGTGTCGGTCACCACGCGGCAGATGCACAACGGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAACCTGCTGCTGCGGCCCAGCGGGGACGGCGCCGACGGCGTGTCGGTCACCACGCGGCAGATGCACAACGGGA  592

Query  593  CGCACGTGGTCCGGCATTACAAGGTGAAGCGGGAGGGCCCCAAGTACGTGATCGATGTGGAACAGCCGTTCTCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGCACGTGGTCCGGCATTACAAGGTGAAGCGGGAGGGCCCCAAGTACGTGATCGATGTGGAACAGCCGTTCTCT  666

Query  667  TGCACCTCCCTGGACGCCGTGGTCAACTATTTCGTGTCGCATACCAAAAAGGCGCTGGTGCCATTCCTGTTAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGCACCTCCCTGGACGCCGTGGTCAACTATTTCGTGTCGCATACCAAAAAGGCGCTGGTGCCATTCCTGTTAGA  740

Query  741  CGAGGACTACGAGAAGGTGCTAGGCTACGTGGAAGCCGATAAGGAGAATGGCGAGAATGTGTGGGTGGCGCCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGAGGACTACGAGAAGGTGCTAGGCTACGTGGAAGCCGATAAGGAGAATGGCGAGAATGTGTGGGTGGCGCCCT  814

Query  815  CCGCTCCGGGCCCAGGTCCTGCACCCTGCACAGGTGGCCCCAAGCCGCTGTCACCTGCGTCTAGCCAGGACAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCGCTCCGGGCCCAGGTCCTGCACCCTGCACAGGTGGCCCCAAGCCGCTGTCACCTGCGTCTAGCCAGGACAAG  888

Query  889  CTGCCCCCACTGCCCCCACTACCGAACCAGGAAGAGAACTACGTGACCCCCATTGGAGATGGCCCAGCTGTTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGCCCCCACTGCCCCCACTACCGAACCAGGAAGAGAACTACGTGACCCCCATTGGAGATGGCCCAGCTGTTGA  962

Query  963  CTATGAGAACCAAGATGTGGCTTCCTCTAGTTGGCCAGTCATCCTGAAGCCAAAGAAGTTGCCAAAGCCTCCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTATGAGAACCAAGATGTGGCTTCCTCTAGTTGGCCAGTCATCCTGAAGCCAAAGAAGTTGCCAAAGCCTCCTG  1036

Query 1037  CCAAGCTTCCAAAGCCACCCGTTGGACCCAAG------------------------------------------  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct 1037  CCAAGCTTCCAAAGCCACCCGTTGGACCCAAGCCAGAGAAGGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAA  1110

Query 1069  --------------------------------------------------------------------------  1068
                                                                                      
Sbjct 1111  CTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACCACACCTG  1184

Query 1069  -------------------CCAGAGCCCAAAGTCTTTAATGGTGGCTTGGGCAGGAAGCTGCCAGTCAGTTCAG  1123
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCTCATCTGTCTTCTCTTCCAGAGCCCAAAGTCTTTAATGGTGGCTTGGGCAGGAAGCTGCCAGTCAGTTCAG  1258

Query 1124  CCCAGCCTCTCTTCCCCACAGCCGGGCTGGCAGACATGACGGCAGAGCTACAGAAGAAGCTGGAGAAGAGGCGG  1197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCAGCCTCTCTTCCCCACAGCCGGGCTGGCAGACATGACGGCAGAGCTACAGAAGAAGCTGGAGAAGAGGCGG  1332

Query 1198  GCACTGGAGCAC  1209
            ||||||||||||
Sbjct 1333  GCACTGGAGCAC  1344