Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479920
• Subject: NM_173064.3
• Aligned Length: 1560
• Identities: 1473
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGCCCGAGCGCTGGGGCCCCCTGCTCCTGTGCCTGCTGCAGGCCGCTCCAGGGAGGCCCCGTCTGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGGGCCCGAGCGCTGGGGCCCCCTGCTCCTGTGCCTGCTGCAGGCCGCTCCAGGGAGGCCCCGTCTGGC  74

Query   75  CCCTCCCCAGAATGTGACGCTGCTCTCCCAGAACTTCAGCGTGTACCTGACATGGCTCCCAGGGCTTGGCAACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCTCCCCAGAATGTGACGCTGCTCTCCCAGAACTTCAGCGTGTACCTGACATGGCTCCCAGGGCTTGGCAACC  148

Query  149  CCCAGGATGTGACCTATTTTGTGGCCTATCAGAGCTCTCCCACCCGTAGACGGTGGCGCGAAGTGGAAGAGTGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCAGGATGTGACCTATTTTGTGGCCTATCAGAGCTCTCCCACCCGTAGACGGTGGCGCGAAGTGGAAGAGTGT  222

Query  223  GCGGGAACCAAGGAGCTGCTATGTTCTATGATGTGCCTGAAGAAACAGGACCTGTACAACAAGTTCAAGGGACG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCGGGAACCAAGGAGCTGCTATGTTCTATGATGTGCCTGAAGAAACAGGACCTGTACAACAAGTTCAAGGGACG  296

Query  297  CGTGCGGACGGTTTCTCCCAGCTCCAAGTCCCCCTGGGTGGAGTCCGAATACCTGGATTACCTTTTTGAAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTGCGGACGGTTTCTCCCAGCTCCAAGTCCCCCTGGGTGGAGTCCGAATACCTGGATTACCTTTTTGAAGTGG  370

Query  371  AGCCGGCCCCACCTGTCCTGGTGCTCACCCAGACGGAGGAGATCCTGAGTGCCAATGCCACGTACCAGCTGCCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCCGGCCCCACCTGTCCTGGTGCTCACCCAGACGGAGGAGATCCTGAGTGCCAATGCCACGTACCAGCTGCCC  444

Query  445  CCCTGCATGCCCCCACTGGATCTGAAGTATGAGGTGGCATTCTGGAAGGAGGGGGCCGGAAACAAGACCCTATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCTGCATGCCCCCACTGGATCTGAAGTATGAGGTGGCATTCTGGAAGGAGGGGGCCGGAAACAAGACCCTATT  518

Query  519  TCCAGTCACTCCCCATGGCCAGCCAGTCCAGATCACTCTCCAGCCAGCTGCCAGCGAACACCACTGCCTCAGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCAGTCACTCCCCATGGCCAGCCAGTCCAGATCACTCTCCAGCCAGCTGCCAGCGAACACCACTGCCTCAGTG  592

Query  593  CCAGAACCATCTACACGTTCAGTGTCCCGAAATACAGCAAGTTCTCTAAGCCCACCTGCTTCTTGCTGGAGGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGAACCATCTACACGTTCAGTGTCCCGAAATACAGCAAGTTCTCTAAGCCCACCTGCTTCTTGCTGGAGGTC  666

Query  667  CCAGAAGCCAACTGGGCTTTCCTGGTGCTGCCATCGCTTCTGATACTGCTGTTAGTAATTGCCGCAGGGGGTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAGAAGCCAACTGGGCTTTCCTGGTGCTGCCATCGCTTCTGATACTGCTGTTAGTAATTGCCGCAGGGGGTGT  740

Query  741  GATCTGGAAGACCCTCATGGGGAACCCCTGGTTTCAGCGGGCAAAGATGCCACGGGCCCTGGACTTTTCTGGAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct  741  GATCTGGAAGACCCTCATGGGGAACCCCTGGTTTCAGCGGGCAAAGATGCCACGGGCCCT--------------  800

Query  815  ACACACACCCTGTGGCAACCTTTCAGCCCAGCAGACCAGAGTCCGTGAATGACTTGTTCCTCTGTCCCCAAAAG  888
                                                                                     |
Sbjct  801  -------------------------------------------------------------------------G  801

Query  889  GAACTGACCAGAGGGGTCAGGCCGACGCCTCGAGTCAGGGCCCCAGCCACCCAACAGACAAGATGGAAGAAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  GAACTGACCAGAGGGGTCAGGCCGACGCCTCGAGTCAGGGCCCCAGCCACCCAACAGACAAGATGGAAGAAGGA  875

Query  963  CCTTGCAGAGGACGAAGAGGAGGAGGATGAGGAGGACACAGAAGATGGCGTCAGCTTCCAGCCCTACATTGAAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  CCTTGCAGAGGACGAAGAGGAGGAGGATGAGGAGGACACAGAAGATGGCGTCAGCTTCCAGCCCTACATTGAAC  949

Query 1037  CACCTTCTTTCCTGGGGCAAGAGCACCAGGCTCCAGGGCACTCGGAGGCTGGTGGGGTGGACTCAGGGAGGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  CACCTTCTTTCCTGGGGCAAGAGCACCAGGCTCCAGGGCACTCGGAGGCTGGTGGGGTGGACTCAGGGAGGCCC  1023

Query 1111  AGGGCTCCTCTGGTCCCAAGCGAAGGCTCCTCTGCTTGGGATTCTTCAGACAGAAGCTGGGCCAGCACTGTGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  AGGGCTCCTCTGGTCCCAAGCGAAGGCTCCTCTGCTTGGGATTCTTCAGACAGAAGCTGGGCCAGCACTGTGGA  1097

Query 1185  CTCCTCCTGGGACAGGGCTGGGTCCTCTGGCTATTTGGCTGAGAAGGGGCCAGGCCAAGGGCCGGGTGGGGATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  CTCCTCCTGGGACAGGGCTGGGTCCTCTGGCTATTTGGCTGAGAAGGGGCCAGGCCAAGGGCCGGGTGGGGATG  1171

Query 1259  GGCACCAAGAATCTCTCCCACCACCTGAATTCTCCAAGGACTCGGGTTTCCTGGAAGAGCTCCCAGAAGATAAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  GGCACCAAGAATCTCTCCCACCACCTGAATTCTCCAAGGACTCGGGTTTCCTGGAAGAGCTCCCAGAAGATAAC  1245

Query 1333  CTCTCCTCCTGGGCCACCTGGGGCACCTTACCACCGGAGCCGAATCTGGTCCCTGGGGGACCCCCAGTTTCTCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246  CTCTCCTCCTGGGCCACCTGGGGCACCTTACCACCGGAGCCGAATCTGGTCCCTGGGGGACCCCCAGTTTCTCT  1319

Query 1407  TCAGACACTGACCTTCTGCTGGGAAAGCAGCCCTGAGGAGGAAGAGGAGGCGAGGGAATCAGAAATTGAGGACA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320  TCAGACACTGACCTTCTGCTGGGAAAGCAGCCCTGAGGAGGAAGAGGAGGCGAGGGAATCAGAAATTGAGGACA  1393

Query 1481  GCGATGCGGGCAGCTGGGGGGCTGAGAGCACCCAGAGGACCGAGGACAGGGGCCGGACATTGGGGCATTACATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394  GCGATGCGGGCAGCTGGGGGGCTGAGAGCACCCAGAGGACCGAGGACAGGGGCCGGACATTGGGGCATTACATG  1467

Query 1555  GCCAGG  1560
            ||||||
Sbjct 1468  GCCAGG  1473