Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480030
• Subject: NM_001354727.2
• Aligned Length: 2859
• Identities: 2744
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGGCTCGGAAACGCGCGGCCGGCGGGGAGCCGCGGGGACGCGAACTGCGCAGCCAGAAATCCAAGGCCAAGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTCGGAAACGCGCGGCCGGCGGGGAGCCGCGGGGACGCGAACTGCGCAGCCAGAAATCCAAGGCCAAGAG  74

Query   75  CAAGGCCCGGCGTGAGGAGGAGGAGGAGGATGCCTTTGAAGATGAGAAACCCCCAAAGAAGAGCCTTCTCTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAGGCCCGGCGTGAGGAGGAGGAGGAGGATGCCTTTGAAGATGAGAAACCCCCAAAGAAGAGCCTTCTCTCCA  148

Query  149  AAGTTTCACAAGGAAAGAGGAAAAGAGGCTGCAGTCATCCTGGGGGTTCAGCAGATGGTCCAGCAAAAAAGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGTTTCACAAGGAAAGAGGAAAAGAGGCTGCAGTCATCCTGGGGGTTCAGCAGATGGTCCAGCAAAAAAGAAA  222

Query  223  GTGGCCAAGGTGACTGTTAAATCTGAAAACCTCAAGGTTATAAAGGATGAAGCCCTCAGCGATGGGGATGACCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGGCCAAGGTGACTGTTAAATCTGAAAACCTCAAGGTTATAAAGGATGAAGCCCTCAGCGATGGGGATGACCT  296

Query  297  CAGGGACTTTCCAAGTGACCTCAAGAAGGCACACCATCTGAAGAGAGGGGCTACCATGAATGAAGACAGCAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGGGACTTTCCAAGTGACCTCAAGAAGGCACACCATCTGAAGAGAGGGGCTACCATGAATGAAGACAGCAATG  370

Query  371  AAGAAGAGGAAGAAAGTGAAAATGATTGGGAAGAGGTTGAAGAACTTAGTGAGCCTGTGCTGGGTGACGTGAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGAAGAGGAAGAAAGTGAAAATGATTGGGAAGAGGTTGAAGAACTTAGTGAGCCTGTGCTGGGTGACGTGAGA  444

Query  445  GAAAGTACAGCCTTCTCTCGATCTCTTCTGCCTGTGAAGCCAGTGGAGATAGAGATTGAAACGCCAGAGCAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAGTACAGCCTTCTCTCGATCTCTTCTGCCTGTGAAGCCAGTGGAGATAGAGATTGAAACGCCAGAGCAGGC  518

Query  519  GAAGACAAGAGAAAGAAGTGAAAAGATAAAACTGGAGTTTGAGACATATCTTCGGAGGGCGATGAAACGTTTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGACAAGAGAAAGAAGTGAAAAGATAAAACTGGAGTTTGAGACATATCTTCGGAGGGCGATGAAACGTTTCA  592

Query  593  ATAAAGGGGTCCATGAGGACACACACAAGGTTCACCTTCTCTGCCTGCTAGCAAATGGCTTCTATCGAAATAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAAAGGGGTCCATGAGGACACACACAAGGTTCACCTTCTCTGCCTGCTAGCAAATGGCTTCTATCGAAATAAC  666

Query  667  ATCTGCAGCCAGCCAGATCTGCATGCTATTGGCCTGTCCATCATCCCAGCCCGCTTTACCAGAGTGCTGCCTCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCTGCAGCCAGCCAGATCTGCATGCTATTGGCCTGTCCATCATCCCAGCCCGCTTTACCAGAGTGCTGCCTCG  740

Query  741  AGATGTGGACACCTACTACCTCTCAAACCTGGTGAAGTGGTTCATTGGAACATTTACAGTTAATGCAGAACTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGATGTGGACACCTACTACCTCTCAAACCTGGTGAAGTGGTTCATTGGAACATTTACAGTTAATGCAGAACTTT  814

Query  815  CAGCCAGTGAACAAGATAACCTGCAGACTACATTGGAAAGGAGATTTGCTATTTACTCTGCTCGAGATGATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCCAGTGAACAAGATAACCTGCAGACTACATTGGAAAGGAGATTTGCTATTTACTCTGCTCGAGATGATGAG  888

Query  889  GAATTGGTCCATATATTCTTACTGATTCTCCGGGCTCTGCAGCTCTTGACCCGGCTGGTATTGTCTCTACAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAATTGGTCCATATATTCTTACTGATTCTCCGGGCTCTGCAGCTCTTGACCCGGCTGGTATTGTCTCTACAGCC  962

Query  963  AATTCCTCTGAAGTCAGCAACAGCAAAGGGAAAGAAACCTTCCAAGGAAAGATTGACTGCGGATCCAGGAGGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATTCCTCTGAAGTCAGCAACAGCAAAGGGAAAGAAACCTTCCAAGGAAAGATTGACTGCGGATCCAGGAGGCT  1036

