Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480014
• Subject: NM_001699.6
• Aligned Length: 2682
• Identities: 2655
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTTGGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTTGGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCAT  74

Query   75  GGCCCCCAGGGGCACGCAGGCTGAAGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCCGGGGAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCCCCAGGGGCACGCAGGCTGAAGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCCGGGGAC  148

Query  149  TCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCCCCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATGGACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCCCCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATGGACAG  222

Query  223  ATCCTGGAGCTCGCGGACAGCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGATGAACAGGATGACTGGATAGTGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCCTGGAGCTCGCGGACAGCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGATGAACAGGATGACTGGATAGTGGT  296

Query  297  CAGCCAGCTCAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGACACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCTGGGACATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCCAGCTCAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGACACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCTGGGACATC  370

Query  371  AGACCTTCGTGTCCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGCTTGCCTTACTTCCTGGAGGAGCCCGAAGACAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACCTTCGTGTCCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGCTTGCCTTACTTCCTGGAGGAGCCCGAAGACAGG  444

Query  445  ACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCTGAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGACCTACTCTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCTGAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGACCTACTCTG  518

Query  519  GCTCCAGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTCCAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGCCTGCATGTTCCAGGGCTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTCCAGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTCCAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGCCTGCATGTTCCAGGGCTGA  592

Query  593  ACAAGACATCCTCTTTCTCCTGCGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCCACCATCACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAGACATCCTCTTTCTCCTGCGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCCACCATCACA  666

Query  667  GTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCCCGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGCTTGGACTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCCCGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGCTTGGACTCC  740

Query  741  AGGCCTGAGCGGCATCTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGCTGTGCTGTCAGACGATGGGATGGGCATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCCTGAGCGGCATCTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGCTGTGCTGTCAGACGATGGGATGGGCATCC  814

Query  815  AGGCGGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCCCTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCAGCTTCGGCTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGCGGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCCCTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCAGCTTCGGCTA  888

Query  889  GGCAGCCTCCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGGGCCCCTCATCCTGGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCAGCCTCCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGGGCCCCTCATCCTGGAC  962

Query  963  CCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCTACGCGGAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCTACGCGGAATG  1036

Query 1037  GGAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTACCCTGTTAGGGTACCGGCTGGCG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTACCCTGTTAGGGTACCGGCTGGCG  1110

Query 1111  TATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGGAGCTGCAGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGGAGCTGCAGGG  1184

Query 1185  GGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACACTGCTGCTGGGGATGGACCCTGGAGCCTCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACACTGCTGCTGGGGATGGACCCTGGAGCCTCC  1258

Query 1259  CAGTACCCCTGGAGGCCTGGCGCCCAGGGCAAGCACAGCCAGTCCACCAGCTGGTGAAGGAACCTTCAACTCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||                           |||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGTACCCCTGGAGGCCTGGCGCCCA---------------------------GTGAAGGAACCTTCAACTCCT  1305

Query 1333  GCCTTCTCGTGGCCCTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCATCTTGGCTCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306  GCCTTCTCGTGGCCCTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCATCTTGGCTCT  1379

Query 1407  CTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAAAGAGGTGAAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  CTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAAAGAGGTGAAC  1453

Query 1481  TGGTAGTCAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCTTGAACAGCCTGGGCATC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454  TGGTAGTCAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCTTGAACAGCCTGGGCATC  1527

Query 1555  AGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTGCGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGAAGACTCTGGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528  AGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTGCGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGAAGACTCTGGG  1601

Query 1629  AGAGGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACCAGGACGACTCCATCCTCAAGGTGGCTGTGAAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602  AGAGGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACCAGGACGACTCCATCCTCAAGGTGGCTGTGAAGA  1675

Query 1703  CGATGAAGATTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGTCTGCATGAAGGAATTT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676  CGATGAAGATTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGTCTGCATGAAGGAATTT  1749

Query 1777  GACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCCCAGCACCTGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750  GACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCCCAGCACCTGT  1823

Query 1851  GGTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTATTCCCGGCTCGGGGACCAGCCAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824  GGTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTATTCCCGGCTCGGGGACCAGCCAG  1897

Query 1925  TGTACCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCTGAGTACCAAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1898  TGTACCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCTGAGTACCAAG  1971

Query 1999  AGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTGTGGCGGACTT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1972  AGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTGTGGCGGACTT  2045

Query 2073  CGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATGCCAGTCAAGTGGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046  CGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATGCCAGTCAAGTGGA  2119

Query 2147  TTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGGGTGACAATGTGG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2120  TTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGGGTGACAATGTGG  2193

Query 2221  GAGATTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATTTATGACTATCTGCGCCAGGG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2194  GAGATTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATTTATGACTATCTGCGCCAGGG  2267

Query 2295  AAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCTGGATGGACTGTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGGGAGCTAAATC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2268  AAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCTGGATGGACTGTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGGGAGCTAAATC  2341

Query 2369  CCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAACACACTGAAGGCCTTGCCTCCTGCCCAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2342  CCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAACACACTGAAGGCCTTGCCTCCTGCCCAG  2415

Query 2443  GAGCCTGACGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAGCTGCAGGAGG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2416  GAGCCTGACGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAGCTGCAGGAGG  2489

Query 2517  AGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTCACTGCGGCTGAGGTCCATCCTGCTG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2490  AGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTCACTGCGGCTGAGGTCCATCCTGCTG  2563

Query 2591  GACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCACAACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCCAGCAGCCCCA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2564  GACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCACAACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCCAGCAGCCCCA  2637

Query 2665  GGGCAGGAGGATGGTGCC  2682
            ||||||||||||||||||
Sbjct 2638  GGGCAGGAGGATGGTGCC  2655