Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479920
• Subject: XM_006710394.4
• Aligned Length: 1571
• Identities: 1439
• Gaps: 115

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGCCCGAGCGCTGGGGCCCCCTGCTCCTGTGCCTGCTGCAGGCCGCTCCAGGGAGGCCCCGTCTGGC  74
                                                                    |.||||            
Sbjct    1  --------------------------------------------------------ATGGAG------------  6

Query   75  CCCTCCCCAGAATGTG-ACGCTGCT----CTCCCAGAAC-TTCAGCGTGTACCTGACATGGCTCCCAGGGCTTG  142
                  ||||||.|.| ||.|.|.|    ||||   ||| ||     |||.||        ||.||.|   |||
Sbjct    7  ------CCAGAAGGGGAACTCGGGTCCGACTCC---AACATT-----TGTGCC--------CTTCCTG---TTG  55

Query  143  GCAACCCCCAGGATGTGA-CCTAT---TTTGTGGCCTAT-CAGAGCTCTCCCACCCGTAGACGGTGGCGCGAAG  211
                    ||..|.||.| ||| |   |.|||||  .|| ||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   56  --------CATCACGTCATCCT-TCCATGTGTGG--AATCCACATCTCTCCCACCCGTAGACGGTGGCGCGAAG  118

Query  212  TGGAAGAGTGTGCGGGAACCAAGGAGCTGCTATGTTCTATGATGTGCCTGAAGAAACAGGACCTGTACAACAAG  285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  119  TGGAAGAGTGTGCGGGAACCAAGGAGCTGCTATGTTCTATGATGTGCCTGAAGAAACAGGACCTGTACAACAAG  192

Query  286  TTCAAGGGACGCGTGCGGACGGTTTCTCCCAGCTCCAAGTCCCCCTGGGTGGAGTCCGAATACCTGGATTACCT  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  193  TTCAAGGGACGCGTGCGGACGGTTTCTCCCAGCTCCAAGTCCCCCTGGGTGGAGTCCGAATACCTGGATTACCT  266

Query  360  TTTTGAAGTGGAGCCGGCCCCACCTGTCCTGGTGCTCACCCAGACGGAGGAGATCCTGAGTGCCAATGCCACGT  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  267  TTTTGAAGTGGAGCCGGCCCCACCTGTCCTGGTGCTCACCCAGACGGAGGAGATCCTGAGTGCCAATGCCACGT  340

Query  434  ACCAGCTGCCCCCCTGCATGCCCCCACTGGATCTGAAGTATGAGGTGGCATTCTGGAAGGAGGGGGCCGGAAAC  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  341  ACCAGCTGCCCCCCTGCATGCCCCCACTGGATCTGAAGTATGAGGTGGCATTCTGGAAGGAGGGGGCCGGAAAC  414

Query  508  AAGACCCTATTTCCAGTCACTCCCCATGGCCAGCCAGTCCAGATCACTCTCCAGCCAGCTGCCAGCGAACACCA  581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  AAGACCCTATTTCCAGTCACTCCCCATGGCCAGCCAGTCCAGATCACTCTCCAGCCAGCTGCCAGCGAACACCA  488

Query  582  CTGCCTCAGTGCCAGAACCATCTACACGTTCAGTGTCCCGAAATACAGCAAGTTCTCTAAGCCCACCTGCTTCT  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  CTGCCTCAGTGCCAGAACCATCTACACGTTCAGTGTCCCGAAATACAGCAAGTTCTCTAAGCCCACCTGCTTCT  562

Query  656  TGCTGGAGGTCCCAGAAGCCAACTGGGCTTTCCTGGTGCTGCCATCGCTTCTGATACTGCTGTTAGTAATTGCC  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  563  TGCTGGAGGTCCCAGAAGCCAACTGGGCTTTCCTGGTGCTGCCATCGCTTCTGATACTGCTGTTAGTAATTGCC  636

Query  730  GCAGGGGGTGTGATCTGGAAGACCCTCATGGGGAACCCCTGGTTTCAGCGGGCAAAGATGCCACGGGCCCTGGA  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  GCAGGGGGTGTGATCTGGAAGACCCTCATGGGGAACCCCTGGTTTCAGCGGGCAAAGATGCCACGGGCCCTGGA  710