Query 1037  CCTCAGAAACTTCCAGCCAAGTTCTAGAAAACCACACCAAACCAAAGACCAGCAAAGGAACCAAACAAGAGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTCAGAAACTTCCAGCCAAGTTCTAGAAAACCACACCAAACCAAAGACCAGCAAAGGAACCAAACAAGAGGAA  1110

Query 1111  ACCTTTGCTAAGGGCACCTGCAGGCCAAGTGCCAAAGGGAAGAGGAACAAGGGAGGCAGAAAGAAACGGAGCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCTTTGCTAAGGGCACCTGCAGGCCAAGTGCCAAAGGGAAGAGGAACAAGGGAGGCAGAAAGAAACGGAGCAA  1184

Query 1185  GCCCTCCTCCAGCGAGGAAGATGAGGGCCCAGGAGACAAGCAGGAGAAGGCAACCCAGCGACGTCCGCATGGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCCTCCTCCAGCGAGGAAGATGAGGGCCCAGGAGACAAGCAGGAGAAGGCAACCCAGCGACGTCCGCATGGCC  1258

Query 1259  GGGAGCGGCGGGTGGCCTCCAGGGTGTCTTATAAAGAGGAGAGTGGGAGTGATGAGGCTGGCAGCGGCTCTGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGAGCGGCGGGTGGCCTCCAGGGTGTCTTATAAAGAGGAGAGTGGGAGTGATGAGGCTGGCAGCGGCTCTGAT  1332

Query 1333  TTTGAGCTCTCCAGTGGAGAAGCCTCTGATCCCTCTGATGAGGATTCCGAACCTGGCCCTCCAAAGCAGAGGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTTGAGCTCTCCAGTGGAGAAGCCTCTGATCCCTCTGATGAGGATTCCGAACCTGGCCCTCCAAAGCAGAGGAA  1406

Query 1407  AGCCCCCGCTCCTCAGAGGACAAAGGCTGGGTCCAAGAGTGCCTCCAGGACCCATCGTGGGAGCCATCGTAAGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCCCCCGCTCCTCAGAGGACAAAGGCTGGGTCCAAGAGTGCCTCCAGGACCCATCGTGGGAGCCATCGTAAGG  1480

Query 1481  ACCCAAGCTTGCCAGCGGCATCCTCAAGCTCTTCAAGCAGTAAAAGAGGCAAGAAAATGTGCAGCGATGGTGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACCCAAGCTTGCCAGCGGCATCCTCAAGCTCTTCAAGCAGTAAAAGAGGCAAGAAAATGTGCAGCGATGGTGAG  1554

Query 1555  AAGGCAGAAAAAAGAAGCATAGCTGGTATAGACCAGTGGCTAGAGGTGTTCTGTGAGCAGGAGGAAAAGTGGGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGGCAGAAAAAAGAAGCATAGCTGGTATAGACCAGTGGCTAGAGGTGTTCTGTGAGCAGGAGGAAAAGTGGGT  1628

Query 1629  ATGTGTAGACTGTGTGCACGGTGTGGTGGGCCAGCCTCTGACCTGTTACAAGTACGCCACCAAGCCCATGACCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATGTGTAGACTGTGTGCACGGTGTGGTGGGCCAGCCTCTGACCTGTTACAAGTACGCCACCAAGCCCATGACCT  1702

Query 1703  ATGTGGTGGGCATTGACAGTGACGGCTGGGTCCGAGATGTCACACAGAGGTACGACCCAGTCTGGATGACAGTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGTGGTGGGCATTGACAGTGACGGCTGGGTCCGAGATGTCACACAGAGGTACGACCCAGTCTGGATGACAGTG  1776

Query 1777  ACCCGCAAGTGCCGGGTTGATGCTGAGTGGTGGGCCGAGACCTTGAGACCATACCAGAGCCCATTTATGGACAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACCCGCAAGTGCCGGGTTGATGCTGAGTGGTGGGCCGAGACCTTGAGACCATACCAGAGCCCATTTATGGACAG  1850

Query 1851  GGAGAAGAAAGAAGACTTGGAG-----TTTCAGGCAAAACACATGGACCAGCCT--TTGCCCACTGCCATTGGC  1917
            ||||||||||||||||||||||     |.||        ||.|||   |.||||  .||.|.||..|       
Sbjct 1851  GGAGAAGAAAGAAGACTTGGAGGAAGATGTC--------CAGATG---CTGCCTACCTGTCAACCCC-------  1906

