Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480245
- Subject:
- NM_001366038.2
- Aligned Length:
- 1252
- Identities:
- 941
- Gaps:
- 293
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGATAAAACCCTTTCTTTTTTTTTTTTTGAGACGCAGTCATTCTGTCACCCAGTCTGGAGTGCACTGGTGCGA 74
Query 1 ---------------------------------------AT----GGCC----CGTCCTATG--------ATTA 19
|| .||| |.|||.|.| ||||
Sbjct 75 TCTCAGCTCACTGGAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTA 148
Query 20 AAG--AAGCCCGA------ATGGCTTCTTTATTGT--------TAGA--------------------------- 50
.|| |.||.|.| .|||||..||| |||| ||||
Sbjct 149 CAGGCATGCACCACCACACCTGGCTAATTT-TTGTATGTTTAGTAGAGATGGGCTTTCACCATGTTGGTCAGGC 221
Query 51 -------AAAC------------------------CCTT-------------------ATTATGGCTGCAGGAA 74
|||| |||| |||||.| |||.||.
Sbjct 222 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAG--GCATGAG 293
Query 75 AC------CCAAG--GACC-----------AAGTAAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATG 129
.| ||.|| .||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 CCACTGTGCCCAGCCTACCTTTTCCTTTTTAAG-AAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATG 366
Query 130 GGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCTCTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAAT 203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 GGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCTCTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAAT 440
Query 204 GACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTTCCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTC 277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441 GACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTTCCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTC 514
Query 278 CATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTCTTCACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAG 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 CATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTCTTCACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAG 588
Query 352 CTGGAAAAGCAATATTATACCCAGACAGTTTATGAAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGA 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 CTGGAAAAGCAATATTATACCCAGACAGTTTATGAAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGA 662
Query 426 TTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAACACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGG 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 TTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAACACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGG 736
Query 500 TTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAACCAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGC 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 TTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAACCAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGC 810
Query 574 AAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACTCTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAAC 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 AAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACTCTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAAC 884
Query 648 ACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTCGCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCA 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 ACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTCGCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCA 958
Query 722 GAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTTATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTC 795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTTATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTC 1032
Query 796 TCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGTGGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGT 869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 TCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGTGGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGT 1106
Query 870 TCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTGAAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTT 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 TCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTGAAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTT 1180
Query 944 TTAAACAAGGACTCTTCAGG------------------------------------------------ 963
|||||||||||||||||||.
Sbjct 1181 TTAAACAAGGACTCTTCAGACAAGCCATCTATGATGCATTTGACCGCTTCCTCCATAAATACGCTAAC 1248