Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480014
• Subject: NM_001190975.1
• Aligned Length: 2692
• Identities: 2042
• Gaps: 329

Alignment

Query    1  ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTTGGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCAT  74
                                 ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||  |
Sbjct    1  ---------------------ATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGGTTGGCGCTGTGCTGCTGGGGGTG--T  51

Query   75  G--GCCCCCAGGGGCACGCAGGCTGA---AGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCCG  143
            |  ||||..|.||.|||.|||.|.||   .|..||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   52  GCAGCCCATAAGGACACACAGACCGAGGCTGGCAGCCCGTTTGTGGGGAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCAG  125

Query  144  GGGACTCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCCCCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATG  217
            .|||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||....||||||||.||||
Sbjct  126  AGGACTCACGGGGACACTTCGGTGTGAGCTCCAGGTTCAGGGGGAACCCCCTGAGGTGGTGTGGCTTCGAGATG  199

Query  218  GACAGATCCTGGAGCTCGCGGACAGCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGA-TGAACAGGATGACTGGAT  290
            ||||||||||.||.||.||.||.|.||||||||||||||||||.|||||.||.|| || .||.|||||.||||.
Sbjct  200  GACAGATCCTAGAACTGGCTGATAACACCCAGACCCAGGTGCCTCTGGGCGAAGACTG-GCAAGATGAATGGAA  272

Query  291  AGTGGTCAGCCAGCTCAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGA--CACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCT  362
            |||.|||||.||||||||||||.|..|||||||.|||||.||  ||.|||  |||||||||||.|||||..|||
Sbjct  273  AGTTGTCAGTCAGCTCAGAATCTCAGCCCTGCAACTTTCAGATGCAGGGG--AGTACCAGTGTATGGTGCATCT  344

Query  363  GGGACATCAGACCTTCGTGTCCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGCTTGCCTTACTTCCTGGAGGAGCCCG  436
            .|.|...|.||||||.|||||.|||||.||||.|||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  345  AGAAGGACGGACCTTTGTGTCTCAGCCGGGCTTTGTAGGGCTGGAAGGTCTCCCGTACTTCCTGGAGGAGCCTG  418

Query  437  AAGACAGGACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCTGAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGAC  510
            |.||||...|||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||..|
Sbjct  419  AGGACAAAGCTGTGCCTGCCAACACCCCTTTCAACCTAAGCTGCCAGGCCCAGGGACCCCCGGAACCCGTGACC  492

Query  511  CTACTCTGGCTCCAGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTC-CAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGCCTGCATGTTC  583
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.| || ||||.|||.||.||||||.|||.|||||...||
Sbjct  493  CTACTCTGGCTTCAAGATGCTGTCCCCCTGGCCCCAG-TCACAGGACACAGCTCCCAGCACAGTCTGCAAACTC  565

Query  584  CAGGGCTGAACAAGACATCCTCTTTCTCCTGCGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCC  657
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  566  CAGGCCTGAACAAGACATCTTCTTTCTCATGTGAAGCCCACAATGCCAAGGGAGTCACCACCTCCCGCACAGCC  639

Query  658  ACCATCACAGTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCCCGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGC  731
            |||||||||||||||||||||..|||.|...|.||||||.||||.|||.|.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  640  ACCATCACAGTGCTCCCCCAGAGGCCTCACCATCTCCACGTGGTTTCCAGACAACCTACGGAGCTAGAGGTAGC  713

Query  732  TTGGACTCCAGGCCTGAGCGGCATCTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGCTGTGCTGTCAGACGATGGGA  805
            ||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.
Sbjct  714  TTGGACCCCTGGCCTGAGTGGCATCTACCCGCTCACCCACTGCAACCTGCAGGCCGTGCTGTCAGACGATGGGG  787

Query  806  TGGGCATCCAGGC-GGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCCCTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCA  878
            ||||.|| |.||| ||||.|..||||.||.||.||.||.||||||||||.|||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct  788  TGGGTAT-CTGGCTGGGAAAGTCAGATCCTCCTGAAGACCCCCTCACCTTGCAAGTATCAGTGCCCCCCCACCA  860

Query  879  GCTTCGGCTAGGCAGCCTCCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGGGCCCCT  952
            |||||||||.|..|..||||.||||||||||||.|||||||||||..|..|.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  861  GCTTCGGCTGGAAAAGCTCCTTCCTCACACCCCGTATCACATCCGGATATCCTGCAGCAGCAGCCAGGGCCCCT  934

Query  953  CATCCTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCT  1026
            ||.|.||||||||||||||||||||||||||..|.|||||                                  
Sbjct  935  CACCTTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACCACAGAGGG----------------------------------  974

Query 1027  ACGCGGAATGGGAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTACCCTGTTAGGGTA  1100
                                                                                      
Sbjct  975  --------------------------------------------------------------------------  974

Query 1101  CCGGCTGGCGTATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGG  1174
                                                                                      
Sbjct  975  --------------------------------------------------------------------------  974

Query 1175  AGCTGCAGGGGGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACACTGCTGCTGGGGATGGACCC  1248
                                                                                      
Sbjct  975  --------------------------------------------------------------------------  974