Query 1918  TTATATAAGAACC-------ACCCTCTGTATGCC---CTGAAG----CGGCATCTCCTGAAATATGAGGCCATC  1977
                 |||||.||       ||||.||     ||   ||||||    ||.|    |.|||.|||       |||
Sbjct 1907  -----TAAGACCCCTTTTTTACCCGCT-----CCTGTCTGAAGACCACGAC----CATGACATA-------ATC  1959

Query 1978  TATCC-CGAGACAG-----------CTGCCATCCTTGG--GTATTGTCGTGGAG----AAGCGGTCTACTCCAG  2033
            ..||| |..|.|||           |.|||..|..|||  |.||  ..||||||    .|||  |||  ..|||
Sbjct 1960  ACTCCTCTGGGCAGTCAAAGATGTTCCGCCCCCAGTGGGAGCAT--GAGTGGAGCTTTGAGC--TCT--GGCAG  2027

Query 2034  GGATTGTGTGCACACTCTGCATTCCAGAGACACGTGGCTGAAGAAAGCAAGAGTGGTGAGGCTTGGAGAAGTAC  2107
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028  GGATTGTGTGCACACTCTGCATTCCAGGGACACGTGGCTGAAGAAAGCAAGAGTGGTGAGGCTTGGAGAAGTAC  2101

Query 2108  CCTACAAGATGGTGAAAGGCTTTTCTAACCGTGCTCGGAAAGCCCGACTTGCTGAGCCCCAGCTGCGGGAAGAA  2181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2102  CCTACAAGATGGTGAAAGGCTTTTCTAACCGTGCTCGGAAAGCCCGACTTGCTGAGCCCCAGCTGCGGGAAGAA  2175

Query 2182  AATGACCTGGGCCTGTTTGGCTACTGGCAGACAGAGGAGTATCAGCCCCCAGTGGCCGTGGACGGGAAGGTGCC  2255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2176  AATGACCTGGGCCTGTTTGGCTACTGGCAGACAGAGGAGTATCAGCCCCCAGTGGCCGTGGACGGGAAGGTGCC  2249

Query 2256  CCGGAACGAGTTTGGGAATGTGTACCTCTTCCTGCCCAGCATGATGCCTATTGGCTGTGTCCAGCTGAACCTGC  2329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2250  CCGGAACGAGTTTGGGAATGTGTACCTCTTCCTGCCCAGCATGATGCCTATTGGCTGTGTCCAGCTGAACCTGC  2323

Query 2330  CCAATCTACACCGCGTGGCCCGCAAGCTGGACATCGACTGTGTCCAGGCCATCACTGGCTTTGATTTCCATGGC  2403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324  CCAATCTACACCGCGTGGCCCGCAAGCTGGACATCGACTGTGTCCAGGCCATCACTGGCTTTGATTTCCATGGC  2397

Query 2404  GGCTACTCCCATCCCGTGACTGATGGATACATCGTCTGCGAGGAATTCAAAGACGTGCTCCTGACTGCCTGGGA  2477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398  GGCTACTCCCATCCCGTGACTGATGGATACATCGTCTGCGAGGAATTCAAAGACGTGCTCCTGACTGCCTGGGA  2471

Query 2478  AAATGAGCAGGCAGTCATTGAAAGGAAGGAGAAGGAGAAAAAGGAGAAGCGGGCTCTAGGGAACTGGAAGTTGC  2551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2472  AAATGAGCAGGCAGTCATTGAAAGGAAGGAGAAGGAGAAAAAGGAGAAGCGGGCTCTAGGGAACTGGAAGTTGC  2545

Query 2552  TGGCCAAAGGTCTGCTCATCAGGGAGAGGCTGAAGCGTCGCTACGGGCCCAAGAGTGAGGCAGCAGCTCCCCAC  2625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2546  TGGCCAAAGGTCTGCTCATCAGGGAGAGGCTGAAGCGTCGCTACGGGCCCAAGAGTGAGGCAGCAGCTCCCCAC  2619

Query 2626  ACAGATGCAGGAGGTGGACTCTCTTCTGATGAAGAGGAGGGGACCAGCTCTCAAGCAGAAGCGGCCAGGATACT  2699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2620  ACAGATGCAGGAGGTGGACTCTCTTCTGATGAAGAGGAGGGGACCAGCTCTCAAGCAGAAGCGGCCAGGATACT  2693

Query 2700  GGCTGCCTCCTGGCCTCAAAACCGAGAAGATGAAGAAAAGCAGAAGCTGAAGGGTGGGCCCAAGAAGACCAAAA  2773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694  GGCTGCCTCCTGGCCTCAAAACCGAGAAGATGAAGAAAAGCAGAAGCTGAAGGGTGGGCCCAAGAAGACCAAAA  2767

Query 2774  GGGAAAAGAAAGCAGCAGCTTCCCACCTGTTCCCATTTGAGAAGCTG  2820
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2768  GGGAAAAGAAAGCAGCAGCTTCCCACCTGTTCCCATTTGAGCAGCTG  2814