Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480349
- Subject:
- NM_130895.3
- Aligned Length:
- 2106
- Identities:
- 1847
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGGATATAGAAGATGAAGAAAACATGAGTTCCAGCAGCACTGATGTGAAGGAAAACCGCAATCTGGACAACGT 74
||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ATGGATATAGAAGATGAAGAGAATATGAGTTCCAGCAGCACTGATATTAAAGAAAACCGCAATCTGGACAACAT 74
Query 75 GTCCCCCAAGGATGGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGCTCTCAGCTCTCCAATGGGGGTGGTGGTGGCCCCG 148
|.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||...||.|||||||||.||||||||||||.||.||.
Sbjct 75 GCCCCCCAAGGACAGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGTATTCCGCTCTCCAACGGGGGTGGTGGTAGCACCA 148
Query 149 GCAGAAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGCCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAAAGGAGGAAAACACCA 222
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 149 GCAGGAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGTCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAGCGAAGGAAAACACCA 222
Query 223 GGGCCCGTCCTCCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAATGAGATCAAGCCTGGTTTGCAGTACACACTCCTGTC 296
|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||.|||||
Sbjct 223 GGGCCTGTTCTGCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAACGAGATCAAACCTGGCTTACAGTACATGCTGCTGTC 296
Query 297 CCAGACTGGGCCCGTGCACGCGCCTTTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTGAATGGCCAGGTTTTTGAGGGCTCTG 370
||||||.||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGACAGGACCCGTGCATGCACCTCTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTAAACGGGCAGGTTTTTGAGGGCTCTG 370
Query 371 GTCCCACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCTTGAGGTCTTTCGTTCAGTTTCCTAATGCC 444
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 371 GCCCTACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCCTGAGGTCTTTTGTCCAGTTTCCCAACGCC 444
Query 445 TCTGAGGCCCACCTGGCCATGGGGAGGACCCTGTCTGTCAACACGGACTTCACATCTGACCAGGCCGACTTCCC 518
||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 445 TCCGAGGCCCACCTAGCCATGGGAAGGACCCTCTCTGTGAACACAGACTTCACGTCTGACCAGGCTGACTTCCC 518
Query 519 TGACACGCTCTTCAATGGTTTTGAAACTCCTGACAAGGCGGAGCCTCCCTTTTACGTGGGCTCCAATGGGGATG 592
||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 519 TGACACACTCTTCAATGGCTTCGAGACTCCAGACAAGTCAGAGCCACCCTTCTACGTAGGCTCCAACGGGGATG 592
Query 593 ACTCCTTCAGTTCCAGCGGGGACCTCAGCTTGTCTGCTTCCCCGGTGCCTGCCAGCCTAGCCCAGCCTCCTCT- 665
||||.|||||.||.||.||.||..|||||.|.||.||.|||||.||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 593 ACTCGTTCAGCTCAAGTGGAGATGTCAGCCTATCGGCCTCCCCAGTGCCTGCCAGCCTTACCCAGCCTCCTCTG 666
Query 666 -CCCTGCCTTACCACCATTCCCACCCCCGAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAACGAACTGCGCCCAGGA 738
||.|.|| ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 667 CCCATCCC--ACCACCATTCCCACCCCCAAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAATGAGCTACGCCCAGGG 738
Query 739 CTCAAGTATGACTTCCTCTCCGAGAGCGGGGAGAGCCATGCCAAGAGCTTCGTCATGTCTGTGGTCGTGGATGG 812
||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 739 CTGAAGTATGACTTCCTCTCTGAGAGTGGGGAGAGCCACGCCAAGAGCTTCGTCATGTCCGTGGTGGTAGATGG 812
Query 813 TCAGTTCTTTGAAGGCTCGGGGAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCGCAGTCTGCCCTGGCCGCCA 886
.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|..
Sbjct 813 CCAGTTCTTTGAGGGCTCAGGAAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCACAGTCTGCCTTGGCTACTG 886
Query 887 TTTTTAACTTGCACTTGGATCAGACGCCATCTCGCCAGCCTATTCCCAGTGAGGGTCTTCAGCTGCATTTACCG 960
|.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct 887 TCTTCAATTTGCACTTGGACCAAACACCATCTCGCCAGCCTGTCCTCAGTGAGGGTCTTCAGTTGCATTTGCCA 960
Query 961 CAGGTTTTAGCTGACGCTGTCTCACGCCTGGTCCTGGGTAAGTTTGGTGACCTGACCGACAACTTCTCCTCCCC 1034
|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 961 CAGGTATTGGCAGATGCTGTCTCCCGCCTGGTCCTGGGTAAGTTCAGTGACCTGACAGACAACTTTTCCTCCCC 1034
Query 1035 TCACGCTCGCAGAAAAGTGCTGGCTGGAGTCGTCATGACAACAGGCACAGATGTTAAAGATGCCAAGGTGATAA 1108
|||.||.||.||.||||||||..|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1035 TCATGCACGAAGGAAAGTGCTCTCTGGAGTAGTGATGACCACAGGTACAGATGTCAAAGATGCCAAGGTGATAA 1108
Query 1109 GTGTTTCTACAGGAACAAAATGTATTAATGGTGAATACATGAGTGATCGTGGCCTTGCATTAAATGACTGCCAT 1182
|||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.
