Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480405
- Subject:
- XM_006531241.3
- Aligned Length:
- 1977
- Identities:
- 1711
- Gaps:
- 24
Alignment
Query 1 ATGGTTTTGTACACGACCCCCTTTCCTAACAGCTGTCTGTCCGCCCTGCACTGTGTGTCCTGGGCCCTTATCTT 74
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||...||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGTTTTGTACACGACCCCCTTTCCTAATAGCTGTCTGTCTGCCCTCCACGCCGTGTCCTGGGCCCTCATCTT 74
Query 75 TCCATGCTACTGGCTGGTGGACCGGCTCGCT-GCCTCCTTCATACCCACCACCTACGAGAAGCGCCAGCGGGCA 147
.|||||.|||||||||||||||||||| |.| |||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 75 CCCATGTTACTGGCTGGTGGACCGGCT-GTTGGCCTCTTTCATACCCACCACCTATGAGAAGCGCCAGAGGGCA 147
Query 148 GACGACCCGTGCTGCCTGCAGCTGCTCTGCACTGCCCTCTTCACGCCCATCTACCTGGCCCTCCTGGTGGCCTC 221
||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||..||||||||||.||.||.|||||..|
Sbjct 148 GATGACCCCTGCTGCCTGCAGCTGTTCTGCACGGTCCTCTTCACGCCAGTCTACCTGGCTCTGCTTGTGGCTGC 221
Query 222 GCTGCCCTTTGCGTTTCTCGGCTTTCTCTTCTGGTCCCCACTGCAGTCGGCCCGCCGGCCCTACATCTATTCAC 295
.|||||||||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||..|||.||.|
Sbjct 222 ACTGCCCTTTGCCTTTCTCGGGTTCATCTTCTGGTCTCCACTGCAGTCTGCCCGCCGGCCCTACTCCTACTCCC 295
Query 296 GGCTGGAAGACAAGGGCCTGGCCGGTGGGGCAGCCCTGCTCAGTGAATGGAAGGGCACGGGGCCTGGCAAAAGC 369
||||.|||||||||..||..||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 296 GGCTAGAAGACAAGAACCCAGCTGGTGGGGCAGCCCTGCTTAGTGAATGGAAGGGCACGGGGGCAGGCAAAAGC 369
Query 370 TTCTGCTTTGCCACTGCCAACGTCTGCCTCCTGCCCGACTCACTCGCCAGGGTCAACAACCTTTTTAACACCCA 443
||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||.||||.||..|.||.|||||.||
Sbjct 370 TTTTGCTTCGCCACGGCCAATGTCTGCCTCCTCCCCGACTCACTCGCGAGGCTCAATAATGTGTTCAACACTCA 443
Query 444 AGCGCGGGCCAAGGAGATCGGGCAGAGAATCCGCAATGGGGCCGCCCGGCCCCAGATCAAAATTTACATCGACT 517
|||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 444 AGCTCGGGCCAAAGAGATTGGGCAGAGAATCCGCAATGGGGCCGCCAGGCCTCAGATCAAGATCTACATCGATT 517
Query 518 CCCCCACCAATACCTCCATCAGCGCCGCTAGCTTCAGCAGCCTGGTGTCACCACAGGGCGGCGATGGGGTGGCC 591
|.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||| ..||
Sbjct 518 CTCCCACCAACACCTCCATCAGTGCAGCCAGCTTCAGCAGCCTGGTGTCGCCACAGGGTGGTGATGG---ATCC 588
Query 592 CGGGCCGTCCCCGGGAGCATTAAGAGGACAGCCTCTGTGGAGTACAAGGGTGACGGTGGGCGGCACCCCGGTGA 665
.|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||.|.||
Sbjct 589 AGAGCTGTTCCTGGGAGCATTAAGAGGACAGCCTCTGTGGAATACAAGGGGGATGGTGGGCGTCACCCCAGCGA 662
Query 666 CGAGGCTGCCAACGGCCCAGCCTCTGGGGACC---CTGTCGACAGCAGCAGCCCGGAGGATGCCTGCATCGTGC 736
|||||||||||||||||||||||||||.||.| |||.|| |.||||..|||||...||||||.||||
Sbjct 663 CGAGGCTGCCAACGGCCCAGCCTCTGGAGAACAGGCTGACG------GAAGCCTTGAGGACAGCTGCATTGTGC 730
Query 737 GCATCGGTGGCGAGGAGGGCGGCCGGCCACCTGAAGCTGACGACCCTG-TGCCTGGGGGCCAGGCCAGGAACGG 809
|.||.|||||||||||.||.||.|||||||..||||||||.||||||| |||| |||.||||.||||||||.||
Sbjct 731 GAATTGGTGGCGAGGAAGGAGGTCGGCCACAAGAAGCTGATGACCCTGCTGCC-GGGAGCCAAGCCAGGAATGG 803
Query 810 AGCTGGCGGGGGCCCAAGGGGCCAGACGCCCAACCATAATCAGCAGGACGGGGATTCAGGGAGCCTGGGCAGCC 883
.|||||.|||..|||||.|||||||||.||||||||.|||||||..||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 804 GGCTGGTGGGACCCCAAAGGGCCAGACACCCAACCACAATCAGCGAGATGGGGATTCTGGGAGCCTGGGCAGCC 877
Query 884 CCTCGGCCTCCCGGGAGTCCCTGGTGAAGGGGCGAGCTGGGCCAGACACCAGTGCCAGCGGGGAGCCAGGTGCC 957
||||.||||||.||||||||.|||||||||..||.|||||||.|||||...|||.||||||.||||||||.||.
