Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480322
• Subject: NM_001347077.1
• Aligned Length: 1734
• Identities: 1445
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACCGGCCTCCCGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCAGCGCGAAGCGGAAGCAGGAGGAGAAGCACCTGAAGATGCTGCGGGACATGACGGGGCTGCCGCA  74

Query   75  CAACCGAAAGTGCTTCGACTGCGACCAGCGCGGCCCCACCTACGTTAACATGACGGTCGGCTCCTTCGTGTGTA  148
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  CAACCGCAAGTGTTTCGACTGCGACCAGCGCGGCCCCACCTACGTGAACATGACGGTCGGCTCGTTCGTGTGCA  148

Query  149  CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGCGAGGATTAAATCCACCACACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTCACA  222
            ||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CCTCCTGCTCCGGCAGCCTGAGAGGGTTAAATCCACCTCACAGGGTGAAATCTATCTCCATGACAACATTTACA  222

Query  223  CAACAGGAAATTGAATTCTTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGTAAGCAGATTTGGCTAGGATTATTTGATGA  296
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAACAGGAAATTGAATTCCTACAAAAACATGGAAATGAAGTCTGCAAACAGATATGGCTAGGATTATTTGATGA  296

Query  297  TAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAAAAGTATGAAAAGA  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  297  CAGATCTTCAGCAATTCCAGACTTCAGGGATCCACAAAAAGTGAAAGAGTTTCTACAAGAGAAATATGAAAAGA  370

Query  371  AAAGATGGTATGTCCCGCCAGAACAAGCCAAAGTCGTGGCATCAGTTCATGCATCTATTTCAGGGTCCTCTGCC  444
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  AAAGATGGTATGTTCCGCCAGAGCAAGCCAAAGTGGTGGCCTCGGTTCATGCGTCTATTTCAGGGTCTTCTGCC  444

Query  445  AGTAGCACAAGCAGCACACCTGAGGTCAAACCACTGAAATCTCTTTTAGGGGATTCTGCACCAACACTGCACTT  518
            ||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||..||||||||.|
Sbjct  445  AGCAGCACAAGCAGCACCCCGGAGGTCAAGCCCCTGAAATCCCTGTTGGGAGAGTCTGCACCCGCACTGCACCT  518

Query  519  AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGTTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAATTTG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  AAATAAGGGCACACCTAGTCAGTCCCCAGTTGTAGGTCGCTCTCAAGGGCAGCAGCAGGAGAAGAAGCAGTTTG  592

Query  593  ACCTTTTAAGTGATCTCGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT  666
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTTTTGAGTGATCTTGGCTCAGACATCTTTGCTGCTCCAGCTCCTCAGTCAACAGCTACAGCCAATTTTGCT  666

Query  667  AACTTTGCACATTTCAACAGTCATGCAGCTCAGAATTCTGCAAATGCAGATTTTGCAAACTTTGATGCATTTGG  740
            |||||||||||.||.||||||||||                                                 
Sbjct  667  AACTTTGCACACTTTAACAGTCATG-------------------------------------------------  691

Query  741  ACAGTCTAGTGGTTCGAGTAATTTTGGAGGTTTCCCCACAGCAAGTCACTCTCCTTTTCAGCCCCAAACTACAG  814
                                                                                   |||
Sbjct  692  -----------------------------------------------------------------------CAG  694

Query  815  GTGGAAGTGCTGCATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCCAAATCCTCCAGTGCTGATTTT  888
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  695  GTGGAAGTGCTGGATCAGTAAATGCTAATTTTGCTCATTTTGATAACTTCCCTAAATCCTCCAGTGCTGATTTT  768

Query  889  GGAACCTTCAATACTTCCCAGAGTCATCAAACAGCATCAGCTGTTAGTAAAGTTTCAACGAACAAAGCTGGTTT  962
            ||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  769  GGAACCTTCAGTACATCCCAGAGTCATCAGACAGCATCAACTGTTAGTAAAGTTTCAACAAACAAAGCTGGTTT  842

