Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479879
• Subject: XM_006507644.3
• Aligned Length: 762
• Identities: 685
• Gaps: 12

Alignment

Query   1  ATGTACCAGGTCCCACTACCACTGGATCGGGATGGGACCCTGGTACGGCTCCGCTTCACCATGGTGGCCCTGGT  74
           |||||||||||||||||..||.||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct   1  ATGTACCAGGTCCCACTGACATTGGACCGGGATGGGACCCTAGTCCGGCTCCGCTTCACTATGGTGGCCCTGAT  74

Query  75  CACGGTCTGCTGTCCACTTGTCGCCTTCCTCTTCTGCATCCTCTGGTCCCTGCTCTTCCACTTCAAGGAGACAA  148
           |||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  75  CACTGTCTGCTGTCCACTTGTCGCCTTCTTCTTCTGCATCCTGTGGTCCCTGCTCTTTCACTTCAAGGAGACAA  148

Query 149  CGGCCACACACTGTGGGGTGCCCAATTACCTGCCCTCGGTGAGCTCAGCCATCGGCGGGGAGGTGCCCCAGCGC  222
           |..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 149  CATCTACACACTGTGGGGTGCCCAATTACCTGCCATCAGTGAGCTCCGCCATTGGTGGGGAGGTCCCCCAACGC  222

Query 223  TACGTGTGGCGTTTCTGCATCGGCCTGCACTCGGCGCCTCGCTTCTTGGTGGCCTTCGCCTACTGGAACCACTA  296
           ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||...|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223  TACGTGTGGCGTTTCTGCATTGGCCTGCACTCGGCACCCCGCTTCTTGACAGCCTTCGCCTATTGGAACCACTA  296

Query 297  CCTCAGCTGCACCTCCCCGTGTTCCTGCTATCGCCCGCTCTGCCGCCTCAACTTCGGCCTCAATGTCGTGGAGA  370
           |||||||||..|.||.||.|||.|..|.||.||||..|||||||||.|.||||||.|.||||||||.|||||||
Sbjct 297  CCTCAGCTGTGCGTCTCCATGTCCGGGTTACCGCCTTCTCTGCCGCATTAACTTCAGTCTCAATGTGGTGGAGA  370

Query 371  ACCTCGCGTTGCTAGTGCTCACTTATGTCTCCTCCTCCGAGGACTTCACCATCCACGAAAATGCTTTCATTGTG  444
           ||||||||.||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ACCTCGCGCTGCTCGTGCTCACCTACGTCTCCTCCTCCGAGGACTTCACCATCCACGAAAATGCTTTCATTGTG  444

Query 445  TTCATTGCCTCATCCCTCGGGCACATGCTCCTCACCTGCATTCTCTGGCGGTTGACCAAGAAGCACACA-----  513
           ||.||.||..||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||     
Sbjct 445  TTTATCGCGGCATCCCTCGGTTACATGCTCCTCACCTGCATTCTCTGGCGGCTGACCAAGAAGCACACAGTAAG  518

Query 514  -------GATCGCAAGTCCTACAGCTGGAAACAGCGGCTCTTCATCATCAACTTCATCTCCTTCTTCTCGGCGC  580
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  TCAGGAGGATCGCAAGTCCTACAGCTGGAAACAGCGGCTCTTCGTCATCAACTTCATCTCCTTCTTCTCGGCGC  592

Query 581  TGGCTGTCTACTTTCGGCACAACATGTATTGTGAGGCTGGAGTGTACACCATCTTTGCCATCCTGGAGTACACT  654
           |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TGGCTGTCTACTTCCGGCACAACATGTATTGTGAGGCTGGAGTGTATACCATCTTTGCCATCCTGGAGTACACT  666

Query 655  GTTGTCTTAACCAACATGGCGTTCCACATGACGGCCTGGTGGGACTTCGGGAACAAGGAGCTGCTCATAACCTC  728
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 667  GTTGTCCTAACCAACATGGCGTTCCACATGACAGCCTGGTGGGACTTCGGGAACAAAGAGCTGCTAATAACCTC  740

Query 729  TCAGCCTGAGGAAAAGCGATTC  750
           ||||||||||||||||.|||||
Sbjct 741  TCAGCCTGAGGAAAAGAGATTC  762