Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480030
• Subject: NM_001354730.1
• Aligned Length: 2820
• Identities: 2572
• Gaps: 246

Alignment

Query    1  ATGGCTCGGAAACGCGCGGCCGGCGGGGAGCCGCGGGGACGCGAACTGCGCAGCCAGAAATCCAAGGCCAAGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTCGGAAACGCGCGGCCGGCGGGGAGCCGCGGGGACGCGAACTGCGCAGCCAGAAATCCAAGGCCAAGAG  74

Query   75  CAAGGCCCGGCGTGAGGAGGAGGAGGAGGATGCCTTTGAAGATGAGAAACCCCCAAAGAAGAGCCTTCTCTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAGGCCCGGCGTGAGGAGGAGGAGGAGGATGCCTTTGAAGATGAGAAACCCCCAAAGAAGAGCCTTCTCTCCA  148

Query  149  AAGTTTCACAAGGAAAGAGGAAAAGAGGCTGCAGTCATCCTGGGGGTTCAGCAGATGGTCCAGCAAAAAAGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGTTTCACAAGGAAAGAGGAAAAGAGGCTGCAGTCATCCTGGGGGTTCAGCAGATGGTCCAGCAAAAAAGAAA  222

Query  223  GTGGCCAAGGTGACTGTTAAATCTGAAAACCTCAAGGTTATAAAGGATGAAGCCCTCAGCGATGGGGATGACCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGGCCAAGGTGACTGTTAAATCTGAAAACCTCAAGGTTATAAAGGATGAAGCCCTCAGCGATGGGGATGACCT  296

Query  297  CAGGGACTTTCCAAGTGACCTCAAGAAGGCACACCATCTGAAGAGAGGGGCTACCATGAATGAAGACAGCAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGGGACTTTCCAAGTGACCTCAAGAAGGCACACCATCTGAAGAGAGGGGCTACCATGAATGAAGACAGCAATG  370

Query  371  AAGAAGAGGAAGAAAGTGAAAATGATTGGGAAGAGGTTGAAGAACTTAGTGAGCCTGTGCTGGGTGACGTGAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGAAGAGGAAGAAAGTGAAAATGATTGGGAAGAGGTTGAAGAACTTAGTGAGCCTGTGCTGGGTGACGTGAGA  444

Query  445  GAAAGTACAGCCTTCTCTCGATCTCTTCTGCCTGTGAAGCCAGTGGAGATAGAGATTGAAACGCCAGAGCAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAGTACAGCCTTCTCTCGATCTCTTCTGCCTGTGAAGCCAGTGGAGATAGAGATTGAAACGCCAGAGCAGGC  518

Query  519  GAAGACAAGAGAAAGAAGTGAAAAGATAAAACTGGAGTTTGAGACATATCTTCGGAGGGCGATGAAACGTTTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGACAAGAGAAAGAAGTGAAAAGATAAAACTGGAGTTTGAGACATATCTTCGGAGGGCGATGAAACGTTTCA  592

Query  593  ATAAAGGGGTCCATGAGGACACACACAAGGTTCACCTTCTCTGCCTGCTAGCAAATGGCTTCTATCGAAATAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAAAGGGGTCCATGAGGACACACACAAGGTTCACCTTCTCTGCCTGCTAGCAAATGGCTTCTATCGAAATAAC  666

Query  667  ATCTGCAGCCAGCCAGATCTGCATGCTATTGGCCTGTCCATCATCCCAGCCCGCTTTACCAGAGTGCTGCCTCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCTGCAGCCAGCCAGATCTGCATGCTATTGGCCTGTCCATCATCCCAGCCCGCTTTACCAGAGTGCTGCCTCG  740

Query  741  AGATGTGGACACCTACTACCTCTCAAACCTGGTGAAGTGGTTCATTGGAACATTTACAGTTAATGCAGAACTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGATGTGGACACCTACTACCTCTCAAACCTGGTGAAGTGGTTCATTGGAACATTTACAGTTAATGCAGAACTTT  814

Query  815  CAGCCAGTGAACAAGATAACCTGCAGACTACATTGGAAAGGAGATTTGCTATTTACTCTGCTCGAGATGATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCCAGTGAACAAGATAACCTGCAGACTACATTGGAAAGGAGATTTGCTATTTACTCTGCTCGAGATGATGAG  888

Query  889  GAATTGGTCCATATATTCTTACTGATTCTCCGGGCTCTGCAGCTCTTGACCCGGCTGGTATTGTCTCTACAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAATTGGTCCATATATTCTTACTGATTCTCCGGGCTCTGCAGCTCTTGACCCGGCTGGTATTGTCTCTACAGCC  962

