Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480225
• Subject: XM_005249862.3
• Aligned Length: 1581
• Identities: 1508
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666

Query  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740

Query  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814

Query  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888

Query  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAG----------------  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC  962

Query  947  --------------------------------------------------------CAGCCAAGAGTTTACTCA  964
                                                                    .|||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCCAAGAGTTTACTCA  1036

Query  965  ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGG  1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAGGG  1110

Query 1039  ACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGCCCG  1112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGCCCG  1184

Query 1113  GAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGA  1186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGA  1258

Query 1187  AAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCAC  1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCAC  1332

Query 1261  AGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCA  1334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCA  1406

Query 1335  CGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCC  1408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCC  1480

Query 1409  GCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGC  1482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGC  1554

Query 1483  TCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1509
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1581