Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480225
- Subject:
- NM_001174053.1
- Aligned Length:
- 1638
- Identities:
- 1387
- Gaps:
- 132
Alignment
Query 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
Query 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC 148
Query 149 TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG 222
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA 222
Query 223 CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
Query 297 TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG 370
|||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 297 TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG 370
Query 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC 444
Query 445 AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
Query 519 TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT 592
.||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 519 ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT 592
Query 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG 666
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTACCCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTG 666
Query 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA 740
||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCCTGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAA 740
Query 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGG 814
Query 815 TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC 888
||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 815 TCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCA 888
Query 889 AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGCAGCCAAGAGTTTACT 962
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACACGGAATTTCT---CAGCCAAGAGTTTACT 959
Query 963 CAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||..||||||||||||||
Sbjct 960 CAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAAG 1033
Query 1037 GGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAG-- 1108
|..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1034 GATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAATCTTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAGCC 1107
Query 1109 -------------------------------------------------------------------------- 1108
Sbjct 1108 CCCAGGATCTCTGACATCCTCAACTCAGTGAGGCGGGGCTCAGGGACCCCAGAAGCTGAGGGCCTCCCACCAGT 1181
Query 1109 -----------------------------------------------------CCCGGAAGCAGGAGATCATTA 1129
|||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1182 GGGCCCCCCACCCTGCCCATCTCCGACTCTCCCTGGCCCCTTGCCCACCCCATCCCGGAAGCAGGAAATCATCA 1255
Query 1130 AGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGG 1203
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1256 AGACCACAGAGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTATGCGAAAATCTGTGACCCAGGC 1329
Query 1204 CTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAA 1277
||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1330 CTGACCTCATTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGATTTCCACAGATTCTACTTTGAGAA 1403
Query 1278 CCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATG 1351
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1404 CCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCACGTGCACGTCATTGGCGAGGATG 1477
Query 1352 CCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAG 1425
|.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1478 CGGCATGCATCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCAGACCCCGTACCAGCCAGTCCGAA 1551
Query 1426 GAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGC 1499
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1552 GAGACCCGTGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTCCACTGCTCGGGCGCTCCAGTGGC 1625
Query 1500 CCCGCTGCAG 1509
||||||||||
Sbjct 1626 CCCGCTGCAG 1635