Query  963  AATTCCTCTGAAGTCAGCAACAGCAAAGGGAAAGAAACCTTCCAAGGAAAGATTGACTGCGGATCCAGGAGGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATTCCTCTGAAGTCAGCAACAGCAAAGGGAAAGAAACCTTCCAAGGAAAGATTGACTGCGGATCCAGGAGGCT  1036

Query 1037  CCTCAGAAACTTCCAGCCAAGTTCTAGAAAACCACACCAAACCAAAGACCAGCAAAGGAACCAAACAAGAGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTCAGAAACTTCCAGCCAAGTTCTAGAAAACCACACCAAACCAAAGACCAGCAAAGGAACCAAACAAGAGGAA  1110

Query 1111  ACCTTTGCTAAGGGCACCTGCAGGCCAAGTGCCAAAGGGAAGAGGAACAAGGGAGGCAGAAAGAAACGGAGCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCTTTGCTAAGGGCACCTGCAGGCCAAGTGCCAAAGGGAAGAGGAACAAGGGAGGCAGAAAGAAACGGAGCAA  1184

Query 1185  GCCCTCCTCCAGCGAGGAAGATGAGGGCCCAGGAGACAAGCAGGAGAAGGCAACCCAGCGACGTCCGCATGGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCCTCCTCCAGCGAGGAAGATGAGGGCCCAGGAGACAAGCAGGAGAAGGCAACCCAGCGACGTCCGCATGGCC  1258

Query 1259  GGGAGCGGCGGGTGGCCTCCAGGGTGTCTTATAAAGAGGAGAGTGGGAGTGATGAGGCTGGCAGCGGCTCTGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGAGCGGCGGGTGGCCTCCAGGGTGTCTTATAAAGAGGAGAGTGGGAGTGATGAGGCTGGCAGCGGCTCTGAT  1332

Query 1333  TTTGAGCTCTCCAGTGGAGAAGCCTCTGATCCCTCTGATGAGGATTCCGAACCTGGCCCTCCAAAGCAGAGGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTTGAGCTCTCCAGTGGAGAAGCCTCTGATCCCTCTGATGAGGATTCCGAACCTGGCCCTCCAAAGCAGAGGAA  1406

Query 1407  AGCCCCCGCTCCTCAGAGGACAAAGGCTGGGTCCAAGAGTGCCTCCAGGACCCATCGTGGGAGCCATCGTAAGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCCCCCGCTCCTCAGAGGACAAAGGCTGGGTCCAAGAGTGCCTCCAGGACCCATCGTGGGAGCCATCGTAAGG  1480

Query 1481  ACCCAAGCTTGCCAGCGGCATCCTCAAGCTCTTCAAGCAGTAAAAGAGGCAAGAAAATGTGCAGCGATGGTGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACCCAAGCTTGCCAGCGGCATCCTCAAGCTCTTCAAGCAGTAAAAGAGGCAAGAAAATGTGCAGCGATGGTGAG  1554

Query 1555  AAGGCAGAAAAAAGAAGCATAGCTGGTATAGACCAGTGGCTAGAGGTGTTCTGTGAGCAGGAGGAAAAGTGGGT  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1555  AAGGCAGAAAAAAGAAGCATAGCTGGTATAGACCAGTGGCTAGAGGTGTTCTGTGAGCAGGAGGAAAAGTG---  1625

Query 1629  ATGTGTAGACTGTGTGCACGGTGTGGTGGGCCAGCCTCTGACCTGTTACAAGTACGCCACCAAGCCCATGACCT  1702
                                                                                      
Sbjct 1626  --------------------------------------------------------------------------  1625

Query 1703  ATGTGGTGGGCATTGACAGTGACGGCTGGGTCCGAGATGTCACACAGAGGTACGACCCAGTCTGGATGACAGTG  1776
                                                                                      
Sbjct 1626  --------------------------------------------------------------------------  1625

Query 1777  ACCCGCAAGTGCCGGGTTGATGCTGAGTGGTGGGCCGAGACCTTGAGACCATACCAGAGCCCATTTATGGACAG  1850
                                                                                      
Sbjct 1626  --------------------------------------------------------------------------  1625

Query 1851  GGAGAAGAAAGAAGACTTGGAGTTTCAGGCAAAACACATGGACCAGCCTTTGCCCACTGCCATTGGCTTATATA  1924
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  ---------------------GTTTCAGGCAAAACACATGGACCAGCCTTTGCCCACTGCCATTGGCTTATATA  1678

