Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480235
- Subject:
- NM_001322217.1
- Aligned Length:
- 3642
- Identities:
- 3385
- Gaps:
- 255
Alignment
Query 1 ATGGCGGGAGCCTTAATCGGGTCGGAGCCAGGCCCCGCGGAAGAACTTGCCAAACTCGAGTACCTGTCTTTGGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTCAAAGGTTTGCACTGAGCTGGACAATCACTTGGGGATCAACGACAAGGACCTTGCTGAATTTGTGATCAGTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTGCTGAGAAAAATACCACCTTTGATACTTTTAAGGCTTCTCTCGTCAAAAATGGTGCAGAATTTACGGATTCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTTATTAGTAACTTGCTGCGTCTCATACAAACCATGCGGCCTCCAGCGAAGCCTTCCACTAGCAAAGATCCAGT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------ATGCGGCCTCCAGCGAAGCCTTCCACTAGCAAAGATCCAGT 41
Query 297 TGTTAAACCTAAAACAGAAAAAGAAAAGCTGAAGGAACTCTTCCCAGTCCTTTGCCAACCGGACAACCCTTCTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 42 TGTTAAACCTAAAACAGAAAAAGAAAAGCTGAAGGAACTCTTCCCAGTCCTTTGCCAACCGGACAACCCTTCTG 115
Query 371 TTCGGACCATGTTGGATGAAGATGATGTGAAAGTTGCTGTGGATGTCCTGAAAGAACTGGAAGCTTTAATGCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 116 TTCGGACCATGTTGGATGAAGATGATGTGAAAGTTGCTGTGGATGTCCTGAAAGAACTGGAAGCTTTAATGCCC 189
Query 445 AGCGCAGCAGGCCAGGAGAAGCAAAGAGATGCTGAACACCGGGACAGGACAAAGAAGAAGAAGCGGAGTCGAAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 AGCGCAGCAGGCCAGGAGAAGCAAAGAGATGCTGAACACCGGGACAGGACAAAGAAGAAGAAGCGGAGTCGAAG 263
Query 519 CCGAGATCGAAACCGAGATCGAGACAGAGATAGGGAACGAAACCGAGATAGAGACCACAAGCGGAGACACCGAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 CCGAGATCGAAACCGAGATCGAGACAGAGATAGGGAACGAAACCGAGATAGAGACCACAAGCGGAGACACCGAT 337
Query 593 CCCGCTCTCGATCACGTTCCAGGACCCGGGAGAGGAATAAAGTGAAGTCTAGATATCGGTCCAGGAGCAGGAGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 CCCGCTCTCGATCACGTTCCAGGACCCGGGAGAGGAATAAAGTGAAGTCTAGATATCGGTCCAGGAGCAGGAGT 411
Query 667 CAGAGTCCCCCCAAAGACCGGAAGGACCGGGACAAATATGGAGAGCGGAATCTGGATAGATGGCGGGATAAGCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 CAGAGTCCCCCCAAAGACCGGAAGGACCGGGACAAATATGGAGAGCGGAATCTGGATAGATGGCGGGATAAGCA 485
Query 741 TGTGGACCGCCCTCCTCCAGAAGAGCCCACCATTGGTGACATTTATAATGGCAAAGTTACCAGCATCATGCAGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486 TGTGGACCGCCCTCCTCCAGAAGAGCCCACCATTGGTGACATTTATAATGGCAAAGTTACCAGCATCATGCAGT 559
Query 815 TTGGTTGCTTTGTGCAGCTGGAAGGACTAAGGAAGCGGTGGGAAGGCCTGGTGCACATCTCTGAGCTCCGGCGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560 TTGGTTGCTTTGTGCAGCTGGAAGGACTAAGGAAGCGGTGGGAAGGCCTGGTGCACATCTCTGAGCTCCGGCGG 633
Query 889 GAGGGTCGTGTGGCCAATGTAGCTGATGTCGTGAGCAAAGGCCAGAGGGTCAAAGTCAAAGTGCTGTCCTTCAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 GAGGGTCGTGTGGCCAATGTAGCTGATGTCGTGAGCAAAGGCCAGAGGGTCAAAGTCAAAGTGCTGTCCTTCAC 707
