Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480321
• Subject: XM_011526987.3
• Aligned Length: 1294
• Identities: 878
• Gaps: 392

Alignment

Query    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAACTTCTGGAACCCACCCACGACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCAACCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AACAATATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACC----CA--GGAAGACGCAGGATCCTACACCT  364
                                               ||||  ||    ||  |||||..||||            
Sbjct    1  -----------------------------------ATGT--CCTTGGCAAGGGAAGCTGCAG------------  25

Query  365  TACACATCATA--ATGGGAGGTGA--TGAGAATAGAGGAGTAACT--GGACATTTCACCTTCACCTTAT-ATC-  430
             |.|.|.||||  .||||.||..|  |.|||.|      |.||||  |.|.|||   ||..|||...|| .|| 
Sbjct   26  -AGAAAACATACCTTGGGCGGCAAAGTAAGACT------GAAACTAAGAAGATT---CCAGCACTGCATGCTCC  89

Query  431  --TGGAGACTCCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAA  502
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   90  AATGGAGACTCCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAA  163

Query  503  CCTGTGATCCTGAGACTCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGG  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  164  CCTGTGATCCTGAGACTCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGG  237

Query  577  TTGCAGTTGTCTGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATG  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  238  TTGCAGTTGTCTGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATG  311

Query  651  TGAAATACGGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGC  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  312  TGAAATACGGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGC  385

Query  725  CCTACATCACCATCAACAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGT  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  386  CCTACATCACCATCAACAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGT  459

Query  799  GAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGA  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  460  GAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGA  533

Query  873  AAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAAT  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  534  AAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAAT  607

Query  947  ATGGTGGCATCCGCAGTTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCA  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  608  ATGGTGGCATCCGCAGTTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCA  681

Query 1021  TTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTC  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  682  TTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTC  755

Query 1095  TTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCG  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  756  TTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCG  829

Query 1169  GGCTCTATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCT  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  830  GGCTCTATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCT  903

Query 1243  GGTAAGCGGATCCCAGTATCCTTGGCAATAGGGATT  1278
            |   |..|||   ||.||.||               
Sbjct  904  G---ACTGGA---CATTACCC---------------  918