Query 1925  AGAACCACCCTCTGTATGCCCTGAAGCGGCATCTCCTGAAATATGAGGCCATCTATCCCGAGACAGCTGCCATC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679  AGAACCACCCTCTGTATGCCCTGAAGCGGCATCTCCTGAAATATGAGGCCATCTATCCCGAGACAGCTGCCATC  1752

Query 1999  CTTGGGTATTGTCGTGGAGAAGCGGTCTACTCCAGGGATTGTGTGCACACTCTGCATTCCAGAGACACGTGGCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1753  CTTGGGTATTGTCGTGGAGAAGCGGTCTACTCCAGGGATTGTGTGCACACTCTGCATTCCAGGGACACGTGGCT  1826

Query 2073  GAAGAAAGCAAGAGTGGTGAGGCTTGGAGAAGTACCCTACAAGATGGTGAAAGGCTTTTCTAACCGTGCTCGGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1827  GAAGAAAGCAAGAGTGGTGAGGCTTGGAGAAGTACCCTACAAGATGGTGAAAGGCTTTTCTAACCGTGCTCGGA  1900

Query 2147  AAGCCCGACTTGCTGAGCCCCAGCTGCGGGAAGAAAATGACCTGGGCCTGTTTGGCTACTGGCAGACAGAGGAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1901  AAGCCCGACTTGCTGAGCCCCAGCTGCGGGAAGAAAATGACCTGGGCCTGTTTGGCTACTGGCAGACAGAGGAG  1974

Query 2221  TATCAGCCCCCAGTGGCCGTGGACGGGAAGGTGCCCCGGAACGAGTTTGGGAATGTGTACCTCTTCCTGCCCAG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975  TATCAGCCCCCAGTGGCCGTGGACGGGAAGGTGCCCCGGAACGAGTTTGGGAATGTGTACCTCTTCCTGCCCAG  2048

Query 2295  CATGATGCCTATTGGCTGTGTCCAGCTGAACCTGCCCAATCTACACCGCGTGGCCCGCAAGCTGGACATCGACT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2049  CATGATGCCTATTGGCTGTGTCCAGCTGAACCTGCCCAATCTACACCGCGTGGCCCGCAAGCTGGACATCGACT  2122

Query 2369  GTGTCCAGGCCATCACTGGCTTTGATTTCCATGGCGGCTACTCCCATCCCGTGACTGATGGATACATCGTCTGC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2123  GTGTCCAGGCCATCACTGGCTTTGATTTCCATGGCGGCTACTCCCATCCCGTGACTGATGGATACATCGTCTGC  2196

Query 2443  GAGGAATTCAAAGACGTGCTCCTGACTGCCTGGGAAAATGAGCAGGCAGTCATTGAAAGGAAGGAGAAGGAGAA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2197  GAGGAATTCAAAGACGTGCTCCTGACTGCCTGGGAAAATGAGCAGGCAGTCATTGAAAGGAAGGAGAAGGAGAA  2270

Query 2517  AAAGGAGAAGCGGGCTCTAGGGAACTGGAAGTTGCTGGCCAAAGGTCTGCTCATCAGGGAGAGGCTGAAGCGTC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2271  AAAGGAGAAGCGGGCTCTAGGGAACTGGAAGTTGCTGGCCAAAGGTCTGCTCATCAGGGAGAGGCTGAAGCGTC  2344

Query 2591  GCTACGGGCCCAAGAGTGAGGCAGCAGCTCCCCACACAGATGCAGGAGGTGGACTCTCTTCTGATGAAGAGGAG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2345  GCTACGGGCCCAAGAGTGAGGCAGCAGCTCCCCACACAGATGCAGGAGGTGGACTCTCTTCTGATGAAGAGGAG  2418

Query 2665  GGGACCAGCTCTCAAGCAGAAGCGGCCAGGATACTGGCTGCCTCCTGGCCTCAAAACCGAGAAGATGAAGAAAA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2419  GGGACCAGCTCTCAAGCAGAAGCGGCCAGGATACTGGCTGCCTCCTGGCCTCAAAACCGAGAAGATGAAGAAAA  2492

Query 2739  GCAGAAGCTGAAGGGTGGGCCCAAGAAGACCAAAAGGGAAAAGAAAGCAGCAGCTTCCCACCTGTTCCCATTTG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2493  GCAGAAGCTGAAGGGTGGGCCCAAGAAGACCAAAAGGGAAAAGAAAGCAGCAGCTTCCCACCTGTTCCCATTTG  2566

Query 2813  AGAAGCTG  2820
            ||.|||||
Sbjct 2567  AGCAGCTG  2574