Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480182
- Subject:
- XM_011245758.2
- Aligned Length:
- 1636
- Identities:
- 1268
- Gaps:
- 230
Alignment
Query 1 ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT 74
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||.||
Sbjct 1 ATGGAAGCAGCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTGTTCCACGACAGGGTCCGCGAGTGCATCAT 74
Query 75 ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT 148
.||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCAATACTTCTGTTTGCAACACTCTACATCCTCTGCCATATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT 148
Query 149 TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT 222
||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 149 TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACAGTTAACAAGATTGCGCTGGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCGGTC 222
Query 223 GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA 296
||||||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct 223 GCCCTGGGCGCCGTCTTACTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAACGAGGTGCTGCTCTCGTTGCCACGCAACTA 296
Query 297 CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC 370
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 297 CTACATCCAGTGGCTCAATGGCTCCCTCATCCATGGTCTGTGGAACCTCGTTTTCCTCTTCTCCAATCTGTCCC 370
Query 371 TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG 444
||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCGTCTTCCTTATGCCCTTTGCATATTTCTTCACAGAGTCTGAAGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG 444
Query 445 GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC 518
|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCGGGTCTACGAGACAGTGGTGATGTTGATCCTCCTCACGCTGCTTGTGCTGGGCATGGTGTGGGTGGCATC 518
Query 519 AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT 592
.||||||||.|||||..|||||||||.|||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 519 CGCCATTGTAGACAATGACAAGGCCAGCAGGGAGTCGCTCTACGACTTCTGGGAGTACTACCTCCCCTATCTCT 592
Query 593 ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGTTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC 666
||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 ACTCCTGTATCTCCTTCCTCGGAGTTCTGCTGCTTCTGGTGTGCACTCCACTAGGTCTCGCCCGCATGTTCTCT 666
Query 667 GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA 740
||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 667 GTCACTGGGAAGTTGCTGGTCAAGCCCCGGCTACTGGAAGACCTGGAGGAACAGCTGAACTGCTCAGCCTTTGA 740
Query 741 GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTA--------------------------------------------- 769
|||||||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 741 GGAGGCAGCTCTGACTCGAAGAATCTGCAGTGAGTCTAAATCCGCCCTTGCTTGGGTGGTGGTGGCCCGGCCTT 814
Query 770 --------------------------------------------ATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACA 799
||||.||.||||||||||||||..|.||||
Sbjct 815 GGCAAGGACTGAGTATTGGAGGGAAGTATGTCCTGTGCCCTCAGATCCCACCTCCTGCTGGCTGCCACTGGACA 888
Query 800 TGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCT---------------------- 851
||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||| ||
Sbjct 889 TGGAACTGCTGCATAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGGCACAGAGGGTCCT-CTTGGGTATGTGGCCTGGTAGTTT 961
Query 852 ------GGAG----------------------------------------------------AAGAGGCGGAAG 867
|||| |||.|.||||||
Sbjct 962 ACCCAAGGAGAGTTGTTCCTTGTCCCAAGTACTTACTAACGACCTCCCACCCACACACAGAAAAGCGTCGGAAG 1035
Query 868 GCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGT 941
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GCGTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCTCTGGCCATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGT 1109
Query 942 GCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATG---------- 1005
.|||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1110 CCTCATCGTGGCTGTCCACATCCTGGAGCTGCTTATTGACGAGGCTGCCATGCCACGGGGCATGCAGGATGCTG 1183
Query 1006 --------------------------------------------------CAGGTTGTACTCATCTTTTACCTA 1029
||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1184 CCCTAGGCCAGGCCTCCTTCTCCAAACTGGGATCCTTTGGCGCCATCATCCAGGTTGTGCTGATATTTTACCTG 1257
Query 1030 ATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGC 1103
||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..|.||||||.||||.||.|||||.|||||..|
Sbjct 1258 ATGGTGTCCTCAGTGGTGGGTTTCTACAGCTCTCCACTCTTTGGAAGCCTGAGGCCTAGGTGGCATGACACATC 1331
Query 1104 CATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCC 1177
.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1332 GATGACACAGATCATTGGGAACTGTGTCTGCCTCCTGGTCCTCAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTAGAACTC 1405
Query 1178 TGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTC 1251
|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1406 TTGGCCTGACACGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTAGGCAATTTCTACATCGTGTTC 1479
Query 1252 CTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGA 1325
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1480 CTCTACAACGCAGCCTTTGCTGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACGGCAGCTGTGAGGGCAGA 1553
Query 1326 GCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCC 1399
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||.|||.||||||||||..|
Sbjct 1554 GCTGATCCGAGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCACTGCCTGTCTCTGGGTTTCCCCGGGCTTCTAGGAAGAAGC 1627
Query 1400 AGCACCAG 1407
||||.||.
Sbjct 1628 AGCATCAA 1635