Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480321
• Subject: XM_005259065.4
• Aligned Length: 1278
• Identities: 959
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||...||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCCACCCACGACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCAACCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAATATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCAGGAAGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAATGGGAGGTGATGAGAATAGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATATCTGGAGACTCCCAAG  444
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||                  
Sbjct  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTA------------------  426

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
                                                                                      
Sbjct  427  --------------------------------------------------------------------------  426

Query  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAAA  592
                                                                                      
Sbjct  427  --------------------------------------------------------------------------  426

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
                                                                                      
Sbjct  427  --------------------------------------------------------------------------  426

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
                                                   |.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  ---------------------------------------CACCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  461

Query  741  CAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  535

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  609

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  610  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  683

Query  963  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  758  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGAA  831

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCTC  905

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGGTAAGCGGATCCCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGGTAAGTGGATCCCAG  979

Query 1259  TATCCTTGGCAATAGGGATT  1278
            .|||.||||||||||||.||
Sbjct  980  CATCGTTGGCAATAGGGTTT  999