Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480225
- Subject:
- XM_017314239.1
- Aligned Length:
- 1629
- Identities:
- 1391
- Gaps:
- 120
Alignment
Query 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGCTTCACCGACGAGTACCAGCTCTACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCACCACGGTGACCTGCACCCGTTTCACCGACGAGTACCAGCTATACGAGGATATTGGCAAGGGGGCTTT 74
Query 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGCACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATCAACACCAAGAAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 75 CTCTGTGGTCCGACGCTGTGTCAAGCTCTGTACCGGCCATGAGTATGCAGCCAAGATCATTAATACCAAGAAGC 148
Query 149 TGTCAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGAGAGAGGCTCGGATCTGCCGCCTTCTGAAGCATTCCAACATCGTG 222
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 TGTCGGCCAGAGATCACCAGAAACTGGAGAGAGAAGCTCGGATCTGCCGCCTGCTGAAGCATTCCAACATTGTA 222
Query 223 CGTCTCCACGACAGCATCTCCGAGGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGCCTCCATGACAGCATCTCTGAAGAGGGCTTCCACTACCTGGTCTTCGATCTGGTCACTGGTGGGGAGCTCTT 296
Query 297 TGAAGACATTGTGGCGAGAGAGTACTACAGCGAGGCTGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCCG 370
|||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 297 TGAAGACATCGTGGCAAGAGAGTACTACAGTGAAGCTGATGCCAGTCACTGCATCCAGCAGATCCTGGAAGCTG 370
Query 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCGGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAGTGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TTCTCCATTGTCACCAAATGGGGGTCGTCCACAGAGACCTCAAGCCTGAGAACCTGCTTCTGGCCAGCAAATGC 444
Query 445 AAAGGGGCTGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTAGCTATCGAGGTGCAGGGGGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAGGCGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTCGGCCTGGCCATCGAGGTTCAGGGAGACCAGCAGGCATGGTTTGG 518
Query 519 TTTCGCTGGCACACCAGGCTACCTGTCCCCTGAGGTCCTTCGCAAAGAGGCGTATGGCAAGCCTGTGGACATCT 592
.||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 519 ATTTGCGGGAACGCCAGGCTACCTGTCTCCCGAGGTCCTTCGGAAGGAGGCCTACGGCAAACCTGTGGACATCT 592
Query 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTACATCCTGCTCGTGGGCTACCCACCCTTCTGGGACGAGGACCAGCACAAGCTG 666
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 593 GGGCATGTGGGGTGATCCTGTATATCCTGCTGGTGGGCTACCCACCTTTCTGGGATGAGGACCAACACAAGCTG 666
Query 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGTGCCTATGACTTCCCGTCCCCTGAGTGGGACACCGTCACTCCTGAAGCCAAAAA 740
||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 TACCAGCAGATCAAGGCTGGGGCGTATGATTTCCCATCCCCTGAGTGGGACACCGTTACTCCTGAAGCCAAAAA 740
Query 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACAGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCGTGGG 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CCTCATCAACCAGATGCTGACCATCAACCCTGCCAAGCGCATCACGGCCCATGAGGCCCTGAAGCACCCATGGG 814
Query 815 TCTGCCAACGCTCCACGGTAGCATCCATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAGTGTCTGAAAAAGTTCAATGCC 888
||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 815 TCTGCCAACGTTCCACCGTGGCCTCTATGATGCACAGACAGGAGACTGTGGAATGTCTGAAGAAGTTCAATGCA 888
Query 889 AGGAGAAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACCATGCTGGCCACACGGAATTTCTC------------------ 944
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGAGGAAGCTCAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACACGGAATTTCTCAGTGGGCAGACAGACCAC 962
Query 945 ---------------------------------------------------------AGCAGCCAAGAGTTTAC 961
|||||||||||||||||
Sbjct 963 CGCTCCGGCCACAATGTCCACCGCGGCCTCCGGCACCACCATGGGGCTGGTGGAACAAGCAGCCAAGAGTTTAC 1036
Query 962 TCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACGAATAGCACCAAAAACAGTGCAGCCGCCACCAGCCCCAAA 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|.|||..|||||||||||||
Sbjct 1037 TCAACAAGAAAGCAGATGGAGTCAAGCCCCAGACAAACAGCACCAAAAACAGCTCGGCCATCACCAGCCCCAAA 1110
Query 1036 GGGACGCTTCCTCCTGCCGCCCTGGAG---------------------------------------------TC 1064
||..|.||.||||||||.||||||||| ||
Sbjct 1111 GGATCTCTCCCTCCTGCTGCCCTGGAGCCTCAAACCACCGTTATCCATAACCCAGTGGACGGGATTAAGGAATC 1184
Query 1065 TTCTGACAGTGCCAATACCACCATAGAGGATGAAGACGCTAAAGCCCGGAAGCAGGAGATCATTAAGACCACGG 1138
|||.|||||..||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1185 TTCCGACAGCACCAACACAACCATAGAGGATGAAGATGCCAAAGCCCGGAAGCAGGAAATCATCAAGACCACAG 1258
Query 1139 AGCAGCTCATCGAGGCCGTCAACAACGGTGACTTTGAGGCCTACGCGAAAATCTGTGACCCAGGGCTGACCTCG 1212
||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1259 AGCAGCTCATTGAGGCCGTCAACAATGGGGACTTTGAGGCCTATGCGAAAATCTGTGACCCAGGCCTGACCTCA 1332
Query 1213 TTTGAGCCTGAAGCACTGGGCAACCTGGTTGAAGGGATGGACTTCCACAGATTCTACTTCGAGAACCTGCTGGC 1286
||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333 TTTGAGCCTGAAGCTCTGGGCAACCTGGTCGAAGGGATGGATTTCCACAGATTCTACTTTGAGAACCTGCTGGC 1406
Query 1287 CAAGAACAGCAAGCCGATCCACACGACCATCCTGAACCCACACGTGCACGTCATTGGAGAGGATGCCGCCTGCA 1360
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1407 CAAGAACAGCAAGCCGATCCACACCACCATCCTGAACCCGCACGTGCACGTCATTGGCGAGGATGCGGCATGCA 1480
Query 1361 TCGCTTACATCCGGCTCACGCAGTACATTGACGGGCAGGGCCGGCCCCGCACCAGCCAGTCTGAGGAGACCCGC 1434
||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1481 TCGCCTACATCCGCCTCACACAGTACATCGATGGCCAGGGCAGACCCCGTACCAGCCAGTCCGAAGAGACCCGT 1554
Query 1435 GTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAACGTGCACTTCCACTGCTCGGGCGCGCCTGTGGCCCCGCTGCA 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGTGGCACCGCCGCGACGGCAAGTGGCAGAATGTACATTTCCACTGCTCGGGCGCTCCAGTGGCCCCGCTGCA 1628
Query 1509 G 1509
|
Sbjct 1629 G 1629