Query  963  ACAGACTGCAGACAAATATGCAGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCCGGGCAAGGTGGTGATCAGG  1036
            ||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  843  ACAGACAGCAGACAAATATGCGGCACTTGCTAATTTAGACAATATCTTCAGTGCTGGGCAAGGAGGTGATCAAG  916

Query 1037  GAAGTGGCTTTGGGACCACAGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCAGTCAAGTGCATCT  1110
            |.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  917  GGAGTGGTTTTGGGACCACGGGTAAAGCTCCTGTTGGTTCTGTGGTTTCAGTTCCCAGTCATTCAAGTGCATCT  990

Query 1111  TCAGACAAGTATGCAGCTCTGGCAGAACTAGACAGCGTTTTCAGTTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTATAC  1184
            |||||||||||||||||.||||||||..||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  991  TCAGACAAGTATGCAGCCCTGGCAGAGTTAGACAGCGTGTTCAGCTCTGCAGCCACCTCCAGTAATGCGTACAC  1064

Query 1185  TTCCACAAGTAATGCTAGCAGCAATGTTTTTGGAACAGTGCCAGTGGTTGCTTCTGCACAGACACAGCCTGCTT  1258
            ..||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||||.|||.|||||.||||||||.|||||| 
Sbjct 1065  GCCCACCAGTAATGCTAGCAGCAGTGTCTTTGGAACAGTGCCTGTGGGTGCCTCTGCTCAGACACAACCTGCT-  1137

Query 1259  CATCAAGTGTGCCTGCTCCATTTGGAGCTACGCCTTCCACAAATCCATTTGTTGCTGCTGCTGGTCCTTCTGTG  1332
              |||||||..||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 1138  --TCAAGTGGTCCTGCTCCGTTTGGGGCTACGCCTTCTACGAATCCATTTGTTGCTGCTACTGGTCCTTCTGCG  1209

Query 1333  GCATCTTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACA-----------------------------  1377
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct 1210  GCATCGTCTACAAACCCATTTCAGACCAATGCCAGAGGAGCAACAGGCCTTTCTGGAGCAATGCATTCTCAAGT  1283

Query 1378  -------------------GCGGCAACCTTTGGCACTGCATCCATGAGCATGCCCACGGGATTCGGCACTCCTG  1432
                               |||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||..|.|||||.||||||||||
Sbjct 1284  GTTTCCTCACGCTCATTTTGCGGCAACCTTTGGCACCGCATCTATGAGTATGCCAGCAGGATTTGGCACTCCTG  1357

Query 1433  CTCCCTACAGTCTTCCCACCAGCTTTAGTGGCAGCTTTCAGCAGCCTGCCTTTCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCT  1506
            |.|..||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  CCCAGTATAGTCTCCCTACCAGCTTTAGTGGCAGTTTCCAGCAGCCTGCCTTCCCAGCCCAAGCAGCTTTCCCT  1431

Query 1507  CAACAGACAGCTTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTTGCAGCATTTGGACAAACAAAGCCAGTAGTAAC  1580
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1432  CAGCAGACAGCCTTTTCTCAACAGCCCAATGGTGCAGGTTTCGCCACGTTTGGACAAACAAAACCAGTGGTAAC  1505

Query 1581  CCCTTTTGGTCAAGTTGCAGCTGCTGGAGTATCTAGTAATCCTTTTATGACTGGTGCACCAACAGGACAATTTC  1654
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||
Sbjct 1506  CCCTTTCGGTCAAGTAGCAGCTGCTGGAGTGTCTAGTAATCCTTTTATGACTGGTGCGCCGACAGGACAACTTC  1579

Query 1655  CAACAGGAAGCTCATCAACCAATCCTTTCTTA  1686
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1580  CAACAGGAAGCTCATCCACCAACCCTTTCTTA  1611