Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480014
- Subject:
- XM_006539993.2
- Aligned Length:
- 2692
- Identities:
- 2020
- Gaps:
- 356
Alignment
Query 1 ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTTGGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCAT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.||| |
Sbjct 1 ---------------------ATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGGTTGGCGCTGTGCTGCTGGGGGTG--T 51
Query 75 G--GCCCCCAGGGGCACGCAGGCTGA---AGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCCG 143
| ||||..|.||.|||.|||.|.|| .|..||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 52 GCAGCCCATAAGGACACACAGACCGAGGCTGGCAGCCCGTTTGTGGGGAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCAG 125
Query 144 GGGACTCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCCCCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATG 217
.|||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||....||||||||.||||
Sbjct 126 AGGACTCACGGGGACACTTCGGTGTGAGCTCCAGGTTCAGGGGGAACCCCCTGAGGTGGTGTGGCTTCGAGATG 199
Query 218 GACAGATCCTGGAGCTCGCGGACAGCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGA-TGAACAGGATGACTGGAT 290
||||||||||.||.||.||.||.|.||||||||||||||||||.|||||.||.|| || .||.|||||.||||.
Sbjct 200 GACAGATCCTAGAACTGGCTGATAACACCCAGACCCAGGTGCCTCTGGGCGAAGACTG-GCAAGATGAATGGAA 272
Query 291 AGTGGTCAGCCAGCTCAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGA--CACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCT 362
|||.|||||.||||||||||||.|..|||||||.|||||.|| ||.||| |||||||||||.|||||..|||
Sbjct 273 AGTTGTCAGTCAGCTCAGAATCTCAGCCCTGCAACTTTCAGATGCAGGGG--AGTACCAGTGTATGGTGCATCT 344
Query 363 GGGACATCAGACCTTCGTGTCCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGCTTGCCTTACTTCCTGGAGGAGCCCG 436
.|.|...|.||||||.|||||.|||||.||||.|||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 345 AGAAGGACGGACCTTTGTGTCTCAGCCGGGCTTTGTAGGGCTGGAAGGTCTCCCGTACTTCCTGGAGGAGCCTG 418
Query 437 AAGACAGGACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCTGAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGAC 510
|.||||...|||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||..|
Sbjct 419 AGGACAAAGCTGTGCCTGCCAACACCCCTTTCAACCTAAGCTGCCAGGCCCAGGGACCCCCGGAACCCGTGACC 492
Query 511 CTACTCTGGCTCCAGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTC-CAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGCCTGCATGTTC 583
|||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.| || ||||.|||.||.||||||.|||.|||||...||
Sbjct 493 CTACTCTGGCTTCAAGATGCTGTCCCCCTGGCCCCAG-TCACAGGACACAGCTCCCAGCACAGTCTGCAAACTC 565
Query 584 CAGGGCTGAACAAGACATCCTCTTTCTCCTGCGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCC 657
||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 566 CAGGCCTGAACAAGACATCTTCTTTCTCATGTGAAGCCCACAATGCCAAGGGAGTCACCACCTCCCGCACAGCC 639
Query 658 ACCATCACAGTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCCCGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGC 731
|||||||||||||||||||||..|||.|...|.||||||.||||.|||.|.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 640 ACCATCACAGTGCTCCCCCAGAGGCCTCACCATCTCCACGTGGTTTCCAGACAACCTACGGAGCTAGAGGTAGC 713
Query 732 TTGGACTCCAGGCCTGAGCGGCATCTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGCTGTGCTGTCAGACGATGGGA 805
||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.
