Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479986
- Subject:
- NM_001330057.1
- Aligned Length:
- 1755
- Identities:
- 1574
- Gaps:
- 174
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------------ATGTC 5
|||||
Sbjct 1 ATGGTGATTTTTACATCATTACACAGATATGTCATTTTCATTAGTTGTATCATTGTTATAAACTGGTATATGTC 74
Query 6 TCGAGTCCACGGTATGCACCCTAAAGAGACCACCCGTCAGCTGAGCTTAGCTGTGAAAGATGGTCTTATTGTCG 79
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCGAGTCCACGGTATGCACCCTAAAGAGACCACCCGTCAGCTGAGCTTAGCTGTGAAAGATGGTCTTATTGTCG 148
Query 80 AAACTCTAACAGTGGGCTGCAAAGGTTCAAAAGCTGGTATTGAACAAGAAGGATATTGGTTGCCAGGAGATGAG 153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAACTCTAACAGTGGGCTGCAAAGGTTCAAAAGCTGGTATTGAACAAGAAGGATATTGGTTGCCAGGAGATGAG 222
Query 154 ATTGACTGGGAAACAGAAAATCATGACTGGTATTGTTTTGAATGCCATTTGCCTGGAGAGGTGTTGATATGTGA 227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTGACTGGGAAACAGAAAATCATGACTGGTATTGTTTTGAATGCCATTTGCCTGGAGAGGTGTTGATATGTGA 296
Query 228 CCTGTGTTTTCGTGTGTATCATTCCAAGTGTTTGTCTGATGAGTTCAGGCTTAGAGACAGCAGTAGTCCCTGGC 301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTGTGTTTTCGTGTGTATCATTCCAAGTGTTTGTCTGATGAGTTCAGGCTTAGAGACAGCAGTAGTCCCTGGC 370
Query 302 AGTGCCCAGTTTGCAGGAGCATTAAGAAGAAGAATACAAACAAACAGGAGATGGGCACATACCTCAGATTCATT 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTGCCCAGTTTGCAGGAGCATTAAGAAGAAGAATACAAACAAACAGGAGATGGGCACATACCTCAGATTCATT 444
Query 376 GTCTCCCGCATGAAGGAGAGGGCTATAGATCTTAATAAAAAGGGGAAGGACAATAAACACCCGATGTACAGGAG 449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTCTCCCGCATGAAGGAGAGGGCTATAGATCTTAATAAAAAGGGGAAGGACAATAAACACCCGATGTACAGGAG 518
Query 450 GCTGGTGCACTCAGCTGTGGACGTTCCCACCATTCAAGAGAAAGTGAATGAAGGGAAATACCGAAGTTATGAAG 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGGTGCACTCAGCTGTGGACGTTCCCACCATTCAAGAGAAAGTGAATGAAGGGAAATACCGAAGTTATGAAG 592
Query 524 AGTTCAAAGCTGATGCCCAATTGCTTCTCCACAATACCGTGATTTTCTATGG---AGACAGTGAGCAAGCTGAC 594
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGTTCAAAGCTGATGCCCAATTGCTTCTCCACAATACCGTGATTTTCTATGGAGCAGACAGTGAGCAAGCTGAC 666
Query 595 ATTGCGAGGATGCTATATAAAGACACATGTCATGAGCTGGATGAACTGCAGCTTTGCAAGAATTGCTTTTACTT 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATTGCGAGGATGCTATATAAAGACACATGTCATGAGCTGGATGAACTGCAGCTTTGCAAGAATTGCTTTTACTT 740
Query 669 GTCAAATGCTCGTCCTGACAACTGGTTCTGTTATCCTTGTATACCTAATCATGAGCTGGTTTGGGCTAAAATGA 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTCAAATGCTCGTCCTGACAACTGGTTCTGTTATCCTTGTATACCTAATCATGAGCTGGTTTGGGCTAAAATGA 814
Query 743 AAGGTTTTGGGTTTTGGCCAGCCAAAGTCATGCAGAAAGAAGACAATCAAGTCGACGTTCGCTTCTTTGGCCAC 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGGTTTTGGGTTTTGGCCAGCCAAAGTCATGCAGAAAGAAGACAATCAAGTCGACGTTCGCTTCTTTGGCCAC 888