Query 963 TGGGACCAAGACCAGCCTGAGCATGAAGGATGTGGATCAAGAGACTGGAGAAGATCTAAACCCAAATAGACGGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 TGGGACCAAGACCAGCCTGAGCATGAAGGATGTGGATCAAGAGACTGGAGAAGATCTAAACCCAAATAGACGGC 781
Query 1037 GAAATCTTGTCGGGGAGACCAATGAGGAGACCTCAATGCGGAATCCTGATAGACCCACTCACTTGTCCCTTGTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 GAAATCTTGTCGGGGAGACCAATGAGGAGACCTCAATGCGGAATCCTGATAGACCCACTCACTTGTCCCTTGTC 855
Query 1111 AGTGCTCCTGAAGTAGAGGACGACTCACTGGAACGCAAGCGCCTCACCCGAATCTCTGACCCAGAGAAGTGGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 856 AGTGCTCCTGAAGTAGAGGACGACTCACTGGAACGCAAGCGCCTCACCCGAATCTCTGACCCAGAGAAGTGGGA 929
Query 1185 GATCAAACAGATGATTGCTGCCAATGTCCTTTCCAAAGAAGAATTTCCAGACTTTGATGAAGAGACTGGCATTC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 930 GATCAAACAGATGATTGCTGCCAATGTCCTTTCCAAAGAAGAATTTCCAGACTTTGATGAAGAGACTGGCATTC 1003
Query 1259 TCCCTAAGGTGGATGATGAAGAAGATGAGGACCTTGAGATTGAATTGGTTGAGGAAGAGCCTCCATTCCTGAGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004 TCCCTAAGGTGGATGATGAAGAAGATGAGGACCTTGAGATTGAATTGGTTGAGGAAGAGCCTCCATTCCTGAGA 1077
Query 1333 GGGCACACTAAGCAAAGCATGGACATGAGCCCCATTAAAATTGTCAAGAACCCAGACGGCTCCCTCTCCCAAGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 GGGCACACTAAGCAAAGCATGGACATGAGCCCCATTAAAATTGTCAAGAACCCAGACGGCTCCCTCTCCCAAGC 1151
Query 1407 AGCAATGATGCAGAGTGCCTTGGCCAAAGAAAGGCGGGAACTCAAACAGGCCCAGCGGGAAGCTGAGATGGATT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152 AGCAATGATGCAGAGTGCCTTGGCCAAAGAAAGGCGGGAACTCAAACAGGCCCAGCGGGAAGCTGAGATGGATT 1225
Query 1481 CTATTCCCATGGGACTCAACAAACACTGGGTTGACCCTCTGCCTGATGCGGAAGGCAGACAGATTGCTGCCAAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 CTATTCCCATGGGACTCAACAAACACTGGGTTGACCCTCTGCCTGATGCGGAAGGCAGACAGATTGCTGCCAAC 1299
Query 1555 ATGAGGGGTATTGGGATGATGCCCAATGATATTCCTGAGTGGAAGAAGCATGCCTTTGGGGGCAACAAAGCCTC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300 ATGAGGGGTATTGGGATGATGCCCAATGATATTCCTGAGTGGAAGAAGCATGCCTTTGGGGGCAACAAAGCCTC 1373
Query 1629 TTACGGAAAAAAGACCCAGATGTCAATCCTTGAGCAGAGGGAGAGCCTGCCCATCTACAAACTGAAGGAGCAAT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 TTACGGAAAAAAGACCCAGATGTCAATCCTTGAGCAGAGGGAGAGCCTGCCCATCTACAAACTGAAGGAGCAAT 1447
Query 1703 TGGTCCAGGCCGTCCATGACAATCAGATCCTGATTGTCATTGGTGAGACAGGATCTGGAAAGACAACACAGATC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448 TGGTCCAGGCCGTCCATGACAATCAGATCCTGATTGTCATTGGTGAGACAGGATCTGGAAAGACAACACAGATC 1521
Query 1777 ACCCAGTACCTGGCGGAGGCAGGCTACACTTCCAGGGGCAAGATTGGGTGTACCCAGCCCAGAAGAGTGGCAGC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1522 ACCCAGTACCTGGCGGAGGCAGGCTACACTTCCAGGGGCAAGATTGGGTGTACCCAGCCCAGAAGAGTGGCAGC 1595
