Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480245
• Subject: NM_001319305.2
• Aligned Length: 1146
• Identities: 962
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTTGATACCAACTTGATTCTTCTACCTTTGTTCCAATTTATTGTGCCTAAAGAATGGAACAGCAAATATAG  74

Query    1  -------------------------------------------------------------ATGGCCCGTCCTA  13
                                                                         |||||||||||||
Sbjct   75  ACCTGTATGCATTCATCTTGCTGGAACAGGAGATCATCATTACTGGAGGCGACGAACACTAATGGCCCGTCCTA  148

Query   14  TGATTAAAGAAGCCCGAATGGCTTCTTTATTGTTAGAAAACCCTTATTATGGCTGCAGGAAACCCAAGGACCAA  87
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATTAAAGAAGCCCGAATGGCTTCTTTATTGTTAGAAAACCCTTATTATGGCTGCAGGAAACCCAAGGACCAA  222

Query   88  GTAAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCT  161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTAAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCT  296

Query  162  CTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTT  235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTT  370

Query  236  CCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTC  309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTC  444

Query  310  TTCACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAGCTGGAAAAGCAATATTATACCCAGACAGTTTA  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAGCTGGAAAAGCAATATTATACCCAGACAGTTTA  518

Query  384  TGAAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAAC  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAAC  592

Query  458  ACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAAC  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAAC  666

Query  532  CAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACT  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACT  740

Query  606  CTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTC  679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTC  814

Query  680  GCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTT  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTT  888

Query  754  ATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGT  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGT  962

Query  828  GGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTG  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTG  1036

Query  902  AAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGG------------  963
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.            
Sbjct 1037  AAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGACAAGCCATCTAT  1110

Query  964  ------------------------------------  963
                                                
Sbjct 1111  GATGCATTTGACCGCTTCCTCCATAAATACGCTAAC  1146