Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480349
• Subject: XM_006513065.1
• Aligned Length: 2106
• Identities: 1828
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGGATATAGAAGATGAAGAAAACATGAGTTCCAGCAGCACTGATGTGAAGGAAAACCGCAATCTGGACAACGT  74
            |||..|.|||                  |||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGCCTCTAG------------------GTTCCAGCAGCACTGATATTAAAGAAAACCGCAATCTGGACAACAT  56

Query   75  GTCCCCCAAGGATGGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGCTCTCAGCTCTCCAATGGGGGTGGTGGTGGCCCCG  148
            |.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||...||.|||||||||.||||||||||||.||.||.
Sbjct   57  GCCCCCCAAGGACAGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGTATTCCGCTCTCCAACGGGGGTGGTGGTAGCACCA  130

Query  149  GCAGAAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGCCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAAAGGAGGAAAACACCA  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct  131  GCAGGAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGTCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAGCGAAGGAAAACACCA  204

Query  223  GGGCCCGTCCTCCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAATGAGATCAAGCCTGGTTTGCAGTACACACTCCTGTC  296
            |||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||.|||||
Sbjct  205  GGGCCTGTTCTGCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAACGAGATCAAACCTGGCTTACAGTACATGCTGCTGTC  278

Query  297  CCAGACTGGGCCCGTGCACGCGCCTTTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTGAATGGCCAGGTTTTTGAGGGCTCTG  370
            ||||||.||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  279  CCAGACAGGACCCGTGCATGCACCTCTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTAAACGGGCAGGTTTTTGAGGGCTCTG  352

Query  371  GTCCCACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCTTGAGGTCTTTCGTTCAGTTTCCTAATGCC  444
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct  353  GCCCTACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCCTGAGGTCTTTTGTCCAGTTTCCCAACGCC  426

Query  445  TCTGAGGCCCACCTGGCCATGGGGAGGACCCTGTCTGTCAACACGGACTTCACATCTGACCAGGCCGACTTCCC  518
            ||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  427  TCCGAGGCCCACCTAGCCATGGGAAGGACCCTCTCTGTGAACACAGACTTCACGTCTGACCAGGCTGACTTCCC  500

Query  519  TGACACGCTCTTCAATGGTTTTGAAACTCCTGACAAGGCGGAGCCTCCCTTTTACGTGGGCTCCAATGGGGATG  592
            ||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  501  TGACACACTCTTCAATGGCTTCGAGACTCCAGACAAGTCAGAGCCACCCTTCTACGTAGGCTCCAACGGGGATG  574

Query  593  ACTCCTTCAGTTCCAGCGGGGACCTCAGCTTGTCTGCTTCCCCGGTGCCTGCCAGCCTAGCCCAGCCTCCTCT-  665
            ||||.|||||.||.||.||.||..|||||.|.||.||.|||||.||||||||||||||..||||||||||||| 
Sbjct  575  ACTCGTTCAGCTCAAGTGGAGATGTCAGCCTATCGGCCTCCCCAGTGCCTGCCAGCCTTACCCAGCCTCCTCTG  648

Query  666  -CCCTGCCTTACCACCATTCCCACCCCCGAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAACGAACTGCGCCCAGGA  738
             ||.|.||  ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct  649  CCCATCCC--ACCACCATTCCCACCCCCAAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAATGAGCTACGCCCAGGG  720

Query  739  CTCAAGTATGACTTCCTCTCCGAGAGCGGGGAGAGCCATGCCAAGAGCTTCGTCATGTCTGTGGTCGTGGATGG  812
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  721  CTGAAGTATGACTTCCTCTCTGAGAGTGGGGAGAGCCACGCCAAGAGCTTCGTCATGTCCGTGGTGGTAGATGG  794

Query  813  TCAGTTCTTTGAAGGCTCGGGGAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCGCAGTCTGCCCTGGCCGCCA  886
            .|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|..
Sbjct  795  CCAGTTCTTTGAGGGCTCAGGAAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCACAGTCTGCCTTGGCTACTG  868

Query  887  TTTTTAACTTGCACTTGGATCAGACGCCATCTCGCCAGCCTATTCCCAGTGAGGGTCTTCAGCTGCATTTACCG  960
            |.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct  869  TCTTCAATTTGCACTTGGACCAAACACCATCTCGCCAGCCTGTCCTCAGTGAGGGTCTTCAGTTGCATTTGCCA  942

Query  961  CAGGTTTTAGCTGACGCTGTCTCACGCCTGGTCCTGGGTAAGTTTGGTGACCTGACCGACAACTTCTCCTCCCC  1034
            |||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  943  CAGGTATTGGCAGATGCTGTCTCCCGCCTGGTCCTGGGTAAGTTCAGTGACCTGACAGACAACTTTTCCTCCCC  1016

Query 1035  TCACGCTCGCAGAAAAGTGCTGGCTGGAGTCGTCATGACAACAGGCACAGATGTTAAAGATGCCAAGGTGATAA  1108
            |||.||.||.||.||||||||..|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1017  TCATGCACGAAGGAAAGTGCTCTCTGGAGTAGTGATGACCACAGGTACAGATGTCAAAGATGCCAAGGTGATAA  1090