Query 1851 TATGTCGGTGGCCAAAAGAGTGTCAGAGGAGTTTGGTTGTTGCTTAGGCCAAGAGGTGGGCTACACCATTCGAT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1596 TATGTCGGTGGCCAAAAGAGTGTCAGAGGAGTTTGGTTGTTGCTTAGGCCAAGAGGTGGGCTACACCATTCGAT 1669
Query 1925 TTGAGGACTGCACTAGCCCTGAAACAGTCATCAAGTACATGACAGATGGGATGTTGCTTAGAGAGTGCTTGATT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1670 TTGAGGACTGCACTAGCCCTGAAACAGTCATCAAGTACATGACAGATGGGATGTTGCTTAGAGAGTGCTTGATT 1743
Query 1999 GACCCTGACCTCACTCAGTACGCGATCATCATGTTGGACGAGGCACATGAGAGGACAATTCACACTGATGTGCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1744 GACCCTGACCTCACTCAGTACGCGATCATCATGTTGGACGAGGCACATGAGAGGACAATTCACACTGATGTGCT 1817
Query 2073 CTTTGGATTGTTGAAAAAGACAGTTCAGAAACGGCAGGACATGAAGCTGATTGTCACCTCAGCCACCTTGGATG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1818 CTTTGGATTGTTGAAAAAGACAGTTCAGAAACGGCAGGACATGAAGCTGATTGTCACCTCAGCCACCTTGGATG 1891
Query 2147 CAGTGAAGTTTTCTCAATACTTCTATGAAGCTCCCATTTTCACCATCCCAGGTCGAACATATCCAGTGGAAATA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1892 CAGTGAAGTTTTCTCAATACTTCTATGAAGCTCCCATTTTCACCATCCCAGGTCGAACATATCCAGTGGAAATA 1965
Query 2221 CTGTACACAAAGGAACCTGAGACAGATTATCTGGATGCCAGCCTGATTACTGTTATGCAGATTCATTTAACAGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1966 CTGTACACAAAGGAACCTGAGACAGATTATCTGGATGCCAGCCTGATTACTGTTATGCAGATTCATTTAACAGA 2039
Query 2295 ACCACCAGGTGATATCCTGGTCTTCCTGACTGGTCAGGAAGAAATTGATACTGCTTGTGAGATCCTGTATGAAA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 ACCACCAGGTGATATCCTGGTCTTCCTGACTGGTCAGGAAGAAATTGATACTGCTTGTGAGATCCTGTATGAAA 2113
Query 2369 GAATGAAATCCCTGGGACCTGATGTTCCAGAGTTAATTATCCTCCCAGTGTACTCTGCTCTTCCCAGTGAGATG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2114 GAATGAAATCCCTGGGACCTGATGTTCCAGAGTTAATTATCCTCCCAGTGTACTCTGCTCTTCCCAGTGAGATG 2187
Query 2443 CAGACCCGAATCTTTGACCCAGCTCCACCAGGCAGCAGAAAGGTTGTGATTGCCACCAATATCGCAGAGACATC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2188 CAGACCCGAATCTTTGACCCAGCTCCACCAGGCAGCAGAAAGGTTGTGATTGCCACCAATATCGCAGAGACATC 2261
Query 2517 GCTGACTATTGATGGTATCTACTATGTGGTGGACCCAGGATTCGTGAAACAGAAAGTTTACAATTCCAAGACAG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262 GCTGACTATTGATGGTATCTACTATGTGGTGGACCCAGGATTCGTGAAACAGAAAGTTTACAATTCCAAGACAG 2335
Query 2591 GGATTGACCAGCTCGTGGTGACGCCTATTTCTCAGGCTCAGGCAAAGCAACGAGCTGGCAGAGCTGGGAGAACA 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 GGATTGACCAGCTCGTGGTGACGCCTATTTCTCAGGCTCAGGCAAAGCAACGAGCTGGCAGAGCTGGGAGAACA 2409
Query 2665 GGCCCAGGGAAGTGTTACAGGTTGTACACAGAACGTGCCTACCGAGATGAAATGCTGACCACCAACGTGCCGGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2410 GGCCCAGGGAAGTGTTACAGGTTGTACACAGAACGTGCCTACCGAGATGAAATGCTGACCACCAACGTGCCGGA 2483
