Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479876
- Subject:
- XM_017314419.1
- Aligned Length:
- 1107
- Identities:
- 787
- Gaps:
- 237
Alignment
Query 1 ATGTTTTGTGTGACGCCACCTGAATTAGAAACCAAGATGAACATAACCAAAGGTGGTCTGGTGTTGTTTTCAGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AAACTCGAATTCATCATGTATGGAGCTATCAAAGAAAATTGCAGAGCGGCTAGGGGTGGAGATGGGCAAAGTGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGTTTACCAGGAACCTAACAGAGAAACAAGAGTACAAATTCAAGAGTCTGTGAGGGGAAAAGATGTTTTCATC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATCCAAACTGTTTCGAAGGACGTGAACACCACCATCATGGAGCTCCTGATCATGGTGTATGCATGTAAGACCTC 296
|.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------ATGGACGTGAACACCACCATCATGGAGCTGCTGATCATGGTATATGCATGTAAGACCTC 59
Query 297 TTGTGCCAAGAGCATCATTGGCGTGATACCCTACTTTCCTTACAGCAAGCAGTGCAAGATGAGAAAAAGAGGCT 370
.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 60 ATGTGCCAAGAGCATCATCGGAGTGATCCCCTACTTTCCTTATAGCAAGCAATGCAAAATGAGAAAAAGGGGCT 133
Query 371 CCATTGTCTCTAAATTGCTGGCTTCCATGATGTGCAAAGCTGGTCTAACTCATCTTATTACTATGGATTTACAC 444
||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 134 CCATTGTCTCAAAATTGCTGGCTTCTATGATGTGCAAAGCTGGTCTGACTCATCTCATCACTATGGATTTACAC 207
Query 445 CAGAAGGAAATTCAGGGCTTCTTCAATATTCCTGTTGACAATTTAAGAGCATCTCCCTTCTTATTACAGTATAT 518
|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.|||||.|||||
Sbjct 208 CAGAAGGAAATCCAGGGCTTCTTCAATATTCCAGTGGATAATTTAAGAGCCTCCCCATTCCTGTTACAATATAT 281
Query 519 TCAAGAAGAGATCCCAGATTACAGGAATGCAGTAATCGTGGCCAAGTCTCCAGCCTCGGCGAAGAGGGCACAGT 592
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 282 TCAAGAAGAGATCCCAGATTATAGGAATGCAGTCATCGTGGCCAAGTCTCCAGCCTCAGCCAAGAGGGCACAAT 355
Query 593 CTTTTGCTGAGCGCCTGCGCCTGGGAATTGCAGTGATTCATGGAGAGGCGCAGGATGCCGAGTCGGACTTGGTG 666
|||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 356 CTTTTGCAGAGCGTCTACGTCTGGGAATCGCAGTGATCCATGGAGAAGCACAGGATGCTGAGTCTGACTTGGTG 429
Query 667 GATGGACGGCATTCCCCACCCATGGTCAGAAGTGTGGCTGCCATCCACCCCAGCCTGGAGATCCCCATGCTGAT 740
|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 430 GATGGCCGGCACTCCCCACCAATGGTCAGGAGTGTAGCTGCCATCCATCCCAGCCTGGAGATCCCGATGCTGAT 503
Query 741 TCCTAAAGAAAAGCCCCCAATCACGGTTGTGGGTGATGTTGGAGGAAGGATTGCCATCATCGTGGATGACATCA 814
|||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 504 TCCTAAAGAGAAGCCCCCAATCACAGTTGTTGGTGATGTTGGAGGAAGAATCGCCATCATTGTGGATGACATTA 577
Query 815 TTGATGATGTTGACAGCTTTCTTGCTGCAGCAGAGACCCTGAAGGAAAGAGGTGCATATAAGATCTTTGTGATG 888
||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 578 TTGATGATGTGGATAGCTTTCTTGCTGCAGCAGAGACCCTGAAGGAAAGAGGTGCATACAAGATCTTTGTGATG 651
Query 889 GCAACTCATGGCTTGTTGTCTTCTGACGCCCCCCGGCGGATTGAAGAGTCTGCCATTGATGAGGTGGTGGTCAC 962
||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 GCCACTCACGGCTTGTTATCCTCTGATGCTCCCCGGCTGATTGAAGAGTCTGCCATTGATGAGGTGGTGGTCAC 725
Query 963 CAATACAATTCCACATGAAGTCCAGAAGCTCCAGTGCCCCAAGATTAAAACTGTGGATATCAGCATGATCCTTT 1036
.||.||.||.|||||.||..||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 726 TAACACGATCCCACACGAGATCCAGAAGCTGCAGTGCCCCAAGATCAAGACTGTGGACATCAGCATGATCCTCT 799
Query 1037 CAGAGGCGATCCGTCGGATCCACAATGGGGAGTCCATGTCCTACCTTTTCAGAAACATAGGCTTAGATGAC 1107
||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 CAGAAGCCATCCGCCGAATTCACAACGGGGAGTCCATGTCCTACCTTTTCAGAAACATAGGCTTAGATGAC 870