Sbjct 1109 GTGTTTCGACAGGGACGAAGTGTATCAACGGTGAATACATGAGTGACCGTGGCCTCGCACTCAATGACTGCCAC 1182
Query 1183 GCAGAAATAATATCTCGGAGATCCTTGCTCAGATTTCTTTATACACAACTTGAGCTTTACTTAAATAACAAAGA 1256
|||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1183 GCAGAGATAATCTCCCGAAGGTCCCTGCTCAGGTTTCTTTATGCACAGCTCGAGCTTTATTTAAATAACAAAGA 1256
Query 1257 TGATCA-AAAAAGATCCATCTTTCAGAAATCAGAGCGAGGGGGGTTTAGGCTGAAGGAGAATGTCCAGTTTCAT 1329
.||.|| |||||| |||||.||||||||.||||||||.||.|||||..||||||||||.|..||.|||||.||.
Sbjct 1257 AGACCAGAAAAAG-TCCATATTTCAGAAGTCAGAGCGGGGTGGGTTCCGGCTGAAGGATACCGTGCAGTTCCAC 1329
Query 1330 CTGTACATCAGCACCTCTCCCTGTGGAGATGCCAGAATCTTCTCACCACATGAGCCAATCCTGGAAGAACCAGC 1403
|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||.||||||||
Sbjct 1330 CTGTACATCAGCACCTCGCCCTGCGGAGACGCCAGAATATTCTCTCCCCACGAGCCCGTGCTAGAGGAACCAGC 1403
Query 1404 AGATAGACACCCAAATCGTAAAGCAAGAGGACAGCTACGGACCAAAATAGAGTCTGGTGAGGGGACGATTCCAG 1477
|||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 1404 AGATAGACATCCGAATCGCAAAGCAAGGGGACAGCTACGGACGAAAATAGAGTCTGGCGAGGGGACAATCCCTG 1477
Query 1478 TGCGCTCCAATGCGAGCATCCAAACGTGGGACGGGGTGCTGCAAGGGGAGCGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGT 1551
|||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 TGCGCTCAAATGCCAGCATCCAGACCTGGGACGGGGTGCTGCAGGGGGAACGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGT 1551
Query 1552 GACAAGATTGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGATCCCTGCTCAGCATTTTCGTGGAGCCCATTTACTT 1625
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1552 GACAAGATAGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGGTCCCTGCTCAGCATTTTCGTGGAACCCATCTACTT 1625
Query 1626 CTCGAGCATCATCCTGGGCAGCCTTTACCACGGGGACCACCTTTCCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACA 1699
|||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 CTCCAGCATCATCTTGGGCAGCCTGTACCACGGGGACCACCTCTCCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACA 1699
Query 1700 TAGAGGACCTGCCACCTCTCTACACCCTCAACAAGCCTTTGCTCAGTGGCATCAGCAATGCAGAAGCACGGCAG 1773
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1700 TAGAGGACCTGCCACCGCTCTACACTCTCAACAAGCCCCTGCTCAGCGGCATCAGCAATGCAGAGGCACGGCAG 1773
Query 1774 CCAGGGAAGGCCCCCAACTTCAGTGTCAACTGGACGGTAGGCGACTCCGCTATTGAGGTCATCAACGCCACGAC 1847
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||.|.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1774 CCAGGGAAGGCACCCAACTTCAGTGTCAACTGGACAGTGGGTGACGCCACCATTGAGGTCATCAATGCCACAAC 1847
Query 1848 TGGGAAGGATGAGCTGGGCCGCGCGTCCCGCCTGTGTAAGCACGCGTTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTGCACG 1921
.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1848 AGGGAAGGATGAGCTTGGCCGCCCATCCCGCCTGTGTAAGCACGCGCTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTACACG 1921
Query 1922 GCAAGGTTCCCTCCCACTTACTACGCTCCAAGATTACCAAACCCAACGTGTACCATGAGTCCAAGCTGGCGGCA 1995
|||||||||||.|||||.|.||.|||.|||||||.||.||.||.|.|...|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1922 GCAAGGTTCCCCCCCACCTGCTGCGCACCAAGATCACTAAGCCTACCACATACCACGAGTCCAAGCTGGCAGCG 1995
Query 1996 AAGGAGTACCAGGCCGCCAAGGCGCGTCTGTTCACAGCCTTCATCAAGGCGGGGCTGGGGGCCTGGGTGGAGAA 2069
|.||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1996 AGGGAGTACCAGGCTGCCAAGGCCCGTCTGTTCACTGCCTTCATCAAGGCGGGGCTGGGCGCCTGGGTGGAGAA 2069
Query 2070 GCCCACCGAGCAGGACCAGTTCTCACTCACGCCC 2103
||||||.|||||||||||||||||..||||.|||
Sbjct 2070 GCCCACAGAGCAGGACCAGTTCTCCTTCACTCCC 2103