Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480284
• Subject: XM_006502697.3
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1289
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCTGACATGCAAAATCTGGTAGAAAGATTGGAGAGGGCAGTGGGCCGCCTGGAGGCAGTATCTCATACCTC  74
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct    1  ATGGCTGACATGCAAAATCTTGTAGAAAGATTGGAGAGGGCAGTGGGCCGCCTGGAGGCAGTGTCACATACTTC  74

Query   75  TGACATGCACCGTGGGTATGCAGACAGTCCTTCAAAAGCAGGAGCAGCTCCATATGTGCAGGCATTTGACTCGC  148
            .|||||||||.||||.||||.||||||.||||||||   ||||||||.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGACATGCACTGTGGATATGGAGACAGCCCTTCAAA---AGGAGCAGTTCCATATGTGCAAGCATTTGACTCGC  145

Query  149  TGCTTGCTGGTCCTGTGGCAGAGTACTTGAAGATCAGTAAAGAGATTGGGGGAGACGTGCAGAAACATGCGGAG  222
            |||||||...|||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  146  TGCTTGCCAATCCCGTGGCAGAGTACTTGAAGATGAGTAAGGAGATCGGGGGAGATGTGCAGAAACACGCGGAG  219

Query  223  ATGGTCCACACAGGTTTGAAGTTGGAGCGAGCTCTGTTGGTTACAGCTTCTCAGTGTCAACAGCCAGCAGAAAA  296
            ||||||||||||||..|||||||||||||||||||..|||.|||||||||||||||.||.||||||||.|..||
Sbjct  220  ATGGTCCACACAGGCCTGAAGTTGGAGCGAGCTCTCCTGGCTACAGCTTCTCAGTGCCAGCAGCCAGCTGGTAA  293

Query  297  TAAGCTTTCCGATTTGTTGGCACCCATCTCAGAGCAGATCAAAGAAGTGATAACCTTTCGGGAGAAGAACCGAG  370
            |||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  294  TAAACTTTCTGATTTGTTGGCACCTATCTCGGAGCAGATCCAAGAAGTTATAACCTTCCGGGAGAAGAACCGAG  367

Query  371  GCAGCAAGTTGTTTAATCACCTGTCAGCTGTCAGCGAAAGTATCCAGGCCCTGGGCTGGGTGGCTATGGCTCCC  444
            ||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||.|.
Sbjct  368  GCAGCAAGTTTTTTAATCATCTATCTGCTGTCAGTGAAAGCATCCAGGCCTTGGGCTGGGTGGCTCTGGCTGCG  441

Query  445  AAGCCTGGCCCTTATGTGAAAGAAATGAATGATGCCGCCATGTTTTATACAAACCGAGTCCTCAAAGAGTACAA  518
            ||.||||||||.|.|||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||.
Sbjct  442  AAACCTGGCCCCTTTGTGAAAGAGATGAATGACGCGGCCATGTTTTACACAAATCGTGTCCTCAAGGAGTACAG  515

Query  519  AGATGTGGATAAGAAGCATGTAGACTGGGTCAAAGCTTATTTAAGTATATGGACAGAGCTGCAGGCTTACATTA  592
            |||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  516  AGATGTGGATAAGAAGCATGTGGACTGGGTCAGAGCTTACTTGAGTATATGGACGGAGCTGCAGGCTTACATCA  589

Query  593  AGGAGTTCCATACCACCGGACTGGCCTGGAGCAAAACGGGGCCTGTGGCAAAAGAACTGAGCGGACTGCCATCT  666
            |||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct  590  AGGAGTTTCATACTACTGGCCTGGCCTGGAGCAAGACGGGGCCTGTGGCAAAAGAACTGAGTGGATTGCCATCT  663

Query  667  GGACCCTCTGCCGGATCAGGTCCTCCTCCCCCTCCACCAGGCCCCCCTCCTCCCCCAGTCTCTACCAGTTCAGG  740
            ||||||||||..||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||||||||||.||
Sbjct  664  GGACCCTCTGTGGGATCAGGCCCACCTCCTCCCCCACCGGGCCCGCCTCCTCCCCCAATCTCTACCAGTTCTGG  737

Query  741  CTCAGATGAGTCTGCTTCCCGCTCAGCACTGTTCGCGCAGATTAATCAGGGGGAGAGCATTACACATGCCCTGA  814
            .||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  738  TTCTGACGACTCTGCATCACGCTCAGCACTGTTTGCACAGATTAATCAGGGGGAAAGCATCACACATGCCCTGA  811

Query  815  AACATGTATCTGATGACATGAAGACTCACAAGAACCCTGCCCTGAAGGCTCAGAGTGGTCCAGTACGCAGTGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  812  AACATGTATCTGATGACATGAAGACTCACAAGAACCCTGCCCTGAAAGCTCAGAGTGGTCCAGTTCGGAGTGGC  885

Query  889  CCCAAACCATTCTCTGCACCTAAACCCCAAACCAGCCCATCCCCCAAACGAGCCACAAAGAAGGAGCCAGCTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||||||||||||.||||||.|
Sbjct  886  CCCAAACCATTCTCTGCACCTAAACCCCAAACTAGCCCCTCCCCCAAACCAGCCACAAAGAAGGAACCAGCTCT  959

Query  963  ACTTGAACTGGAGGGCAAGAAGTGGAGAGTGGAAAATCAGGAAAATGTTTCCAACCTGGTGATTGAGGACACAG  1036
            .||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  960  GCTGGAACTGGAAGGCAAGAAATGGAGAGTGGAAAACCAGGAGAATGTTTCCAACCTGGTGATCGATGACACTG  1033

Query 1037  AGCTGAAACAGGTGGCTTACATATACAAGTGTGTCAACACGACATTGCAAATCAAGGGCAAAATTAACTCCATT  1110
            |||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  AGCTGAAGCAGGTGGCTTACATCTACAAGTGTGTCAACACAACATTGCAAATCAAGGGCAAAATTAACTCCATT  1107

Query 1111  ACAGTAGATAACTGTAAGAAACTTGGCCTGGTATTCGATGACGTGGTGGGCATTGTGGAGATAATCAACAGTAA  1184
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 1108  ACAGTAGATAACTGTAAGAAGCTTGGCCTGGTGTTTGATGACGTGGTGGGCATTGTGGAGATAATCAATAGTAG  1181

Query 1185  GGATGTCAAAGTTCAGGTAATGGGTAAAGTGCCAACCATATCCATCAACAAAACAGATGGCTGCCATGCTTACC  1258
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  GGATGTCAAAGTTCAGGTGATGGGAAAAGTGCCAACCATTTCCATTAACAAAACAGATGGCTGCCATGCTTACC  1255

Query 1259  TGAGCAAGAATTCCCTGGATTGTGAAATAGTCAGTGCCAAATCTTCCGAGATGAATGTCCTCATTCCTACAGAA  1332
            ||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1256  TGAGCAAGAACTCCCTGGACTGTGAGATAGTCAGTGCCAAATCTTCTGAGATGAATGTCCTCATTCCTACCGAA  1329

Query 1333  GGCGGTGACTTTAATGAATTCCCAGTTCCTGAGCAGTTCAAGACCCTATGGAACGGGCAGAAGTTGGTCACCAC  1406
            ||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1330  GGCGGTGATTTTAACGAGTTCCCAGTCCCCGAGCAGTTCAAGACCCTGTGGAACGGACAGAAGTTGGTCACCAC  1403

Query 1407  AGTGACAGAAATTGCTGGA  1425
            ||||||||||||.||||||
Sbjct 1404  AGTGACAGAAATCGCTGGA  1422