Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480349
- Subject:
- XM_006513064.1
- Aligned Length:
- 2136
- Identities:
- 1829
- Gaps:
- 54
Alignment
Query 1 ATGGATATAGAAGATGAAGAAAACATGAGTTCCAGCAGCACTGATGTGAAGGAAAACCGCAATCTGGACAACGT 74
|||..|.||| |||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ATGCCTCTAG------------------GTTCCAGCAGCACTGATATTAAAGAAAACCGCAATCTGGACAACAT 56
Query 75 GTCCCCCAAGGATGGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGCTCTCAGCTCTCCAATGGGGGTGGTGGTGGCCCCG 148
|.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||...||.|||||||||.||||||||||||.||.||.
Sbjct 57 GCCCCCCAAGGACAGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGTATTCCGCTCTCCAACGGGGGTGGTGGTAGCACCA 130
Query 149 GCAGAAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGCCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAAAGGAGGAAAACACCA 222
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 131 GCAGGAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGTCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAGCGAAGGAAAACACCA 204
Query 223 GGGCCCGTCCTCCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAATGAGATCAAGCCTGGTTTGCAGTACACACTCCTGTC 296
|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||.|||||
Sbjct 205 GGGCCTGTTCTGCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAACGAGATCAAACCTGGCTTACAGTACATGCTGCTGTC 278
Query 297 CCAGACTGGGCCCGTGCACGCGCCTTTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTGAATGGCCAGGTTTTTGAGGGCTCTG 370
||||||.||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 279 CCAGACAGGACCCGTGCATGCACCTCTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTAAACGGGCAGGTTTTTGAGGGCTCTG 352
Query 371 GTCCCACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCTTGAGGTCTTTCGTTCAGTTTCCTAATGCC 444
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 353 GCCCTACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCCTGAGGTCTTTTGTCCAGTTTCCCAACGCC 426
Query 445 TCTGAGGCCCACCTGGCCATGGGGAGGACCCTGTCTGTCAACACGGACTTCACATCTGACCAGGCCGACTTCCC 518
||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 427 TCCGAGGCCCACCTAGCCATGGGAAGGACCCTCTCTGTGAACACAGACTTCACGTCTGACCAGGCTGACTTCCC 500
Query 519 TGACACGCTCTTCAATGGTTTTGAAACTCCTGACAAGGCGGAGCCTCCCTTTTACGTGGGCTCCAATGGGGATG 592
||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 501 TGACACACTCTTCAATGGCTTCGAGACTCCAGACAAGTCAGAGCCACCCTTCTACGTAGGCTCCAACGGGGATG 574
Query 593 ACTCCTTCAGTTCCAGCGGGGACCTCAGCTTGTCTGCTTCCCCGGTGCCTGCCAGCCTAGCCCAGCCTCCTCT- 665
||||.|||||.||.||.||.||..|||||.|.||.||.|||||.||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 575 ACTCGTTCAGCTCAAGTGGAGATGTCAGCCTATCGGCCTCCCCAGTGCCTGCCAGCCTTACCCAGCCTCCTCTG 648
Query 666 -CCCTGCCTTACCACCATTCCCACCCCCGAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAACGAACTGCGCCCAGGA 738
||.|.|| ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 649 CCCATCCC--ACCACCATTCCCACCCCCAAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAATGAGCTACGCCCAGGG 720
Query 739 CTCAAGTATGACTTCCTCTCCGAGAGCGGGGAGAGCCATGCCAAGAGCTTCGTCATGTCTGTGGTCGTGGATGG 812
||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 721 CTGAAGTATGACTTCCTCTCTGAGAGTGGGGAGAGCCACGCCAAGAGCTTCGTCATGTCCGTGGTGGTAGATGG 794
Query 813 TCAGTTCTTTGAAGGCTCGGGGAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCGCAGTCTGCCCTGGCCGCCA 886
.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|..
Sbjct 795 CCAGTTCTTTGAGGGCTCAGGAAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCACAGTCTGCCTTGGCTACTG 868
Query 887 TTTTTAACTTGCACTTGGATCAGACGCCATCTCGCCAGCCTATTCCCAGTGAGGGTCTTCAGCTGCATTTACCG 960
|.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct 869 TCTTCAATTTGCACTTGGACCAAACACCATCTCGCCAGCCTGTCCTCAGTGAGGGTCTTCAGTTGCATTTGCCA 942
Query 961 CAGGTTTTAGCTGACGCTGTCTCACGCCTGGTCCTGGGTAAGTTTGGTGACCTGACCGACAACTTCTCCTCCCC 1034
|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 943 CAGGTATTGGCAGATGCTGTCTCCCGCCTGGTCCTGGGTAAGTTCAGTGACCTGACAGACAACTTTTCCTCCCC 1016
Query 1035 TCACGCTCGCAGAAAAGTGCTGGCTGGAGTCGTCATGACAACAGGCACAGATGTTAAAGATGCCAAGGTGATAA 1108
|||.||.||.||.||||||||..|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1017 TCATGCACGAAGGAAAGTGCTCTCTGGAGTAGTGATGACCACAGGTACAGATGTCAAAGATGCCAAGGTGATAA 1090
Query 1109 GTGTTTCTACAGGAACAAAATGTATTAATGGTGAATACATGAGTGATCGTGGCCTTGCATTAAATGACTGCCAT 1182
|||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.
