Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479864
- Subject:
- XM_017011667.1
- Aligned Length:
- 1558
- Identities:
- 1215
- Gaps:
- 329
Alignment
Query 1 ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA 74
Query 75 TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG 148
Query 149 ACAGAGTCGTGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT 222
||||||||||| ||||.| .|||||
Sbjct 149 ACAGAGTCGTG---------GTTACA------------------------TATGGG------------------ 171
Query 223 GGGGAAGAATGTGCGGAGGA-TTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACC 295
||.||.|| ||||
Sbjct 172 ------------GCTGATGACTTTA------------------------------------------------- 184
Query 296 AAGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGG 369
||||.||..|.|||.| |.||||.|| ||||.|
Sbjct 185 -------------------GGGATTTCCATGCAAT--AATTCCCAA-------------------ATCTTT--- 215
Query 370 ATCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAA 443
|.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 -----------------------------------------------CTCTCGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAA 242
Query 444 TCAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCT 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 TCAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCT 316
Query 518 TCAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCC--- 588
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 TCAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTT 390
Query 589 -------------------------------------------------------------------------- 588
Sbjct 391 GGTAAACCTCACAAATGTGGATATTGTGGCCGAAGCTATAAACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAACATAAAGAGCG 464
Query 589 -------------------------------------------------GTCATTAAAGAAGAAACTAATCACA 613
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465 CTGCCACAACTACTTGGAAAGCATGGGCCTTCCGGGCACACTGTACCCAGTCATTAAAGAAGAAACTAATCACA 538
Query 614 GTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTC 687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 GTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTC 612
Query 688 GCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAG 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 613 GCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAG 686
Query 762 CGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACT 835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 687 CGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACT 760
Query 836 ACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGC 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 ACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGC 834
Query 910 CCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGT 983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 CCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGT 908
Query 984 GGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCC 1057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 909 GGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCC 982
Query 1058 AAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCC 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 983 AAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCC 1056
Query 1132 CCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAA 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 CCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAA 1130
Query 1206 CTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGG 1279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 CTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGG 1204
Query 1280 TGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAAC 1353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1205 TGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAAC 1278
Query 1354 ATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACAT 1427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279 ATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACAT 1352
Query 1428 GAGC 1431
||||
Sbjct 1353 GAGC 1356