Query 2739 AATCCAGAGAACCAACTTAGCAAGCACAGTGCTGTCACTCAAGGCCATGGGTATCAATGATCTGCTGTCCTTTG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2484 AATCCAGAGAACCAACTTAGCAAGCACAGTGCTGTCACTCAAGGCCATGGGTATCAATGATCTGCTGTCCTTTG 2557
Query 2813 ATTTCATGGATGCCCCACCTATGGAAACTTTGATCACAGCCATGGAGCAGCTGTACACACTGGGGGCCCTGGAT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2558 ATTTCATGGATGCCCCACCTATGGAAACTTTGATCACAGCCATGGAGCAGCTGTACACACTGGGGGCCCTGGAT 2631
Query 2887 GACGAGGGCCTGCTCACTCGCTTGGGCCGCCGGATGGCAGAGTTCCCTCTGGAGCCAATGCTATGCAAAATGCT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2632 GACGAGGGCCTGCTCACTCGCTTGGGCCGCCGGATGGCAGAGTTCCCTCTGGAGCCAATGCTATGCAAAATGCT 2705
Query 2961 CATCATGTCTGTGCATCTGGGCTGCAGTGAGGAAATGCTGACCATTGTATCCATGCTGTCTGTGCAGAACGTCT 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2706 CATCATGTCTGTGCATCTGGGCTGCAGTGAGGAAATGCTGACCATTGTATCCATGCTGTCTGTGCAGAACGTCT 2779
Query 3035 TCTATAGGCCCAAGGATAAACAAGCCCTTGCAGATCAGAAGAAGGCCAAGTTCCACCAGACTGAAGGGGACCAC 3108
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2780 TCTATAGGCCCAAGGATAAACAAGCCCTTGCAGATCAGAAGAAGGCCAAATTCCACCAGACTGAAGGGGACCAC 2853
Query 3109 CTCACCCTGCTAGCTGTGTACAACTCCTGGAAGAACAACAAGTTCTCCAACCCATGGTGCTATGAGAACTTTAT 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2854 CTCACCCTGCTAGCTGTGTACAACTCCTGGAAGAACAACAAGTTCTCCAACCCATGGTGCTATGAGAACTTTAT 2927
Query 3183 CAAGGCTCGTTCCCTGCGCCGGGCCCAGGACATTCGCAAGCAGATGTTAGGCATAATGGACAGACACAAGCTGG 3256
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2928 CCAGGCTCGTTCCCTGCGCCGGGCCCAGGACATTCGCAAGCAGATGTTAGGCATAATGGACAGACACAAGCTGG 3001
Query 3257 ATGTTGTTTCCTGTGGCAAGTCCACAGTCCGAGTGCAGAAGGCCATCTGCAGTGGGTTCTTCCGTAATGCTGCC 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3002 ATGTTGTTTCCTGTGGCAAGTCCACAGTCCGAGTGCAGAAGGCCATCTGCAGTGGGTTCTTCCGTAATGCTGCC 3075
Query 3331 AAGAAAGACCCGCAGGAGGGTTACCGGACACTGATCGACCAGCAGGTGGTCTATATCCATCCTTCCAGTGCCCT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3076 AAGAAAGACCCGCAGGAGGGTTACCGGACACTGATCGACCAGCAGGTGGTCTATATCCATCCTTCCAGTGCCCT 3149
Query 3405 CTTCAACAGACAGCCAGAATGGGTGGTGTACCATGAGCTGGTGCTCACCACCAAGGAATACATGCGTGAAGTTA 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3150 CTTCAACAGACAGCCAGAATGGGTGGTGTACCATGAGCTGGTGCTCACCACCAAGGAATACATGCGTGAAGTTA 3223
Query 3479 CCACCATCGACCCTCGGTGGCTTGTGGAGTTTGCCCCAGCCTTCTTCAAGGTCTCAGACCCAACTAAGCTAAGC 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3224 CCACCATCGACCCTCGGTGGCTTGTGGAGTTTGCCCCAGCCTTCTTCAAGGTCTCAGACCCAACTAAGCTAAGC 3297
Query 3553 AAACAGAAGAAGCAACAGCGTCTTGAACCCTTGTACAACCGCTATGAGGAACCCAATGCCTGGAGAATATCTCG 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3298 AAACAGAAGAAGCAACAGCGTCTTGAACCCTTGTACAACCGCTATGAGGAACCCAATGCCTGGAGAATATCTCG 3371
Query 3627 AGCTTTCCGACGGCGC 3642
||||||||||||||||
Sbjct 3372 AGCTTTCCGACGGCGC 3387