Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480349
• Subject: NM_001024837.2
• Aligned Length: 2136
• Identities: 1848
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGGATATAGAAGATGAAGAAAACATGAGTTCCAGCAGCACTGATGTGAAGGAAAACCGCAATCTGGACAACGT  74
            ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGGATATAGAAGATGAAGAGAATATGAGTTCCAGCAGCACTGATATTAAAGAAAACCGCAATCTGGACAACAT  74

Query   75  GTCCCCCAAGGATGGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGCTCTCAGCTCTCCAATGGGGGTGGTGGTGGCCCCG  148
            |.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||...||.|||||||||.||||||||||||.||.||.
Sbjct   75  GCCCCCCAAGGACAGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGTATTCCGCTCTCCAACGGGGGTGGTGGTAGCACCA  148

Query  149  GCAGAAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGCCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAAAGGAGGAAAACACCA  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct  149  GCAGGAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGTCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAGCGAAGGAAAACACCA  222

Query  223  GGGCCCGTCCTCCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAATGAGATCAAGCCTGGTTTGCAGTACACACTCCTGTC  296
            |||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||.|||||
Sbjct  223  GGGCCTGTTCTGCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAACGAGATCAAACCTGGCTTACAGTACATGCTGCTGTC  296

Query  297  CCAGACTGGGCCCGTGCACGCGCCTTTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTGAATGGCCAGGTTTTTGAGGGCTCTG  370
            ||||||.||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGACAGGACCCGTGCATGCACCTCTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTAAACGGGCAGGTTTTTGAGGGCTCTG  370

Query  371  GTCCCACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCTTGAGGTCTTTCGTTCAGTTTCCTAATGCC  444
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct  371  GCCCTACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCCTGAGGTCTTTTGTCCAGTTTCCCAACGCC  444

Query  445  TCTGAGGCCCACCTGGCCATGGGGAGGACCCTGTCTGTCAACACGGACTTCACATCTGACCAGGCCGACTTCCC  518
            ||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  445  TCCGAGGCCCACCTAGCCATGGGAAGGACCCTCTCTGTGAACACAGACTTCACGTCTGACCAGGCTGACTTCCC  518

Query  519  TGACACGCTCTTCAATGGTTTTGAAACTCCTGACAAGGCGGAGCCTCCCTTTTACGTGGGCTCCAATGGGGATG  592
            ||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  519  TGACACACTCTTCAATGGCTTCGAGACTCCAGACAAGTCAGAGCCACCCTTCTACGTAGGCTCCAACGGGGATG  592

Query  593  ACTCCTTCAGTTCCAGCGGGGACCTCAGCTTGTCTGCTTCCCCGGTGCCTGCCAGCCTAGCCCAGCCTCCTCT-  665
            ||||.|||||.||.||.||.||..|||||.|.||.||.|||||.||||||||||||||..||||||||||||| 
Sbjct  593  ACTCGTTCAGCTCAAGTGGAGATGTCAGCCTATCGGCCTCCCCAGTGCCTGCCAGCCTTACCCAGCCTCCTCTG  666

Query  666  -CCCTGCCTTACCACCATTCCCACCCCCGAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAACGAACTGCGCCCAGGA  738
             ||.|.||  ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct  667  CCCATCCC--ACCACCATTCCCACCCCCAAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAATGAGCTACGCCCAGGG  738

Query  739  CTCAAGTATGACTTCCTCTCCGAGAGCGGGGAGAGCCATGCCAAGAGCTTCGTCATGTCTGTGGTCGTGGATGG  812
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  739  CTGAAGTATGACTTCCTCTCTGAGAGTGGGGAGAGCCACGCCAAGAGCTTCGTCATGTCCGTGGTGGTAGATGG  812

Query  813  TCAGTTCTTTGAAGGCTCGGGGAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCGCAGTCTGCCCTGGCCGCCA  886
            .|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|..
Sbjct  813  CCAGTTCTTTGAGGGCTCAGGAAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCACAGTCTGCCTTGGCTACTG  886

Query  887  TTTTTAACTTGCACTTGGATCAGACGCCATCTCGCCAGCCTATTCCCAGTGAGGGTCTTCAGCTGCATTTACCG  960
            |.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct  887  TCTTCAATTTGCACTTGGACCAAACACCATCTCGCCAGCCTGTCCTCAGTGAGGGTCTTCAGTTGCATTTGCCA  960

Query  961  CAGGTTTTAGCTGACGCTGTCTCACGCCTGGTCCTGGGTAAGTTTGGTGACCTGACCGACAACTTCTCCTCCCC  1034
            |||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  961  CAGGTATTGGCAGATGCTGTCTCCCGCCTGGTCCTGGGTAAGTTCAGTGACCTGACAGACAACTTTTCCTCCCC  1034

Query 1035  TCACGCTCGCAGAAAAGTGCTGGCTGGAGTCGTCATGACAACAGGCACAGATGTTAAAGATGCCAAGGTGATAA  1108
            |||.||.||.||.||||||||..|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1035  TCATGCACGAAGGAAAGTGCTCTCTGGAGTAGTGATGACCACAGGTACAGATGTCAAAGATGCCAAGGTGATAA  1108

