Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480014
- Subject:
- NM_009465.4
- Aligned Length:
- 2692
- Identities:
- 2288
- Gaps:
- 38
Alignment
Query 1 ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTTGGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCAT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.||| |
Sbjct 1 ---------------------ATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGGTTGGCGCTGTGCTGCTGGGGGTG--T 51
Query 75 G--GCCCCCAGGGGCACGCAGGCTGA---AGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCCG 143
| ||||..|.||.|||.|||.|.|| .|..||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 52 GCAGCCCATAAGGACACACAGACCGAGGCTGGCAGCCCGTTTGTGGGGAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCAG 125
Query 144 GGGACTCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCCCCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATG 217
.|||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||....||||||||.||||
Sbjct 126 AGGACTCACGGGGACACTTCGGTGTGAGCTCCAGGTTCAGGGGGAACCCCCTGAGGTGGTGTGGCTTCGAGATG 199
Query 218 GACAGATCCTGGAGCTCGCGGACAGCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGA-TGAACAGGATGACTGGAT 290
||||||||||.||.||.||.||.|.||||||||||||||||||.|||||.||.|| || .||.|||||.||||.
Sbjct 200 GACAGATCCTAGAACTGGCTGATAACACCCAGACCCAGGTGCCTCTGGGCGAAGACTG-GCAAGATGAATGGAA 272
Query 291 AGTGGTCAGCCAGCTCAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGA--CACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCT 362
|||.|||||.||||||||||||.|..|||||||.|||||.|| ||.||| |||||||||||.|||||..|||
Sbjct 273 AGTTGTCAGTCAGCTCAGAATCTCAGCCCTGCAACTTTCAGATGCAGGGG--AGTACCAGTGTATGGTGCATCT 344
Query 363 GGGACATCAGACCTTCGTGTCCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGCTTGCCTTACTTCCTGGAGGAGCCCG 436
.|.|...|.||||||.|||||.|||||.||||.|||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 345 AGAAGGACGGACCTTTGTGTCTCAGCCGGGCTTTGTAGGGCTGGAAGGTCTCCCGTACTTCCTGGAGGAGCCTG 418
Query 437 AAGACAGGACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCTGAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGAC 510
|.||||...|||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||..|
Sbjct 419 AGGACAAAGCTGTGCCTGCCAACACCCCTTTCAACCTAAGCTGCCAGGCCCAGGGACCCCCGGAACCCGTGACC 492
Query 511 CTACTCTGGCTCCAGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTC-CAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGCCTGCATGTTC 583
|||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.| || ||||.|||.||.||||||.|||.|||||...||
Sbjct 493 CTACTCTGGCTTCAAGATGCTGTCCCCCTGGCCCCAG-TCACAGGACACAGCTCCCAGCACAGTCTGCAAACTC 565
Query 584 CAGGGCTGAACAAGACATCCTCTTTCTCCTGCGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCC 657
||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 566 CAGGCCTGAACAAGACATCTTCTTTCTCATGTGAAGCCCACAATGCCAAGGGAGTCACCACCTCCCGCACAGCC 639
Query 658 ACCATCACAGTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCCCGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGC 731
|||||||||||||||||||||..|||.|...|.||||||.||||.|||.|.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 640 ACCATCACAGTGCTCCCCCAGAGGCCTCACCATCTCCACGTGGTTTCCAGACAACCTACGGAGCTAGAGGTAGC 713
Query 732 TTGGACTCCAGGCCTGAGCGGCATCTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGCTGTGCTGTCAGACGATGGGA 805
||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.
Sbjct 714 TTGGACCCCTGGCCTGAGTGGCATCTACCCGCTCACCCACTGCAACCTGCAGGCCGTGCTGTCAGACGATGGGG 787
Query 806 TGGGCATCCAGGC-GGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCCCTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCA 878
||||.|| |.||| ||||.|..||||.||.||.||.||.||||||||||.|||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct 788 TGGGTAT-CTGGCTGGGAAAGTCAGATCCTCCTGAAGACCCCCTCACCTTGCAAGTATCAGTGCCCCCCCACCA 860
Query 879 GCTTCGGCTAGGCAGCCTCCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGGGCCCCT 952
|||||||||.|..|..||||.||||||||||||.|||||||||||..|..|.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 861 GCTTCGGCTGGAAAAGCTCCTTCCTCACACCCCGTATCACATCCGGATATCCTGCAGCAGCAGCCAGGGCCCCT 934
Query 953 CATCCTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCT 1026
||.|.||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||.||||.||||||||||||.||||.||.
