Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479986
- Subject:
- NM_001347473.1
- Aligned Length:
- 1806
- Identities:
- 1254
- Gaps:
- 387
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCACGTTTAACAAAAAGACGACAGGCGGATACAAAAGCTATCCAGCATCTTTGGGCAGCCATTGAAATTAT 74
Query 1 ----------------------------------------------ATGTCTCGAGTCCACGGTATGCACCCTA 28
|||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 75 CAGAAATCAGAAGCAGATTGCCAACATTGATCGTATTACAAAGTATATGTCCCGAGTCCACGGTATGCATCCCA 148
Query 29 AAGAGACCACCCGTCAGCTGAGCTTAGCTGTGAAAGATGGTCTTATTGTCGAAACTCTAACAGTGGGCTGCAAA 102
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGAGACCACCCGCCAGCTGAGCTTAGCTGTGAAAGATGGTCTTATTGTCGAAACTCTAACAGTGGGCTGCAAA 222
Query 103 GGTTCAAAAGCTGGTATTGAACAAGAAGGATATTGGTTGCCAGGAGATGAGATTGACTGGGAAACAGAAAATCA 176
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 223 GGTTCAAAAGCTGGTATTGAACAGGAAGGATATTGGTTACCAGGAGATGAGATT-------------------- 276
Query 177 TGACTGGTATTGTTTTGAATGCCATTTGCCTGGAGAGGTGTTGATATGTGACCTGTGTTTTCGTGTGTATCATT 250
Sbjct 277 -------------------------------------------------------------------------- 276
Query 251 CCAAGTGTTTGTCTGATGAGTTCAGGCTTAGAGACAGCAGTAGTCCCTGGCAGTGCCCAGTTTGCAGGAGCATT 324
||||||
Sbjct 277 --------------------------------------------------------------------AGCATT 282
Query 325 AAGAAGAAGAATACAAACAAACAGGAGATGGGCACATACCTCAGATTCATTGTCTCCCGCATGAAGGAGAGGGC 398
|||||||||.|..|.|||||.|||||.||||||||.|||.|.||.|||||.||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 283 AAGAAGAAGCACTCTAACAAGCAGGAAATGGGCACCTACTTGAGGTTCATCGTCTCCCGAATGAAGGAGCGGGC 356
Query 399 TATAGATCTTAATAAAAAGGGGAAGGACAATAAACACCCGATGTACAGGAGGCTGGTGCACTCAGCTGTGGACG 472
||||||.||||||||.||.||.|||||||.|||.||.||.||||||.||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 357 TATAGACCTTAATAAGAAAGGAAAGGACAGTAAGCATCCTATGTACCGGAGGCTGGTCCACTCAGCTGTTGACG 430
Query 473 TTCCCACCATTCAAGAGAAAGTGAATGAAGGGAAATACCGAAGTTATGAAGAGTTCAAAGCTGATGCCCAATTG 546
|.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||..||
Sbjct 431 TCCCTACCATACAAGAGAAGGTGAATGAGGGGAAGTACCGGAGTTACGAGGAGTTCAAGGCTGACGCACAGCTG 504
Query 547 CTTCTCCACAATACCGTGATTTTCTATGG---AGACAGTGAGCAAGCTGACATTGCGAGGATGCTATATAAAGA 617
|||||||||||.||.|||||.|||||||| ||||||||||||.||.||||||||..|||||.||||||||||
Sbjct 505 CTTCTCCACAACACAGTGATCTTCTATGGAGCAGACAGTGAGCAGGCGGACATTGCACGGATGTTATATAAAGA 578
Query 618 CACATGTCATGAGCTGGATGAACTGCAGCTTTGCAAGAATTGCTTTTACTTGTCAAATGCTCGTCCTGACAACT 691
|||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||..|||||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 579 CACGTGTCACGAGCTGGACGAGCTGCAGCTTTGCAAGAACTGCTTCTATCTGTCAAACGCACGGCCCGACAACT 652
Query 692 GGTTCTGTTATCCTTGTATACCTAATCATGAGCTGGTTTGGGCTAAAATGAAAGGTTTTGGGTTTTGGCCAGCC 765
|||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653 GGTTCTGCTACCCTTGCATACCTAATCATGAGCTGGTTTGGGCTAAAATGAAAGGTTTTGGGTTTTGGCCAGCC 726
Query 766 AAAGTCATGCAGAAAGAAGACAATCAAGTCGACGTTCGCTTCTTTGGCCACCACCACCAGAGGGCCTGGATTCC 839
