Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480225
• Subject: XM_006514469.2
• Aligned Length: 1881
• Identities: 1390
• Gaps: 372

Alignment

Query    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT  74

Query   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct   75  CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC  148

Query  149  TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG  222
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA  222

Query  223  CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296
            ||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT  296

Query  297  TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG  370
            |||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG  370

Query  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC  444

Query  445  AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG  518

Query  519  TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT  592
            .||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  519  ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT  592

Query  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  GGGCATGTGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTACCCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTG  666

Query  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA  740
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCCTGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAA  740

Query  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGG  814

Query  815  TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC  888
            ||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  815  TCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCA  888

Query  889  AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGCAGCCAAGAGTTTACT  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGCAGCCAAGAGTTTACT  962

Query  963  CAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||..||||||||||||||
Sbjct  963  CAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAAG  1036

Query 1037  GGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAGTCTTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAG--  1108
            |..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.||||  
Sbjct 1037  GATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAATCTTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAGCC  1110

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1111  CCCAGGGTCCCTGATGTCCTGAGCTTGGTGAGGAGGGCCTCAGGAGCCCCCGAAGCCGAGGGCCCCCTCTCCTG  1184

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1185  CCAATCTCCAGTTCCCATTAGCCCCCTTCCAACCCCGTCCCCCAGGATCTCTGACATCCTGAACTCAGTGAGAA  1258

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1259  GGGGCTGTGGAACCCCAGAAGCCGAGGGACCCCTATCAGTGGGGCCCCCACCCTGCTTGTCTCCGGGTCTCCTA  1332

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1333  GGCCCCCTGCCCACCCCGTCCCCCAGGATCTCTGACATCCTCAACTCAGTGAGGCGGGGCTCAGGGACCCCAGA  1406

Query 1109  --------------------------------------------------------------------------  1108
                                                                                      
Sbjct 1407  AGCTGAGGGCCTCCCACCAGTGGGCCCCCCACCCTGCCCATCTCCGACTCTCCCTGGCCCCTTGCCCACCCCAT  1480

Query 1109  CCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGGAGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTAC  1182
            |||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1481  CCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAGAGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTAT  1554

Query 1183  GCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCGTTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTT  1256
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1555  GCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCATTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGATTT  1628

Query 1257  CCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACG  1330
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  CCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGCCAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCACG  1702

Query 1331  TGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCATCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGG  1404
            |||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|.
Sbjct 1703  TGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCATCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCAGA  1776

Query 1405  CCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGCGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCA  1478
            |||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1777  CCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGTGTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTCCA  1850

Query 1479  CTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCAG  1509
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1851  CTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCAG  1881