Sbjct 935 CACCTTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACCACAGAGGGAGTGCCCTTGGGTCCCCCTGAGAACGTTAGCGCC 1008
Query 1027 ACGCGGAATGGGAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTACCCTGTTAGGGTA 1100
|.|||||||||||||||||.|.||||||.||||||.|||||..|||.|||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1009 ATGCGGAATGGGAGCCAGGTCCTCGTGCGTTGGCAGGAGCCAAGGGTGCCCCTGCAAGGCACCCTGTTAGGGTA 1082
Query 1101 CCGGCTGGCGTATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGG 1174
|||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||..|.||||||||||.|||
Sbjct 1083 CCGGCTGGCATATCGAGGCCAGGACACCCCCGAGGTACTTATGGATATAGGGCTAACTCGAGAGGTGACCTTGG 1156
Query 1175 AGCTGCAGGGGGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACACTGCTGCTGGGGATGGACCC 1248
|.||||.|||||||.||.|||||.|.||.|||||.||||.||||.|||||||.||..|.|||||||||||.|||
Sbjct 1157 AACTGCGGGGGGACAGGCCTGTGGCTAACCTGACTGTGTCTGTGACAGCCTATACCTCGGCTGGGGATGGGCCC 1230
Query 1249 TGGAGCCTCCCAGTACCCCTGGAGGCCTGGCGCCCAGGGCAAGCACAGCCAGTCCACCAGCTGGTGAAGGAACC 1322
||||||||.||.||.|||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.|||||||..|||||
Sbjct 1231 TGGAGCCTTCCTGTGCCCCTAGAGCCCTGGCGCCCAGGGCAAGGACAGCCACTCCACCATCTGGTGAGTGAACC 1304
Query 1323 TTCAACTCCTGCCTTCTCGTGGCCCTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCA 1396
..||.|||..||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1305 CCCACCTCGCGCCTTCTCGTGGCCTTGGTGGTATGTACTGCTGGGAGCACTTGTGGCTGCCGCCTGCGTCCTCA 1378
Query 1397 TCTTGGCTCTCTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAA 1470
|||||||.||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1379 TCTTGGCCCTGTTCCTTGTCCATCGGAGGAAGAAGGAGACTCGATATGGGGAGGTGTTTGAGCCAACCGTGGAA 1452
Query 1471 AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCTTGAACAG 1544
||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1453 AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGTGTCCGAAAGTCCTACAGCCGGCGGACCACTGAAGCCACCTTGAACAG 1526
Query 1545 CCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTGCGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGA 1618
.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||||||.||||||
Sbjct 1527 TCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAACTACGAGACGTCATGGTAGATCGGCATAAGGTGGCCTTGGGGA 1600
Query 1619 AGACTCTGGGAGAGGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACCAGGACGACTCCATCCTCAAGGTG 1692
||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1601 AGACCCTGGGAGAAGGAGAATTTGGCGCTGTGATGGAAGGTCAGCTCAATCAGGATGACTCCATCCTCAAGGTC 1674
Query 1693 GCTGTGAAGACGATGAAGATTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGTCTGCAT 1766
|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1675 GCTGTGAAGACCATGAAAATTGCCATCTGCACAAGATCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCTGTCTGCAT 1748
Query 1767 GAAGGAATTTGACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCC 1840
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||..|||||.|.||||
Sbjct 1749 GAAGGAATTTGACCACCCCAACGTCATGAGGCTCATTGGCGTCTGTTTTCAGGGCTCTGACAGAGAGGGTTTCC 1822
Query 1841 CAGCACCTGTGGTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTATTCCCGGCTCGGG 1914
|||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1823 CAGAACCTGTGGTCATCTTGCCTTTCATGAAACACGGAGACCTACACAGTTTCCTCCTGTACTCCCGGCTCGGG 1896
Query 1915 GACCAGCCAGTGTACCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCT 1988
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1897 GACCAGCCAGTGTTCCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCCGACATTGCCAGTGGTATGGAGTACCT 1970
Query 1989 GAGTACCAAGAGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTG 2062
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 GAGTACCAAGAGATTCATACATCGGGACCTGGCTGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTG 2044
Query 2063 TGGCGGACTTCGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATGCCA 2136
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2045 TGGCAGACTTCGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAACGGGGATTACTACCGCCAAGGGCGCATTGCCAAGATGCCA 2118
Query 2137 GTCAAGTGGATTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGGGT 2210
||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2119 GTCAAGTGGATTGCTATTGAGAGTCTGGCAGATCGGGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGTGT 2192
Query 2211 GACAATGTGGGAGATTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATTTATGACTATC 2284
|||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 2193 GACAATGTGGGAGATCGCCACCCGAGGCCAAACTCCCTATCCAGGGGTGGAGAACAGTGAGATTTACGACTACC 2266
Query 2285 TGCGCCAGGGAAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCTGGATGGACTGTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGG 2358
||||.||.||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 2267 TGCGTCAAGGAAATCGGCTGAAACAGCCTGTGGACTGTCTGGACGGCCTGTATGCCCTGATGTCTCGGTGCTGG 2340
Query 2359 GAGCTAAATCCCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAACACACTGAAGGCCTTGCC 2432
||.||.||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 2341 GAACTGAACCCTCGAGACCGGCCAAGTTTTGCGGAGCTCCGGGAAGACTTGGAGAACACACTGAAGGCTCTGCC 2414
Query 2433 TCCTGCCCAGGAGCCTGACGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAG 2506
.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|..|.|.||||||||.|||.|
Sbjct 2415 CCCTGCTCAGGAGCCAGATGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGCGGAAGCCACCTTGAACCCCGTGGGG 2488
Query 2507 CTGCAGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTCACTGCGGCTGAGGTC 2580
||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2489 CTGCTGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAACCTGATCCTAAGGATTCCTGTAGCTGTCTCACTGCAGCTGACGTC 2562
Query 2581 CATCCTGCTGGACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCACAACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCC 2654
||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||..|.|||.|||.|.|||||||.||.||||.|||
Sbjct 2563 CACTCAGCTGGACGCTATGTCCTTTGTCCTTCTACAGCCCCAGGACCCACTCTGTCTGCTGACAGAGGCTGCCC 2636
Query 2655 AGCAGCCCCAGGGCAGGAGGATGGTGCC 2682
||||.|.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2637 AGCACCTCCAGGGCAGGAGGACGGAGCC 2664