Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480225
• Subject: NM_001174054.1
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1391
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            |||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            .||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  519  ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGT---------------------------------GGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTAC  633
            ||||||||                                 ||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGCCATTATGTTTGTCTGCCTGTGCTCATTATAGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTAC  666

Query  634  CCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTGTACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCC  707
            |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  667  CCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTGTACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCC  740

Query  708  TGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAACCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCA  781
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAACCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCA  814

Query  782  TCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGGTCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAG  855
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  815  TCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGGTCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAG  888

Query  856  GAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCCAGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGC  929
            |||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  GAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCAAGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGC  962

Query  930  CACACGGAATTTCTCAGCAGCCAAGAGTTTACTCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCA  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  963  CACACGGAATTTCTCAGCAGCCAAGAGTTTACTCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCA  1036

Query 1004  CCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAG---------------  1062
            ||||||||||..|.|||..|||||||||||||||..|.||.||||||||.|||||||||               
Sbjct 1037  CCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAAGGATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTT  1110

Query 1063  ------------------------------TCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAA  1106
                                          |||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111  ATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAATCTTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAA  1184

Query 1107  AGCCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCT  1180
            |||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1185  AGCCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAGAGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCT  1258

Query 1181  ACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGAC  1254
            |.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1259  ATGCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCATTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGAT  1332

Query 1255  TTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACA  1328
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1333  TTCCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCA  1406

Query 1329  CGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCC  1402
            |||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.
Sbjct 1407  CGTGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCATCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCA  1480

Query 1403  GGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTC  1476
            |.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1481  GACCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGTGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTC  1554

Query 1477  CACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1509
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1555  CACTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCAG  1587