Sbjct 1091 GTGTTTCGACAGGGACGAAGTGTATCAACGGTGAATACATGAGTGACCGTGGCCTCGCACTCAATGACTGCCAC 1164
Query 1183 GCAGAAATAATATCTCGGAGATCCTTGCTCAGATTTCTTTATACACAACTTGAGCTTTACTTAAATAACAAAGA 1256
|||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1165 GCAGAGATAATCTCCCGAAGGTCCCTGCTCAGGTTTCTTTATGCACAGCTCGAGCTTTATTTAAATAACAAAGA 1238
Query 1257 TGATCA-AAAAAGATCCATCTTTCAGAAATCAGAGCGAGGGGGGTTTAGGCTGAAGGAGAATGTCCAGTTTCAT 1329
.||.|| |||||| |||||.||||||||.||||||||.||.|||||..||||||||||.|..||.|||||.||.
Sbjct 1239 AGACCAGAAAAAG-TCCATATTTCAGAAGTCAGAGCGGGGTGGGTTCCGGCTGAAGGATACCGTGCAGTTCCAC 1311
Query 1330 CTGTACATCAGCACCTCTCCCTGTGGAGATGCCAGAATCTTCTCACCACATGAGCCAATCCTGGA--------- 1394
|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||
Sbjct 1312 CTGTACATCAGCACCTCGCCCTGCGGAGACGCCAGAATATTCTCTCCCCACGAGCCCGTGCTAGAGGGTATGAC 1385
Query 1395 ---------------------AGAACCAGCAGATAGACACCCAAATCGTAAAGCAAGAGGACAGCTACGGACCA 1447
||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1386 GCCAGACTCTCACCAGCTGACAGAACCAGCAGATAGACATCCGAATCGCAAAGCAAGGGGACAGCTACGGACGA 1459
Query 1448 AAATAGAGTCTGGTGAGGGGACGATTCCAGTGCGCTCCAATGCGAGCATCCAAACGTGGGACGGGGTGCTGCAA 1521
|||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1460 AAATAGAGTCTGGCGAGGGGACAATCCCTGTGCGCTCAAATGCCAGCATCCAGACCTGGGACGGGGTGCTGCAG 1533
Query 1522 GGGGAGCGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGTGACAAGATTGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGATCCCT 1595
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1534 GGGGAACGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGTGACAAGATAGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGGTCCCT 1607
Query 1596 GCTCAGCATTTTCGTGGAGCCCATTTACTTCTCGAGCATCATCCTGGGCAGCCTTTACCACGGGGACCACCTTT 1669
||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1608 GCTCAGCATTTTCGTGGAACCCATCTACTTCTCCAGCATCATCTTGGGCAGCCTGTACCACGGGGACCACCTCT 1681
Query 1670 CCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACATAGAGGACCTGCCACCTCTCTACACCCTCAACAAGCCTTTGCTC 1743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 1682 CCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACATAGAGGACCTGCCACCGCTCTACACTCTCAACAAGCCCCTGCTC 1755
Query 1744 AGTGGCATCAGCAATGCAGAAGCACGGCAGCCAGGGAAGGCCCCCAACTTCAGTGTCAACTGGACGGTAGGCGA 1817
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1756 AGCGGCATCAGCAATGCAGAGGCACGGCAGCCAGGGAAGGCACCCAACTTCAGTGTCAACTGGACAGTGGGTGA 1829
Query 1818 CTCCGCTATTGAGGTCATCAACGCCACGACTGGGAAGGATGAGCTGGGCCGCGCGTCCCGCCTGTGTAAGCACG 1891
|.||.|.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 1830 CGCCACCATTGAGGTCATCAATGCCACAACAGGGAAGGATGAGCTTGGCCGCCCATCCCGCCTGTGTAAGCACG 1903
Query 1892 CGTTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTGCACGGCAAGGTTCCCTCCCACTTACTACGCTCCAAGATTACCAAACCC 1965
||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|.||.|||.|||||||.||.||.||.
Sbjct 1904 CGCTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTACACGGCAAGGTTCCCCCCCACCTGCTGCGCACCAAGATCACTAAGCCT 1977
Query 1966 AACGTGTACCATGAGTCCAAGCTGGCGGCAAAGGAGTACCAGGCCGCCAAGGCGCGTCTGTTCACAGCCTTCAT 2039
|.|...|||||.||||||||||||||.||.|.||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1978 ACCACATACCACGAGTCCAAGCTGGCAGCGAGGGAGTACCAGGCTGCCAAGGCCCGTCTGTTCACTGCCTTCAT 2051
Query 2040 CAAGGCGGGGCTGGGGGCCTGGGTGGAGAAGCCCACCGAGCAGGACCAGTTCTCACTCACGCCC 2103
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||.|||
Sbjct 2052 CAAGGCGGGGCTGGGCGCCTGGGTGGAGAAGCCCACAGAGCAGGACCAGTTCTCCTTCACTCCC 2115