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 727 AAAGTCATGCAGAAAGAAGACAATCAAGTGGATGTTCGCTTCTTTGGCCATCACCACCAGAGAGCCTGGATTCC 800
Query 840 TTCTGAAAACATTCAAGATATCACAGTCAACATTCATCGGCTGCACGTGAAGCGCAGTATGGGTTGGAAAAAGG 913
||||||||||||.||.||||||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 801 TTCTGAAAACATCCAGGATATCACGGTCAATGTTCACCGACTGCACGTGAAGCGCAGCATGGGCTGGAAGAAGG 874
Query 914 CCTGTGATGAGCTGGAGCTGCATCAGCGTTTCCTACGAGAAGGGAGATTTTGGAAATCTAAGAATGAGGACCGA 987
|||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 875 CCTGTGACGAGCTGGAACTGCATCAGCGCTTCCTCCGTGAAGGAAGGTTCTGGAAGTCTAAGAATGAGGACCGA 948
Query 988 GGTGAGGAAGAGGCAGAATCCAGTATCTCCTCCACCAGTAATGAGCAGCTAAAGGTCACTCAAGAACCAAGAGC 1061
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 949 GGTGAGGAAGAGGCAGAATCCAGTATCTCCTCCACCAGTAACGAGCAGCTGAAGGTCACTCAAGAGCCAAGAGC 1022
Query 1062 AAAGAAAGGACGACGTAATCAAAGTGTGGAGCCCAAAAAGGAAGAACCAGAGCCTGAAACAGAAGCAGTAAGTT 1135
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 1023 AAAGAAAGGACGACGTAATCAGAGTGTGGAGCCCAAAAAGGAAGAACCCGAGCCAGAAACGGAAGCAGTGAGTT 1096
Query 1136 CTAGCCAGGAAATACCCACGATGCCTCAGCCCATCGAAAAAGTCTCCGTGTCAACTCAGACAAAGAAGTTAAGT 1209
|.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|..||.||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1097 CCAGCCAGGAAATCCCCACAATGCCTCAGCCAATTGAGAGGGTGTCAGTGTCAACCCAGACCAAGAAGTTAAGT 1170
Query 1210 GCCTCTTCACCAAGAATGCTGCATCGGAGCACCCAGACCACAAACGACGGCGTGTGTCAGAGCATGTGCCATGA 1283
||||||||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||.||.|.|||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1171 GCCTCTTCCCCACGAATGCTGCATCGAAGCACTCAGACGACGAGCGACGGCGTCTGTCAGAGCATGTGCCACGA 1244
Query 1284 CAAATACACCAAGATCTTCAATGACTTCAAAGACCGGATGAAGTCGGACCACAAGCGGGAGACAGAGCGTGTTG 1357
|||.||||||||.||.||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||.|
Sbjct 1245 CAAGTACACCAAAATTTTTAATGACTTTAAAGACAGGATGAAGTCGGACCACAAGCGGGAAACAGAGAGAGTGG 1318
Query 1358 TCCGAGAAGCTCTGGAGAAGCTGCGTTCTGAAATGGAAGAAGAAAAGAGACAAGCTGTAAATAAAGCTGTAGCC 1431
||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 1319 TCCGTGAAGCGCTGGAAAAGTTGCGTTCTGAAATGGAAGAAGAAAAAAGACAGGCCGTGAACAAAGCTGTGGCC 1392
Query 1432 AACATGCAGGGTGAGATGGACAGAAAATGTAAGCAAGTAAAGGAAAAGTGTAAGGAAGAATTTGTAGAAGAAAT 1505
|.|.|||||||.||.|||||||||||..|||||||..|.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1393 AGCCTGCAGGGCGACATGGACAGAAAGGGTAAGCAGCTGAAGGAGAAGTGCAAGGAAGAGTTTGTAGAGGAGAT 1466
Query 1506 CAAGAAGCTGGCAACACAGCACAAGCAACTGATTTCTCAGACCAAGAAGAAGCAGTGG----------GT---- 1565
|||||||||.||..|.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1467 CAAGAAGCTAGCGGCGCAGCACAAGCAGCTCATTTCCCAGACCAAGAAGAAGCAGTGGTGCTACAACTGTGAGG 1540
Query 1566 --------AAATACCA---------------GTCTTTTT----------------------------------- 1581
|..||||| |||.|..|
Sbjct 1541 AGGAGGCCATGTACCACTGCTGCTGGAACACGTCCTACTGCTCCATCAAGTGCCAGCAGGAGCACTGGCACGCA 1614
Query 1582 ------------------------------ 1581
Sbjct 1615 GAGCACAAGCGCACCTGCCGCCGGAAGAGA 1644