Query  804  CTTTTCTGGACACACACACCCTGTGGCAACCTTTCAGCCCAGCAGACCAGAGTCCGTGAATGACTTGTTCCTCT  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  CTTTTCTGGACACACACACCCTGTGGCAACCTTTCAGCCCAGCAGACCAGAGTCCGTGAATGACTTGTTCCTCT  784

Query  878  GTCCCCAAAAGGAACTGACCAGAGGGGTCAGGCCGACGCCTCGAGTCAGGGCCCCAGCCACCCAACAGACAAGA  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  GTCCCCAAAAGGAACTGACCAGAGGGGTCAGGCCGACGCCTCGAGTCAGGGCCCCAGCCACCCAACAGACAAGA  858

Query  952  TGGAAGAAGGACCTTGCAGAGGACGAAGAGGAGGAGGATGAGGAGGACACAGAAGATGGCGTCAGCTTCCAGCC  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  859  TGGAAGAAGGACCTTGCAGAGGACGAAGAGGAGGAGGATGAGGAGGACACAGAAGATGGCGTCAGCTTCCAGCC  932

Query 1026  CTACATTGAACCACCTTCTTTCCTGGGGCAAGAGCACCAGGCTCCAGGGCACTCGGAGGCTGGTGGGGTGGACT  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  933  CTACATTGAACCACCTTCTTTCCTGGGGCAAGAGCACCAGGCTCCAGGGCACTCGGAGGCTGGTGGGGTGGACT  1006

Query 1100  CAGGGAGGCCCAGGGCTCCTCTGGTCCCAAGCGAAGGCTCCTCTGCTTGGGATTCTTCAGACAGAAGCTGGGCC  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007  CAGGGAGGCCCAGGGCTCCTCTGGTCCCAAGCGAAGGCTCCTCTGCTTGGGATTCTTCAGACAGAAGCTGGGCC  1080

Query 1174  AGCACTGTGGACTCCTCCTGGGACAGGGCTGGGTCCTCTGGCTATTTGGCTGAGAAGGGGCCAGGCCAAGGGCC  1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  AGCACTGTGGACTCCTCCTGGGACAGGGCTGGGTCCTCTGGCTATTTGGCTGAGAAGGGGCCAGGCCAAGGGCC  1154

Query 1248  GGGTGGGGATGGGCACCAAGAATCTCTCCCACCACCTGAATTCTCCAAGGACTCGGGTTTCCTGGAAGAGCTCC  1321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  GGGTGGGGATGGGCACCAAGAATCTCTCCCACCACCTGAATTCTCCAAGGACTCGGGTTTCCTGGAAGAGCTCC  1228

Query 1322  CAGAAGATAACCTCTCCTCCTGGGCCACCTGGGGCACCTTACCACCGGAGCCGAATCTGGTCCCTGGGGGACCC  1395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  CAGAAGATAACCTCTCCTCCTGGGCCACCTGGGGCACCTTACCACCGGAGCCGAATCTGGTCCCTGGGGGACCC  1302

Query 1396  CCAGTTTCTCTTCAGACACTGACCTTCTGCTGGGAAAGCAGCCCTGAGGAGGAAGAGGAGGCGAGGGAATCAGA  1469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303  CCAGTTTCTCTTCAGACACTGACCTTCTGCTGGGAAAGCAGCCCTGAGGAGGAAGAGGAGGCGAGGGAATCAGA  1376

Query 1470  AATTGAGGACAGCGATGCGGGCAGCTGGGGGGCTGAGAGCACCCAGAGGACCGAGGACAGGGGCCGGACATTGG  1543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  AATTGAGGACAGCGATGCGGGCAGCTGGGGGGCTGAGAGCACCCAGAGGACCGAGGACAGGGGCCGGACATTGG  1450

Query 1544  GGCATTACATGGCCAGG  1560
            |||||||||||||||||
Sbjct 1451  GGCATTACATGGCCAGG  1467