Query 1109  GTGTTTCTACAGGAACAAAATGTATTAATGGTGAATACATGAGTGATCGTGGCCTTGCATTAAATGACTGCCAT  1182
            |||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.
Sbjct 1091  GTGTTTCGACAGGGACGAAGTGTATCAACGGTGAATACATGAGTGACCGTGGCCTCGCACTCAATGACTGCCAC  1164

Query 1183  GCAGAAATAATATCTCGGAGATCCTTGCTCAGATTTCTTTATACACAACTTGAGCTTTACTTAAATAACAAAGA  1256
            |||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1165  GCAGAGATAATCTCCCGAAGGTCCCTGCTCAGGTTTCTTTATGCACAGCTCGAGCTTTATTTAAATAACAAAGA  1238

Query 1257  TGATCA-AAAAAGATCCATCTTTCAGAAATCAGAGCGAGGGGGGTTTAGGCTGAAGGAGAATGTCCAGTTTCAT  1329
            .||.|| |||||| |||||.||||||||.||||||||.||.|||||..||||||||||.|..||.|||||.||.
Sbjct 1239  AGACCAGAAAAAG-TCCATATTTCAGAAGTCAGAGCGGGGTGGGTTCCGGCTGAAGGATACCGTGCAGTTCCAC  1311

Query 1330  CTGTACATCAGCACCTCTCCCTGTGGAGATGCCAGAATCTTCTCACCACATGAGCCAATCCTGGAAGAACCAGC  1403
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||.||||||||
Sbjct 1312  CTGTACATCAGCACCTCGCCCTGCGGAGACGCCAGAATATTCTCTCCCCACGAGCCCGTGCTAGAGGAACCAGC  1385

Query 1404  AGATAGACACCCAAATCGTAAAGCAAGAGGACAGCTACGGACCAAAATAGAGTCTGGTGAGGGGACGATTCCAG  1477
            |||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 1386  AGATAGACATCCGAATCGCAAAGCAAGGGGACAGCTACGGACGAAAATAGAGTCTGGCGAGGGGACAATCCCTG  1459

Query 1478  TGCGCTCCAATGCGAGCATCCAAACGTGGGACGGGGTGCTGCAAGGGGAGCGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGT  1551
            |||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460  TGCGCTCAAATGCCAGCATCCAGACCTGGGACGGGGTGCTGCAGGGGGAACGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGT  1533

Query 1552  GACAAGATTGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGATCCCTGCTCAGCATTTTCGTGGAGCCCATTTACTT  1625
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1534  GACAAGATAGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGGTCCCTGCTCAGCATTTTCGTGGAACCCATCTACTT  1607

Query 1626  CTCGAGCATCATCCTGGGCAGCCTTTACCACGGGGACCACCTTTCCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACA  1699
            |||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608  CTCCAGCATCATCTTGGGCAGCCTGTACCACGGGGACCACCTCTCCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACA  1681

Query 1700  TAGAGGACCTGCCACCTCTCTACACCCTCAACAAGCCTTTGCTCAGTGGCATCAGCAATGCAGAAGCACGGCAG  1773
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1682  TAGAGGACCTGCCACCGCTCTACACTCTCAACAAGCCCCTGCTCAGCGGCATCAGCAATGCAGAGGCACGGCAG  1755

Query 1774  CCAGGGAAGGCCCCCAACTTCAGTGTCAACTGGACGGTAGGCGACTCCGCTATTGAGGTCATCAACGCCACGAC  1847
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||.|.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1756  CCAGGGAAGGCACCCAACTTCAGTGTCAACTGGACAGTGGGTGACGCCACCATTGAGGTCATCAATGCCACAAC  1829

Query 1848  TGGGAAGGATGAGCTGGGCCGCGCGTCCCGCCTGTGTAAGCACGCGTTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTGCACG  1921
            .||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1830  AGGGAAGGATGAGCTTGGCCGCCCATCCCGCCTGTGTAAGCACGCGCTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTACACG  1903

Query 1922  GCAAGGTTCCCTCCCACTTACTACGCTCCAAGATTACCAAACCCAACGTGTACCATGAGTCCAAGCTGGCGGCA  1995
            |||||||||||.|||||.|.||.|||.|||||||.||.||.||.|.|...|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1904  GCAAGGTTCCCCCCCACCTGCTGCGCACCAAGATCACTAAGCCTACCACATACCACGAGTCCAAGCTGGCAGCG  1977

Query 1996  AAGGAGTACCAGGCCGCCAAGGCGCGTCTGTTCACAGCCTTCATCAAGGCGGGGCTGGGGGCCTGGGTGGAGAA  2069
            |.||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1978  AGGGAGTACCAGGCTGCCAAGGCCCGTCTGTTCACTGCCTTCATCAAGGCGGGGCTGGGCGCCTGGGTGGAGAA  2051

Query 2070  GCCCACCGAGCAGGACCAGTTCTCACTCACGCCC  2103
            ||||||.|||||||||||||||||..||||.|||
Sbjct 2052  GCCCACAGAGCAGGACCAGTTCTCCTTCACTCCC  2085