Sbjct 878 CCTCAGCCTCCAGGGAGTCCTTGGTGAAGGCACGGGCTGGGCAAGACAGTGGTGGCAGCGGAGAGCCAGGGGCT 951
Query 958 AACAGCAAGCTCCTGTACAAGGCCTCGGTGGTGAAGAAGGCGGCTGCACGCAGGAGGCGGCACCCCGACGAGGC 1031
|||||||||||.|||||.|||.||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 952 AACAGCAAGCTGCTGTATAAGACCTCTGTGGTGAAGAAGGCAGCAGCCCGCAGGAGGCGCCACCCTGATGAAGC 1025
Query 1032 CTTCGACCATGAGGTCTCCGCCTTCTTCCCCGCCAACCTGGACTTCCTGTGCCTGCAGGAGGTGTTTGACAAGC 1105
|||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026 CTTTGACCACGAGGTCTCAGCCTTCTTCCCGGCCAATCTGGACTTCCTGTGCCTGCAGGAGGTGTTTGACAAGC 1099
Query 1106 GAGCAGCCACCAAATTGAAAGAGCAGCTGCACGGCTACTTCGAGTACATCCTGTACGACGTCGGGGTCTACGGC 1179
|.||.||..|.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 1100 GTGCGGCTGCTAAGTTGAAAGAGCAGCTACACGGCTACTTCGAGTACATCCTGTATGATGTTGGGGTCTACGGT 1173
Query 1180 TGCCAGGGCTGCTGCAGCTTCAAGTGTCTCAACAGCGGCCTCCTCTTTGCCAGCCGCTACCCCATCATGGACGT 1253
||.||.||.|||||||..|||||.||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1174 TGTCATGGTTGCTGCAATTTCAAATGTCTCAACAGCGGTCTCTTCTTCGCCAGCCGCTACCCTGTCATGGACGT 1247
Query 1254 GGCCTATCACTGTTACCCCAACAAGTGTAACGACGATGCCCTGGCCTCTAAGGGAGCTCTGTTTCTCAAGGTGC 1327
|||||||||||||||||||||...|||.|.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248 GGCCTATCACTGTTACCCCAATGGGTGCAGCTTCGATGCCCTGGCCTCTAAGGGAGCTCTGTTTCTCAAGGTGC 1321
Query 1328 AGGTGGGAAGCACACCTCAGGACCAAAGAATCGTCGGGTACATCGCCTGCACACACCTGCATGCCCCGCAAGAG 1401
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1322 AGGTGGGAAGCACACCTCAGGACCAAAGAATTGTTGGGTACATCGCCTGCACACACCTGCATGCCCCACCAGAG 1395
Query 1402 GACAGCGCCATCCGGTGTGGGCAGCTGGACCTGCTTCAGGACTGGCTGGCTGATTTCCGAAAATCTACCTCCTC 1475
|||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396 GACAGTGCCGTCCGGTGTGAGCAGCTGGACCTGCTTCAGGACTGGCTGGCTGATTTCCGAAAATCTACCTCCTC 1469
Query 1476 GTCCAGCGCAGCCAACCCCGAGGAGCTGGTGGCATTTGACGTCGTCTGTGGAGATTTCAACTTTGATAACTGCT 1549
|.|||||.||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1470 GACCAGCACAGCCAACCCCGAGGAGCTGGTGGTGTTTGACGTCATCTGTGGAGATTTGAACTTTGATAACTGCT 1543
Query 1550 CCTCTGACGACAAGCTGGAGCAGCAACACTCCCTGTTCACCCACTACAGGGACCCCTGCCGCCTGGGGCCTGGT 1623
|.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|.|||||..||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1544 CTTCTGATGACAAACTGGAGCAGCAGCACTCGCTCTTTACTCGCTACAAAGACCCCTGCCGCCTTGGGCCCGGG 1617
Query 1624 GAGGAGAAGCCGTGGGCCATCGGTACTCTGCTGGACACGAACGGCCTGTACGATGAGGATGTGTGCACCCCCGA 1697
|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1618 GAGGAGAAGCCTTGGGCCATTGGCACCCTGCTGGACACAAACGGTCTCTATGATGAGGATGTGTGTACCCCGGA 1691
Query 1698 CAACCTGCAGAAGGTCCTGGAGAGTGAGGAGGGCCGCAGGGAGTACCTGGCGTTTCCCACCAGCAAGAGCTC-- 1769
||||||.||.|||||..|||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1692 CAACCTTCAAAAGGTGTTGGAGAGCGAGGAAGGCCGCAGGGAGTATCTGGCCTTCCCCACCAGCAAGAGCCCAG 1765
Query 1770 -----GGGCCAGAAGGGGCGGAAGGAGCTGCTGAAGGGCAACGGCCGGCGCATCGACTACATGCTGCATGCAGA 1838
||| ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1766 GTGCTGGG-CAGAAGGGCCGGAAGGATCTGCTGAAGGGCAATGGCCGCCGCATCGACTACATGCTGCACGCCGA 1838
Query 1839 GGAGGGGCTGTGCCCAGACTGGAAGGCCGAGGTGGAAGAATTCAGTTTTATCACCCAGCTGTCCGGCCTGACGG 1912
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1839 GGAGGGGCTGTGCCCTGACTGGAAGGCTGAGGTAGAAGAATTCAGTTTTATCACCCAGCTGTCCGGCCTGACCG 1912
Query 1913 ACCACCTGCCAGTAGCCATGCGACTGATGGTGTCTTCGGGGGAGGAGGAGGCA 1965
|||||||.||.||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||
Sbjct 1913 ACCACCTCCCCGTGGCCATGCGGCTGATGGTGTCTGCAGGGGAAGAGGAGGCA 1965