Query 817 CACCACCAGAGGGCCTGGATTCCTTCTGAAAACATTCAAGATATCACAGTCAACATTCATCGGCTGCACGTGAA 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CACCACCAGAGGGCCTGGATTCCTTCTGAAAACATTCAAGATATCACAGTCAACATTCATCGGCTGCACGTGAA 962
Query 891 GCGCAGTATGGGTTGGAAAAAGGCCTGTGATGAGCTGGAGCTGCATCAGCGTTTCCTACGAGAAGGGAGATTTT 964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCGCAGTATGGGTTGGAAAAAGGCCTGTGATGAGCTGGAGCTGCATCAGCGTTTCCTACGAGAAGGGAGATTTT 1036
Query 965 GGAAATCTAAGAATGAGGACCGAGGTGAGGAAGAGGCAGAATCCAGTATCTCCTCCACCAGTAATGAGCAGCTA 1038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGAAATCTAAGAATGAGGACCGAGGTGAGGAAGAGGCAGAATCCAGTATCTCCTCCACCAGTAATGAGCAGCTA 1110
Query 1039 AAGGTCACTCAAGAACCAAGAGCAAAGAAAGGACGACGTAATCAAAGTGTGGAGCCCAAAAAGGAAGAACCAGA 1112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGGTCACTCAAGAACCAAGAGCAAAGAAAGGACGACGTAATCAAAGTGTGGAGCCCAAAAAGGAAGAACCAGA 1184
Query 1113 GCCTGAAACAGAAGCAGTAAGTTCTAGCCAGGAAATACCCACGATGCCTCAGCCCATCGAAAAAGTCTCCGTGT 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCTGAAACAGAAGCAGTAAGTTCTAGCCAGGAAATACCCACGATGCCTCAGCCCATCGAAAAAGTCTCCGTGT 1258
Query 1187 CAACTCAGACAAAGAAGTTAAGTGCCTCTTCACCAAGAATGCTGCATCGGAGCACCCAGACCACAAACGACGGC 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAACTCAGACAAAGAAGTTAAGTGCCTCTTCACCAAGAATGCTGCATCGGAGCACCCAGACCACAAACGACGGC 1332
Query 1261 GTGTGTCAGAGCATGTGCCATGACAAATACACCAAGATCTTCAATGACTTCAAAGACCGGATGAAGTCGGACCA 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGTGTCAGAGCATGTGCCATGACAAATACACCAAGATCTTCAATGACTTCAAAGACCGGATGAAGTCGGACCA 1406
Query 1335 CAAGCGGGAGACAGAGCGTGTTGTCCGAGAAGCTCTGGAGAAGCTGCGTTCTGAAATGGAAGAAGAAAAGAGAC 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAAGCGGGAGACAGAGCGTGTTGTCCGAGAAGCTCTGGAGAAGCTGCGTTCTGAAATGGAAGAAGAAAAGAGAC 1480
Query 1409 AAGCTGTAAATAAAGCTGTAGCCAACATGCAGGGTGAGATGGACAGAAAATGTAAGCAAGTAAAGGAAAAGTGT 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGCTGTAAATAAAGCTGTAGCCAACATGCAGGGTGAGATGGACAGAAAATGTAAGCAAGTAAAGGAAAAGTGT 1554
Query 1483 AAGGAAGAATTTGTAGAAGAAATCAAGAAGCTGGCAACACAGCACAAGCAACTGATTTCTCAGACCAAGAAGAA 1556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAGGAAGAATTTGTAGAAGAAATCAAGAAGCTGGCAACACAGCACAAGCAACTGATTTCTCAGACCAAGAAGAA 1628
Query 1557 GCAGTGG----------GT------------AAATACCAGTCTTTTT--------------------------- 1581
||||||| || |..|||||.|..|..|
Sbjct 1629 GCAGTGGTGCTACAACTGTGAGGAGGAGGCCATGTACCACTGCTGCTGGAACACATCCTACTGCTCCATCAAGT 1702
Query 1582 ----------------------------------------------------- 1581
Sbjct 1703 GCCAGCAGGAGCACTGGCACGCGGAGCACAAGCGCACCTGCCGCCGGAAAAGA 1755