Sbjct 714 TTGGACCCCTGGCCTGAGTGGCATCTACCCGCTCACCCACTGCAACCTGCAGGCCGTGCTGTCAGACGATGGGG 787
Query 806 TGGGCATCCAGGC-GGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCCCTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCA 878
||||.|| |.||| ||||.|..||||.||.||.||.||.||||||||||.|||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct 788 TGGGTAT-CTGGCTGGGAAAGTCAGATCCTCCTGAAGACCCCCTCACCTTGCAAGTATCAGTGCCCCCCCACCA 860
Query 879 GCTTCGGCTAGGCAGCCTCCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGGGCCCCT 952
|||||||||.|..|..||||.||||||||||||.|||||||||||..|..|.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 861 GCTTCGGCTGGAAAAGCTCCTTCCTCACACCCCGTATCACATCCGGATATCCTGCAGCAGCAGCCAGGGCCCCT 934
Query 953 CATCCTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCT 1026
||.|.||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||| |||
Sbjct 935 CACCTTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACCACAGAGGGAGTG------------------------AGT--- 981
Query 1027 ACGCGGAATGGGAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTACCCTGTTAGGGTA 1100
Sbjct 982 -------------------------------------------------------------------------- 981
Query 1101 CCGGCTGGCGTATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGG 1174
Sbjct 982 -------------------------------------------------------------------------- 981
Query 1175 AGCTGCAGGGGGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACACTGCTGCTGGGGATGGACCC 1248
Sbjct 982 -------------------------------------------------------------------------- 981
Query 1249 TGGAGCCTCCCAGTACCCCTGGAGGCCTGGCGCCCAGGGCAAGCACAGCCAGTCCACCAGCTGGTGAAGGAACC 1322
|||||
Sbjct 982 ---------------------------------------------------------------------GAACC 986
Query 1323 TTCAACTCCTGCCTTCTCGTGGCCCTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCA 1396
..||.|||..||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 987 CCCACCTCGCGCCTTCTCGTGGCCTTGGTGGTATGTACTGCTGGGAGCACTTGTGGCTGCCGCCTGCGTCCTCA 1060
Query 1397 TCTTGGCTCTCTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAA 1470
|||||||.||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1061 TCTTGGCCCTGTTCCTTGTCCATCGGAGGAAGAAGGAGACTCGATATGGGGAGGTGTTTGAGCCAACCGTGGAA 1134
Query 1471 AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCTTGAACAG 1544
||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1135 AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGTGTCCGAAAGTCCTACAGCCGGCGGACCACTGAAGCCACCTTGAACAG 1208
Query 1545 CCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTGCGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGA 1618
.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||||||.||||||
Sbjct 1209 TCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAACTACGAGACGTCATGGTAGATCGGCATAAGGTGGCCTTGGGGA 1282
Query 1619 AGACTCTGGGAGAGGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACCAGGACGACTCCATCCTCAAGGTG 1692
||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1283 AGACCCTGGGAGAAGGAGAATTTGGCGCTGTGATGGAAGGTCAGCTCAATCAGGATGACTCCATCCTCAAGGTC 1356
Query 1693 GCTGTGAAGACGATGAAGATTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGTCTGCAT 1766
|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1357 GCTGTGAAGACCATGAAAATTGCCATCTGCACAAGATCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCTGTCTGCAT 1430
Query 1767 GAAGGAATTTGACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCC 1840
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||..|||||.|.||||
Sbjct 1431 GAAGGAATTTGACCACCCCAACGTCATGAGGCTCATTGGCGTCTGTTTTCAGGGCTCTGACAGAGAGGGTTTCC 1504
Query 1841 CAGCACCTGTGGTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTATTCCCGGCTCGGG 1914
|||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1505 CAGAACCTGTGGTCATCTTGCCTTTCATGAAACACGGAGACCTACACAGTTTCCTCCTGTACTCCCGGCTCGGG 1578
Query 1915 GACCAGCCAGTGTACCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCT 1988
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1579 GACCAGCCAGTGTTCCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCCGACATTGCCAGTGGTATGGAGTACCT 1652
Query 1989 GAGTACCAAGAGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTG 2062
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1653 GAGTACCAAGAGATTCATACATCGGGACCTGGCTGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTG 1726
Query 2063 TGGCGGACTTCGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATGCCA 2136
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1727 TGGCAGACTTCGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAACGGGGATTACTACCGCCAAGGGCGCATTGCCAAGATGCCA 1800
Query 2137 GTCAAGTGGATTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGGGT 2210
||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1801 GTCAAGTGGATTGCTATTGAGAGTCTGGCAGATCGGGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGTGT 1874
Query 2211 GACAATGTGGGAGATTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATTTATGACTATC 2284
|||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1875 GACAATGTGGGAGATCGCCACCCGAGGCCAAACTCCCTATCCAGGGGTGGAGAACAGTGAGATTTACGACTACC 1948
Query 2285 TGCGCCAGGGAAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCTGGATGGACTGTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGG 2358
||||.||.||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1949 TGCGTCAAGGAAATCGGCTGAAACAGCCTGTGGACTGTCTGGACGGCCTGTATGCCCTGATGTCTCGGTGCTGG 2022
Query 2359 GAGCTAAATCCCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAACACACTGAAGGCCTTGCC 2432
||.||.||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 2023 GAACTGAACCCTCGAGACCGGCCAAGTTTTGCGGAGCTCCGGGAAGACTTGGAGAACACACTGAAGGCTCTGCC 2096
Query 2433 TCCTGCCCAGGAGCCTGACGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAG 2506
.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|..|.|.||||||||.|||.|
Sbjct 2097 CCCTGCTCAGGAGCCAGATGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGCGGAAGCCACCTTGAACCCCGTGGGG 2170
Query 2507 CTGCAGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTCACTGCGGCTGAGGTC 2580
||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2171 CTGCTGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAACCTGATCCTAAGGATTCCTGTAGCTGTCTCACTGCAGCTGACGTC 2244
Query 2581 CATCCTGCTGGACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCACAACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCC 2654
||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||..|.|||.|||.|.|||||||.||.||||.|||
Sbjct 2245 CACTCAGCTGGACGCTATGTCCTTTGTCCTTCTACAGCCCCAGGACCCACTCTGTCTGCTGACAGAGGCTGCCC 2318
Query 2655 AGCAGCCCCAGGGCAGGAGGATGGTGCC 2682
||||.|.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2319 AGCACCTCCAGGGCAGGAGGACGGAGCC 2346