Query 1249  TGGAGCCTCCCAGTACCCCTGGAGGCCTGGCGCCCAGGGCAAGCACAGCCAGTCCACCAGCTGGTGAAGGAACC  1322
                                               ||||||||.|||||||.|||||||.|||||||..|||||
Sbjct  975  -----------------------------------AGGGCAAGGACAGCCACTCCACCATCTGGTGAGTGAACC  1013

Query 1323  TTCAACTCCTGCCTTCTCGTGGCCCTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCA  1396
            ..||.|||..||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1014  CCCACCTCGCGCCTTCTCGTGGCCTTGGTGGTATGTACTGCTGGGAGCACTTGTGGCTGCCGCCTGCGTCCTCA  1087

Query 1397  TCTTGGCTCTCTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAA  1470
            |||||||.||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1088  TCTTGGCCCTGTTCCTTGTCCATCGGAGGAAGAAGGAGACTCGATATGGGGAGGTGTTTGAGCCAACCGTGGAA  1161

Query 1471  AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCTTGAACAG  1544
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1162  AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGTGTCCGAAAGTCCTACAGCCGGCGGACCACTGAAGCCACCTTGAACAG  1235

Query 1545  CCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTGCGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGA  1618
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||||||.||||||
Sbjct 1236  TCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAACTACGAGACGTCATGGTAGATCGGCATAAGGTGGCCTTGGGGA  1309

Query 1619  AGACTCTGGGAGAGGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACCAGGACGACTCCATCCTCAAGGTG  1692
            ||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1310  AGACCCTGGGAGAAGGAGAATTTGGCGCTGTGATGGAAGGTCAGCTCAATCAGGATGACTCCATCCTCAAGGTC  1383

Query 1693  GCTGTGAAGACGATGAAGATTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGTCTGCAT  1766
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1384  GCTGTGAAGACCATGAAAATTGCCATCTGCACAAGATCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCTGTCTGCAT  1457

Query 1767  GAAGGAATTTGACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCC  1840
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||..|||||.|.||||
Sbjct 1458  GAAGGAATTTGACCACCCCAACGTCATGAGGCTCATTGGCGTCTGTTTTCAGGGCTCTGACAGAGAGGGTTTCC  1531

Query 1841  CAGCACCTGTGGTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTATTCCCGGCTCGGG  1914
            |||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1532  CAGAACCTGTGGTCATCTTGCCTTTCATGAAACACGGAGACCTACACAGTTTCCTCCTGTACTCCCGGCTCGGG  1605

Query 1915  GACCAGCCAGTGTACCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCT  1988
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1606  GACCAGCCAGTGTTCCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCCGACATTGCCAGTGGTATGGAGTACCT  1679

Query 1989  GAGTACCAAGAGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTG  2062
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680  GAGTACCAAGAGATTCATACATCGGGACCTGGCTGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTG  1753

Query 2063  TGGCGGACTTCGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATGCCA  2136
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1754  TGGCAGACTTCGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAACGGGGATTACTACCGCCAAGGGCGCATTGCCAAGATGCCA  1827

Query 2137  GTCAAGTGGATTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGGGT  2210
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1828  GTCAAGTGGATTGCTATTGAGAGTCTGGCAGATCGGGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGTGT  1901

Query 2211  GACAATGTGGGAGATTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATTTATGACTATC  2284
            |||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1902  GACAATGTGGGAGATCGCCACCCGAGGCCAAACTCCCTATCCAGGGGTGGAGAACAGTGAGATTTACGACTACC  1975

Query 2285  TGCGCCAGGGAAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCTGGATGGACTGTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGG  2358
            ||||.||.||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1976  TGCGTCAAGGAAATCGGCTGAAACAGCCTGTGGACTGTCTGGACGGCCTGTATGCCCTGATGTCTCGGTGCTGG  2049

Query 2359  GAGCTAAATCCCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAACACACTGAAGGCCTTGCC  2432
            ||.||.||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 2050  GAACTGAACCCTCGAGACCGGCCAAGTTTTGCGGAGCTCCGGGAAGACTTGGAGAACACACTGAAGGCTCTGCC  2123

Query 2433  TCCTGCCCAGGAGCCTGACGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAG  2506
            .|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|..|.|.||||||||.|||.|
Sbjct 2124  CCCTGCTCAGGAGCCAGATGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGCGGAAGCCACCTTGAACCCCGTGGGG  2197

Query 2507  CTGCAGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTCACTGCGGCTGAGGTC  2580
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2198  CTGCTGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAACCTGATCCTAAGGATTCCTGTAGCTGTCTCACTGCAGCTGACGTC  2271

Query 2581  CATCCTGCTGGACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCACAACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCC  2654
            ||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||..|.|||.|||.|.|||||||.||.||||.|||
Sbjct 2272  CACTCAGCTGGACGCTATGTCCTTTGTCCTTCTACAGCCCCAGGACCCACTCTGTCTGCTGACAGAGGCTGCCC  2345

Query 2655  AGCAGCCCCAGGGCAGGAGGATGGTGCC  2682
            ||||.|.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2346  AGCACCTCCAGGGCAGGAGGACGGAGCC  2373