Query 1109  GTGTTTCTACAGGAACAAAATGTATTAATGGTGAATACATGAGTGATCGTGGCCTTGCATTAAATGACTGCCAT  1182
            |||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.
Sbjct 1109  GTGTTTCGACAGGGACGAAGTGTATCAACGGTGAATACATGAGTGACCGTGGCCTCGCACTCAATGACTGCCAC  1182

Query 1183  GCAGAAATAATATCTCGGAGATCCTTGCTCAGATTTCTTTATACACAACTTGAGCTTTACTTAAATAACAAAGA  1256
            |||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1183  GCAGAGATAATCTCCCGAAGGTCCCTGCTCAGGTTTCTTTATGCACAGCTCGAGCTTTATTTAAATAACAAAGA  1256

Query 1257  TGATCA-AAAAAGATCCATCTTTCAGAAATCAGAGCGAGGGGGGTTTAGGCTGAAGGAGAATGTCCAGTTTCAT  1329
            .||.|| |||||| |||||.||||||||.||||||||.||.|||||..||||||||||.|..||.|||||.||.
Sbjct 1257  AGACCAGAAAAAG-TCCATATTTCAGAAGTCAGAGCGGGGTGGGTTCCGGCTGAAGGATACCGTGCAGTTCCAC  1329

Query 1330  CTGTACATCAGCACCTCTCCCTGTGGAGATGCCAGAATCTTCTCACCACATGAGCCAATCCTGGA---------  1394
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||         
Sbjct 1330  CTGTACATCAGCACCTCGCCCTGCGGAGACGCCAGAATATTCTCTCCCCACGAGCCCGTGCTAGAGGGTATGAC  1403

Query 1395  ---------------------AGAACCAGCAGATAGACACCCAAATCGTAAAGCAAGAGGACAGCTACGGACCA  1447
                                 ||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1404  GCCAGACTCTCACCAGCTGACAGAACCAGCAGATAGACATCCGAATCGCAAAGCAAGGGGACAGCTACGGACGA  1477

Query 1448  AAATAGAGTCTGGTGAGGGGACGATTCCAGTGCGCTCCAATGCGAGCATCCAAACGTGGGACGGGGTGCTGCAA  1521
            |||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1478  AAATAGAGTCTGGCGAGGGGACAATCCCTGTGCGCTCAAATGCCAGCATCCAGACCTGGGACGGGGTGCTGCAG  1551

Query 1522  GGGGAGCGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGTGACAAGATTGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGATCCCT  1595
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1552  GGGGAACGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGTGACAAGATAGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGGTCCCT  1625

Query 1596  GCTCAGCATTTTCGTGGAGCCCATTTACTTCTCGAGCATCATCCTGGGCAGCCTTTACCACGGGGACCACCTTT  1669
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1626  GCTCAGCATTTTCGTGGAACCCATCTACTTCTCCAGCATCATCTTGGGCAGCCTGTACCACGGGGACCACCTCT  1699

Query 1670  CCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACATAGAGGACCTGCCACCTCTCTACACCCTCAACAAGCCTTTGCTC  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 1700  CCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACATAGAGGACCTGCCACCGCTCTACACTCTCAACAAGCCCCTGCTC  1773

Query 1744  AGTGGCATCAGCAATGCAGAAGCACGGCAGCCAGGGAAGGCCCCCAACTTCAGTGTCAACTGGACGGTAGGCGA  1817
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1774  AGCGGCATCAGCAATGCAGAGGCACGGCAGCCAGGGAAGGCACCCAACTTCAGTGTCAACTGGACAGTGGGTGA  1847

Query 1818  CTCCGCTATTGAGGTCATCAACGCCACGACTGGGAAGGATGAGCTGGGCCGCGCGTCCCGCCTGTGTAAGCACG  1891
            |.||.|.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 1848  CGCCACCATTGAGGTCATCAATGCCACAACAGGGAAGGATGAGCTTGGCCGCCCATCCCGCCTGTGTAAGCACG  1921

Query 1892  CGTTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTGCACGGCAAGGTTCCCTCCCACTTACTACGCTCCAAGATTACCAAACCC  1965
            ||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|.||.|||.|||||||.||.||.||.
Sbjct 1922  CGCTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTACACGGCAAGGTTCCCCCCCACCTGCTGCGCACCAAGATCACTAAGCCT  1995

Query 1966  AACGTGTACCATGAGTCCAAGCTGGCGGCAAAGGAGTACCAGGCCGCCAAGGCGCGTCTGTTCACAGCCTTCAT  2039
            |.|...|||||.||||||||||||||.||.|.||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1996  ACCACATACCACGAGTCCAAGCTGGCAGCGAGGGAGTACCAGGCTGCCAAGGCCCGTCTGTTCACTGCCTTCAT  2069

Query 2040  CAAGGCGGGGCTGGGGGCCTGGGTGGAGAAGCCCACCGAGCAGGACCAGTTCTCACTCACGCCC  2103
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||.|||
Sbjct 2070  CAAGGCGGGGCTGGGCGCCTGGGTGGAGAAGCCCACAGAGCAGGACCAGTTCTCCTTCACTCCC  2133